شناسایی و تجزیه و تحلیل ژن های اساسی زمینه ساز سرطان معده از طریق تکنیک های بیوانفورماتیک

Identification and Analysis of Crucial Genes Underlying Gastric Cancer via Bioinformatics Techniques


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
نویسندگان
نویسندگان
اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: سید حسین خوش رفتار , صبا هادی , پریسا علیرضایی نجف آبادی , آناهیتا سلیمانی , اکبر امیرفیروزی , محمد مصطفی پورسیف

عنوان کنگره / همایش: 3rd International & 12th Iranian Conference on Bioinformatics , Iran (Islamic Republic) , مازندران، بهشهر , 2024

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله محمد مصطفی پورسیف
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات ریز فناوری دارویی
کد مقاله 84492
عنوان فارسی مقاله شناسایی و تجزیه و تحلیل ژن های اساسی زمینه ساز سرطان معده از طریق تکنیک های بیوانفورماتیک
عنوان لاتین مقاله Identification and Analysis of Crucial Genes Underlying Gastric Cancer via Bioinformatics Techniques
نوع ارائه سخنرانی
عنوان کنگره / همایش 3rd International & 12th Iranian Conference on Bioinformatics
نوع کنگره / همایش بین المللی
کشور محل برگزاری کنگره/ همایش Iran (Islamic Republic)
شهر محل برگزاری کنگره/ همایش مازندران، بهشهر
سال انتشار/ ارائه شمسی 1402
سال انتشار/ارائه میلادی 2024
تاریخ شمسی شروع و خاتمه کنگره/همایش 1402/12/09 الی 1402/12/10
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت https://icb12.ibis.org.ir/
آدرس علمی (Affiliation) نویسنده متقاضی Department of Genetics, Faculty of Medicine, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
سید حسین خوش رفتاراول
صبا هادیسوم
پریسا علیرضایی نجف آبادیدوم
آناهیتا سلیمانیچهارم
اکبر امیرفیروزیششم
محمد مصطفی پورسیفهفتم

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
کلمات کلیدیGastric Cancer; Biomarker; Microarray; Bioinformatics Analysis
خلاصه مقالهIntroduction: Gastric cancer (GC) has become a significant concern globally, particularly in East Asian nations, in recent times. According to the GLOBOCAN database, GC is the fourth most common cancer and the third leading cause of cancer-related deaths worldwide. This study aimed to explore biomarkers based on differentially expressed genes (DEGs) that may act as a driver factor in tumorigenesis. Two sets (400 samples) of data were obtained from the GEO database, and each of these sets underwent quality analysis through the application of PCA. Subsequently, the LIMMA package was utilized to identify genes that exhibited differential expression. To determine the common DEGs between them, a Venn diagram was employed. Furthermore, the TCGA RNA-seq results were employed to validate our findings. Lastly, the relationship between the DEGs and the survival time of the disease was assessed using the Kaplan-Meier plotter. In two datasets, 14 genes were found to be significantly dysregulated (adj.P.val < 0.05). Among them, three genes ATP4A, ESRRG, and ADIPOQ show a significant decrease in expression in both datasets. Based on the information provided by the GeneCards and Reactome pathway databases, these genes exert regulatory control over various crucial pathways, including Ion channel transport, Nuclear Receptor transcription pathway, and AMPK Signaling Pathway. According to Kaplan-Meier plots DEGs are correlated with poor prognosis in GC. Our investigation revealed that the three genes ATP4A, ESRRG, and ADIPOQ play significant roles in GC and they are correlated with poor prognosis in GC.

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
template-word-1.docx1403/02/03301034دانلود
Certificate1151(1).pdf1403/02/03407680دانلود
BookletFinalFileFinalFileFinal.pdf1403/03/0513672261دانلود