Exploiting systems biology to investigate the gene modules and drugs in ovarian cancer: A hypothesis based on the weighted gene co-expression network analysis

Exploiting systems biology to investigate the gene modules and drugs in ovarian cancer: A hypothesis based on the weighted gene co-expression network analysis


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
چکیده مقاله
چکیده مقاله
نویسندگان
نویسندگان
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: بهزاد برادران , دریا جوادرشید , افشین درخشانی , مهدی عبدلی شادباد , ندا جلیلی تبریزی

کلمات کلیدی: Ovarian cancer ;Transcriptome analysis; WGCNA; Biomarker

نشریه: 4715 , 2022 , 146 , 2022

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله بهزاد برادران
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات ایمونولوژی
کد مقاله 77848
عنوان فارسی مقاله Exploiting systems biology to investigate the gene modules and drugs in ovarian cancer: A hypothesis based on the weighted gene co-expression network analysis
عنوان لاتین مقاله Exploiting systems biology to investigate the gene modules and drugs in ovarian cancer: A hypothesis based on the weighted gene co-expression network analysis
ناشر 14
آیا مقاله از طرح تحقیقاتی و یا منتورشیپ استخراج شده است؟ بلی
عنوان نشریه (خارج از لیست فوق)
نوع مقاله Original Article
نحوه ایندکس شدن مقاله ایندکس شده سطح یک – ISI - Web of Science
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت

خلاصه مقاله
hide/show

Background: Ovarian cancer (OC) is one of the worrisome gynecological cancers worldwide. Given its consid- erable mortality rate, it is necessary to investigate its oncogenesis. Methods: In this study, we used systems biology approaches to describe the key gene modules, hub genes, and regulatory drugs associated with serous OC as the novel biomarkers using weighted gene co-expression network analysis (WGCNA). Findings: Our findings have demonstrated that the blue module genes (r = 0.8, p-value = 1e-16) are involved in OC progression. Based on gene enrichment analysis, the genes in this module are frequently involved in bio- logical processes such as the Cyclic adenosine monophosphate (cAMP) signaling pathway and the cellular response to transforming growth factor-beta stimulation. The co-expression network has been built using the correlated module’s top hub genes, which are ADORA1, ANO9, CD24P4, CLDN3, CLDN7, ELF3, KLHL14, PRSS8, RASAL1, RIPK4, SERINC2, and WNT7A. Finally, a drug-target network has been built to show the interaction of the FDA-approved drugs with hub genes. Conclusions: Our results have discovered that ADORA1, ANO9, SERINC2, and KLHL14 are hub genes associated with serous OC. These genes can be considered as novel candidate target genes for treating OC.

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
بهزاد برادرانسوم
دریا جوادرشیدچهارم
افشین درخشانیپنجم
مهدی عبدلی شادبادهفتم
ندا جلیلی تبریزینهم

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
589-Exploiting systems biology to investigate the gene modules and drugs in ovarian cancer A hypothesis based on the weighted gene co-expression network analysis.pdf1400/10/255421174دانلود