Comparing IS6110-RFLP, PGRS-RFLP and IS6110-Mtb1/Mtb2 PCR methods for genotyping of Mycobacterium tuberculosis isolates

Comparing IS6110-RFLP, PGRS-RFLP and IS6110-Mtb1/Mtb2 PCR methods for genotyping of Mycobacterium tuberculosis isolates


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
چکیده مقاله
چکیده مقاله
نویسندگان
نویسندگان
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: خلیل انصارین , لیلا صاحبی , یونس آفتابی , مجید خلیلی , مریم سیدی

کلمات کلیدی: detection; diversity; genotyping; molecular epidemiology; mycobacteria.

نشریه: 16982 , 4 , 129 , 2020

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله مریم سیدی
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات سل و بیماری های ریوی
کد مقاله 75920
عنوان فارسی مقاله Comparing IS6110-RFLP, PGRS-RFLP and IS6110-Mtb1/Mtb2 PCR methods for genotyping of Mycobacterium tuberculosis isolates
عنوان لاتین مقاله Comparing IS6110-RFLP, PGRS-RFLP and IS6110-Mtb1/Mtb2 PCR methods for genotyping of Mycobacterium tuberculosis isolates
ناشر 5
آیا مقاله از طرح تحقیقاتی و یا منتورشیپ استخراج شده است؟ بلی
عنوان نشریه (خارج از لیست فوق)
نوع مقاله Original Article
نحوه ایندکس شدن مقاله ایندکس شده سطح یک – ISI - Web of Science
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت

خلاصه مقاله
hide/show

Aims: Tuberculosis (TB) is still an important disease in the world, especially in developing countries. Applying efficient and suitable methods for genotyping Mycobacterium tuberculosis (MTB) isolates is a crucial step for identifying the MTB transmission mode and controlling its subsequent outcomes. Considering the complexity of IS6110-RFLP and PGRS-RFLP methods for MTB classification, suggesting other simple but reliable techniques could be helpful in the MTB studies, especially in low-income countries. Methods and results: This study aimed to evaluate the capabilities of three methods for genotyping MTB isolates collected from Iran through comparing our previously published results for IS6110-RFLP and PGRS-RFLP methods and current results obtained from IS6110-Mtb1/Mtb2 PCR technique. A strong concordance was observed between the results of clustering by three techniques. Calculated Kendall's Tau concordance value for correlation of IS6110-RFLP and IS6110-Mtb1/Mtb2 PCR, for IS6110-RFLP and PGRS-RFLP, and for IS6110-Mtb1/Mtb2 PCR and PGRS-RFLP techniques was equal to 0·943, 0·898 and 0·85 respectively. Conclusions: A strong correlation between IS6110-Mtb1/Mtb2 PCR, and IS6110-RFLP and PGRS-RFLP methods was observed and therefore IS6110-Mtb1/Mtb2 PCR discriminates MTBs capably. Significance and impact of the study: The study showed that IS6110-Mtb1/Mtb2 PCR, which is a simple and economical MTB genotyping approach, could be a more appropriate method to be applied in the low-budget research programmes.

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
خلیل انصاریناول
لیلا صاحبیدوم
یونس آفتابیسوم
مجید خلیلیچهارم
مریم سیدیپنجم

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
Ansarin et al.pdf1400/03/011511616دانلود