چاپ صفحه |  صفحه نخست سامانه |  نویسندگان |  اطلاعات تفضیلی |  دانلود مقاله | دانشگاه علوم پزشکی تبریز |
| نویسنده ثبت کننده مقاله | محمد مصطفی پورسیف |
| مرحله جاری مقاله | تایید نهایی |
| دانشکده/مرکز مربوطه | مرکز تحقیقات ریز فناوری دارویی |
| کد مقاله | 84551 |
| عنوان فارسی مقاله | تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک داده های ریزآرایه برای شناسایی ژن های کلیدی به عنوان نشانگرهای زیستی جدید تشخیص سرطان کولورکتال |
| عنوان لاتین مقاله | Bioinformatics Analysis of Microarray Data to Identify Hub Genes As Novel Biomarkers for Colorectal Cancer |
| نوع ارائه | پوستر |
| عنوان کنگره / همایش | سومین همایش بین المللی و دوازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران |
| نوع کنگره / همایش | بین المللی |
| کشور محل برگزاری کنگره/ همایش | Iran (Islamic Republic) |
| شهر محل برگزاری کنگره/ همایش | بهشهر |
| سال انتشار/ ارائه شمسی | 1402 |
| سال انتشار/ارائه میلادی | 2024 |
| تاریخ شمسی شروع و خاتمه کنگره/همایش | 1402/12/09 الی 1402/12/10 |
| آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت | https://icb12.ibis.org.ir/ |
| آدرس علمی (Affiliation) نویسنده متقاضی | Research Center for Pharmaceutical Nanotechnology, Biomedicine Institute, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran |
| نویسنده | نفر چندم مقاله |
|---|---|
| آناهیتا سلیمانی | اول |
| محمد مصطفی پورسیف | پنجم |
| اکبر امیرفیروزی | ششم |
| محمود شکاری خانیانی | هفتم |
| صبا هادی | دوم |
| سید حسین خوش رفتار | سوم |
| پریسا علیرضایی نجف آبادی | چهارم |
| عنوان | متن |
|---|---|
| خلاصه مقاله | Abstract: Colorectal cancer (CRC) is the third most common cancer and the second cause of cancer- related death worldwide [1,2]. As early detection is associated with lower mortality, novel biomarkers are urgently needed for timely diagnosis. This study aimed to identify hub genes as CRC biomarkers by analyzing differentially expressed genes (DEGs). Methods: The GSE113513 dataset was obtained from the GEO database, consisting of 14 pairs of CRC primary lesions and non-cancerous surrounding tissue. Principal Component Analysis (PCA) assessed the sample consistency. LIMMA package was used for statistical analysis. DEGs were identified using | 𝑙𝑙𝑙𝑙𝑙𝑙 2 𝐹𝐹𝐹𝐹 |> 3 and adj P-value < 0.05. Gene expression and survival outcomes correlation were determined by the Kaplan-Meier plotter. Results: The expression profiles of 28 samples were evaluated using microarray analysis. There were 110 DEGs found in all, with 93 being down-regulated and 17 being up-regulated. Among these DEGs, two genes, MMP7 and CDH3, have been previously linked to various cancers such as breast, lung, pancreatic, etc. In this dataset, these genes exhibited a significant increase in their expression. As per the information available in GeneCards, WikiPathways, and Reactome pathway databases, these genes regulate crucial pathways, including the Wnt signaling pathway, pluripotency, cell-cell communication, and ILK signaling. The DEGs identified in this study were found to be correlated with poor prognosis in colorectal cancer based on the Kaplan-Meier plots. Conclusion: The findings of our investigation indicate that the genes MMP7 and CDH3 have significant contributions to colorectal cancer (CRC) and are connected to a poor prognosis in CRC. |
| کلمات کلیدی | Colorectal Cancer; Biomarker; Microarray |
| نام فایل | تاریخ درج فایل | اندازه فایل | دانلود |
|---|---|---|---|
| BookletFinalFileFinalFileFinal.pdf | 1403/03/21 | 12126047 | دانلود |
| Certificate15037 (2).pdf | 1403/02/05 | 412035 | دانلود |
| Certificate15037.pdf | 1403/02/05 | 307734 | دانلود |
