چاپ صفحه |  صفحه نخست سامانه |  نویسندگان |  اطلاعات تفضیلی |  دانلود مقاله | دانشگاه علوم پزشکی تبریز |
| نویسنده ثبت کننده مقاله | محمد مصطفی پورسیف |
| مرحله جاری مقاله | تایید نهایی |
| دانشکده/مرکز مربوطه | مرکز تحقیقات ریز فناوری دارویی |
| کد مقاله | 84553 |
| عنوان فارسی مقاله | تجزیه و تحلیل رونوشتام با کارایی بالا برای شناسایی آنتی ژن های هدف واکسن هلیکوباکتر پیلوری |
| عنوان لاتین مقاله | High-throughput transcriptome analysis for identification of Helicobacter pylori vaccine target antigens |
| نوع ارائه | پوستر |
| عنوان کنگره / همایش | سومین همایش بین المللی و دوازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران |
| نوع کنگره / همایش | بین المللی |
| کشور محل برگزاری کنگره/ همایش | Iran (Islamic Republic) |
| شهر محل برگزاری کنگره/ همایش | بهشهر |
| سال انتشار/ ارائه شمسی | 1402 |
| سال انتشار/ارائه میلادی | 2024 |
| تاریخ شمسی شروع و خاتمه کنگره/همایش | 1402/12/09 الی 1402/12/09 |
| آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت | https://icb12.ibis.org.ir/ |
| آدرس علمی (Affiliation) نویسنده متقاضی | Research Center for Pharmaceutical Nanotechnology, Biomedicine Institute, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran |
| نویسنده | نفر چندم مقاله |
|---|---|
| محمد مصطفی پورسیف | ششم |
| آیلار نخلبند | چهارم |
| امیر باجمانلو بالایی | اول |
| امیر عباس برزگری | دوم |
| نگار حسین نژاد دانشور | پنجم |
| فاطمه خدیوی درخشان | سوم |
| عنوان | متن |
|---|---|
| خلاصه مقاله | Helicobacter pylori (Hp), a Gram-negative bacterium, establishes enduring colonization in the human stomach by inducing immunoregulatory responses [1]. Due to its involvement in chronic gastritis, peptic ulcers, and gastric cancer, researchers aim to prevent these conditions through novel, safe, and highly effective vaccines [2]. Microarray and RNA-seq techniques play crucial roles in aiding vaccinologists to identify novel vaccine-targeted antigens contributing significantly to the pathogenesis of various pathogens. In this study, we analyze microarray (GSE60427 and GSE123623) and RNA-seq (GSE164216) datasets from the NCBI GEO database. After quality control using R program Bioconductor packages, principal component analysis assesses sample uniformity within each dataset. The Limma package conducts statistical analysis, and a Venn diagram identifies common differentially expressed virulence genes (DEVGs). Kaplan-Meier plotter assesses the correlation between gene expression and survival outcomes. High-throughput transcriptome analysis of 48 samples reveals 24 significantly upregulated and 23 downregulated genes (adj.P.val < 0.01 and |log2 FC| > 2). Top less-annotated genes (HP1167 and HP1440) were identified in the upregulated list, and (HP1588 and HP0415) in the downregulated list, with predicted key roles in bacterial pathogenicity, proposing them as notable vaccine antigens. Genes like dppA, gpsA, pdxJ, rnhB, tagD (downregulated), and flgK, flaA, cag7, fliD, flag (upregulated) were discovered as known antigens in bacterial invasion pathways. GeneCards and KEGG pathway databases indicate their significant molecular function in pathogenicity-related pathways, suggesting them as vaccine targets in subsequent in silico and experimental studies. This study not only provides valuable insights into the molecular signatures associated with Hp’s pathogenicity but also highlights their potential for developing prophylactic interventions in clinical settings. |
| کلمات کلیدی | Antigen; Helicobacter pylori; Microarray; RNA-seq; Transcriptome; Vaccine. |
| نام فایل | تاریخ درج فایل | اندازه فایل | دانلود |
|---|---|---|---|
| BookletFinalFileFinalFileFinal.pdf | 1403/03/30 | 12128587 | دانلود |
| Certificate15016 (2).pdf | 1403/02/05 | 412255 | دانلود |
| Certificate15016.pdf | 1403/02/05 | 307191 | دانلود |
