ژنهای FN1، COMP و CXCL5 به عنوان بیومارکرهای تشخیصی برای سرطان پانکراس عمل می کنند، همانطور که از طریق آنالیز داده های مایکرواری نشان داده شده است

FN1, COMP, and CXCL5, serve as diagnostic biomarkers for pancreatic cancer, as revealed through analysis of microarray data


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
نویسندگان
نویسندگان
اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: پریسا علیرضایی نجف آبادی , آناهیتا سلیمانی , محمد مصطفی پورسیف , سید حسین خوش رفتار , صبا هادی

عنوان کنگره / همایش: سومین همایش بین المللی و دوازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران , Iran (Islamic Republic) , مازندران، بهشهر , 2024

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله محمد مصطفی پورسیف
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات ریز فناوری دارویی
کد مقاله 84547
عنوان فارسی مقاله ژنهای FN1، COMP و CXCL5 به عنوان بیومارکرهای تشخیصی برای سرطان پانکراس عمل می کنند، همانطور که از طریق آنالیز داده های مایکرواری نشان داده شده است
عنوان لاتین مقاله FN1, COMP, and CXCL5, serve as diagnostic biomarkers for pancreatic cancer, as revealed through analysis of microarray data
نوع ارائه پوستر
عنوان کنگره / همایش سومین همایش بین المللی و دوازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران
نوع کنگره / همایش بین المللی
کشور محل برگزاری کنگره/ همایش Iran (Islamic Republic)
شهر محل برگزاری کنگره/ همایش مازندران، بهشهر
سال انتشار/ ارائه شمسی 1402
سال انتشار/ارائه میلادی 2024
تاریخ شمسی شروع و خاتمه کنگره/همایش 1402/12/09 الی 1402/12/10
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت
آدرس علمی (Affiliation) نویسنده متقاضی Research Center for Pharmaceutical Nanotechnology, Biomedicine Institute, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
پریسا علیرضایی نجف آبادیاول
آناهیتا سلیمانیچهارم
محمد مصطفی پورسیفپنجم
سید حسین خوش رفتاردوم
صبا هادیسوم

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
خلاصه مقالهAbstract: Introduction Pancreatic cancer (PC) is a malignancy with few warning signs before the disease reaches its final stages. Currently, the early diagnosis of PC is very difficult because most patients have non-specific symptoms, which leads to delaying the correct diagnosis. In this study, an attempt was made to discover biomarkers based on differentially expressed genes (DEGs) that can act as a driving factor in tumorigenesis. Methods At the beginning of the study, datasets related to Microarray data extracted by using the GEO database. In the following, quality control was checked with PCA. Subsequently, the LIMMA package was utilized to identified DEGs. Furthermore, the TCGA RNA-seq results were employed to validate our findings. Then to identify biological processes and pathways in which genes with differential expression are involved. GeneCards and Reactome databases were used. Lastly, the relationship between the DEGs and survival time of the disease was assessed using the Kaplan-Meier plotter. Results: In the studied data set, a number of genes have significant differential expression (adj.P.val <0.05, Log2FC>3). Among them, three genes FN1, COMP, CXCL5, had increased expression. Then, using the information available in GeneCards and Reactome databases, these genes had regulatory control over vital pathways, including PI3K-Akt-mTOR, cellular immune pathways. And the differential rate has been confirmed by different graphs. Conclusion: This study led to the identification of three genes with increased expression in pancreatic cancer and potentially capable of early detection of this disease.
کلمات کلیدیPancreatic cancer; biomarker; microarray

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
Certificate1501 (2).pdf1403/02/05412137دانلود
Certificate1501.pdf1403/02/05307192دانلود
BookletFinalFileFinalFileFinal.pdf1403/03/0513672261دانلود