ارائه ی روشی جدید برای کشف نشانگرهای زیستی پیش آگاهی دهنده در سرطان ریه

Developing a novel algorithm to identify diagnostic biomarkers in lung cancer


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
چکیده مقاله
چکیده مقاله
نویسندگان
نویسندگان
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: یوسف مسعودی سبحان زاده

کلمات کلیدی: دادههای بیان ژن سرطان ریه الگوریتم رقابت جهانی ماشین بردار پشتبان نشانگر زیستی یادگیری ماشین

نشریه: 0 , 1 , 16 , 2021

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله یوسف مسعودی سبحان زاده
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات ریز فناوری دارویی
کد مقاله 76361
عنوان فارسی مقاله ارائه ی روشی جدید برای کشف نشانگرهای زیستی پیش آگاهی دهنده در سرطان ریه
عنوان لاتین مقاله Developing a novel algorithm to identify diagnostic biomarkers in lung cancer
ناشر 3
آیا مقاله از طرح تحقیقاتی و یا منتورشیپ استخراج شده است؟ بلی
عنوان نشریه (خارج از لیست فوق) ژنتیک نوین
نوع مقاله Original Article
نحوه ایندکس شدن مقاله ایندکس شده سطح چهار – ISC - Islamic Science Citation
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت

خلاصه مقاله
hide/show

امروزه رویکردهای یادگیری ماشین به‌طور گسترده‌ای در تجزیه و تحلیل داده‌های حجیم استفاده می‌شود. با توجه به فناوری جدید و تولید داده‌های با بازده بالا در زیست شناسی (مانند داده‌های تعیین توالی نسل جدید)، استفاده از روش یادگیری ماشین بر روی داده‌های بزرگ بیولوژیکی می‌تواند به درک مکانیسم بیماری پیچیده مانند سرطان کمک کند. استخراج ژن‌های کاندیدا به‌عنوان یک هدف درمانی یا نشانگرهای زیستی از داده‌های بیولوژیکی حجیم مانند داده‌های بیان ژن را می‌توان به‌عنوان اولین مرحله در درمان سرطان در نظر گرفت. بنابراین، توسعه یک رویکرد کارآمد برای تجزیه و تحلیل چنین داده‌هایی نقشی اساسی در بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی محاسباتی دارد. در این مقاله، ما با اعمال الگوریتم رقابت جهانی و ماشین بردار پشتیبان بر روی داده‌های بیان ژن مربوط به سرطان ریه تلاش کرده‌ایم ژن‌های مرتبط با سرطان ریه را به‌عنوان نشانگرهای زیستی بالقوه کشف کنیم. داده‌های مورد استفاده، داده‌های به‌دست آمده از تکنولوژی RNA-Seq و مربوط به نمونه‌های سرطان ریه و همین‌طور نمونه‌های بافت سالم هستند که از پایگاه داده‌ی TCGA دریافت شده‌اند. این داده‌های شامل بیان ژن‌های mRNA در نمونه‌های بافت سرطانی و سالم می‌باشند. نتایج بررسی منجر به کشف ژن‌های با اهمیتی شد که با توجه به مقالات قبلی منتشر شده نقش مهمی در شکل‌گیری سرطان دارند و نقش آن‌ها در شکل‌گیری سرطان ریه را نیز می‌تواند در مطالعات آینده مورد بررسی قرار داد. همچنین نتایج اعتبار سنجی روش پیشنهادی نشان دهنده‌ی قدرت روش‌های مبتنی بر یادگیری ماشین در تحلیل داده‌هایی بیان ژن هستند.

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
یوسف مسعودی سبحان زادهدوم

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
Farsi.pdf1400/04/26432603دانلود