شناسایی لوکوس های عملکردی متیله شده CpG در پروموتر PD-L1 به عنوان نشانگرهای زیستی اپی ژنتیک جدید برای سرطان معده

Identifcation of functional methylated CpG loci in PD-L1 promoter as the novel epigenetic biomarkers for primary gastric cancer


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
چکیده مقاله
چکیده مقاله
نویسندگان
نویسندگان
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: محمد امینی , مریم حجازی , بهزاد برادران , امیر علی مختارزاده

کلمات کلیدی: PD-L1 Immune checkpoint DNA methylation Biomarker Gastric cancer

نشریه: 12516 , 2021 , 772 , 2021

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله امیر علی مختارزاده
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات ایمونولوژی
کد مقاله 75483
عنوان فارسی مقاله شناسایی لوکوس های عملکردی متیله شده CpG در پروموتر PD-L1 به عنوان نشانگرهای زیستی اپی ژنتیک جدید برای سرطان معده
عنوان لاتین مقاله Identifcation of functional methylated CpG loci in PD-L1 promoter as the novel epigenetic biomarkers for primary gastric cancer
ناشر 5
آیا مقاله از طرح تحقیقاتی و یا منتورشیپ استخراج شده است؟ بلی
عنوان نشریه (خارج از لیست فوق)
نوع مقاله Original Article
نحوه ایندکس شدن مقاله ایندکس شده سطح یک – ISI - Web of Science
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت

خلاصه مقاله
hide/show

Gastric cancer (GC) is considered one of the most lethal malignancies worldwide due to poor prognosis. Aberrant methylation has been demonstrated to be involved in PD-L1 dysregulated expression in human cancers and possesses a great value as a diagnostic biomarker. Given that, in this study, we investigated the methylation status of PD-L1 as a promising biomarker in primary gastric tumors and identifed functional CpG loci undergoing aberrant methylation through tumorigenesis of GC. PD-L1 methylation was initially evaluated in-silico using TCGA-STAD dataset. Pearson’s correlation analysis was further employed to identify the most signifcant functional methylated CpG loci of PD-L1 gene in TCGA-STAD patient cohort. Methylation status and its correlation with PD-L1 expression were also validated using q-MSP and qRT-PCR in a set of internal samples, including 25 paired primary gastric tumors and adjacent normal tissues. The obtained results from TCGA-STAD showed that PD-L1 is signifcantly hypermethylated through gastric tumorigenesis, mostly in two CpG loci overlapping with cg19724470 and cg15837913 probes. Besides, PD-L1 DNA methylation was negatively correlated with PD-L1 expression in tumor samples. Furthermore, hypermethylation of cg19724470 and cg15837913 regions was validated in primary gastric tumors compared to adjacent normal samples. Also, ROC curve analysis illustrated the high diagnostic value of PD-L1 methylation for early detection of GC (AUC = 0.8110). In conclusion, the fndings of this study suggested that PD-L1 expression is regulated by methylation in functional CpG loci and its methylation could be considered as a valuable diagnostic target for GC.

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
محمد امینیاول
مریم حجازیدوم
بهزاد برادرانپنجم
امیر علی مختارزادهچهارم

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
methylated CpG loci in PD-L1.pdf1400/01/101848881دانلود