پیشگویی اپی توپ های T MHC های کلاس I و II مربوط به آنتی ژن 14-3-3 انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس (سویه بومی ایران) با استفاده از الگوریتم های IEDB و TmhcPred

Prediction of T-cell MHC class I and II epitopes for Echinococcus granulosus 14-3-3 antigen (Iran isolate) using IEDB and TmhcPred algorithms


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
نویسندگان
نویسندگان
اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: محمد مصطفی پورسیف , یداله امیدی

عنوان کنگره / همایش: چهاردهمین کنگره سراسری بیوشیمی ایران (مبانی مولکولی تشخیص و درمان بیماری ها) , Iran (Islamic Republic) , تهران , 2017

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله محمد مصطفی پورسیف
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات ریز فناوری دارویی
کد مقاله 75013
عنوان فارسی مقاله پیشگویی اپی توپ های T MHC های کلاس I و II مربوط به آنتی ژن 14-3-3 انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس (سویه بومی ایران) با استفاده از الگوریتم های IEDB و TmhcPred
عنوان لاتین مقاله Prediction of T-cell MHC class I and II epitopes for Echinococcus granulosus 14-3-3 antigen (Iran isolate) using IEDB and TmhcPred algorithms
نوع ارائه پوستر
عنوان کنگره / همایش چهاردهمین کنگره سراسری بیوشیمی ایران (مبانی مولکولی تشخیص و درمان بیماری ها)
نوع کنگره / همایش ملی
کشور محل برگزاری کنگره/ همایش Iran (Islamic Republic)
شهر محل برگزاری کنگره/ همایش تهران
سال انتشار/ ارائه شمسی 1395
سال انتشار/ارائه میلادی 2017
تاریخ شمسی شروع و خاتمه کنگره/همایش 1395/05/26 الی 1395/05/28
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت https://www.conferenceyab.ir/10420/conferences/congress-medicine-and-health/fourteenth-congress-of-iran-biochemistry
آدرس علمی (Affiliation) نویسنده متقاضی Research Center for Pharmaceutical Nanotechnology, Biomedicine Institute, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
محمد مصطفی پورسیفاول
یداله امیدیسوم

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
خلاصه مقالهمقدمه اکینوکوکوس گرانولوزوس عامل عفونی بیماری کیست هیداتید است که از یک سو نظام بهداشت و درمان کشور و از سوی دیگر توسعه صنایع دامپروری را با مشکالت عدیدهای مواجه کرده است. مزیت نسبی مولکوالر واکسن های نسل جدید نسبت به استراتژیهای کنترل و درمان رایج )همچون داروهای ضد انگل و جراحی( باعث شده تا توجه به واکسنهای ضد انگل در سالهای اخیر روز به روز بیشتر گردد. این پاتوژن انگلی جزو بیماریهای مشترک بین انسان و عمدتا سگ و گوسفند است. ایده استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک برای طراحی هوشمندانهتر و در عین مقرون به صرفهتر واکسنهای اپی- توپیک میتواند طراحی واکسن را با علم به اطالعات ایمونولوژیک و بیوتکنولوژیک در سطح silico in مهندسی کند. در این مطالعه قصد داریم اپیتوپهای T مربوط به MHCهای کالس I و II آنتیژن 3-3-14 ایزوله ایرانی انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس را برای طراحی واکسنی پلیتوپیک مورد پیشگویی قرار دهیم. مواد و روشها پروتواسکولکسهای انگل مذکور از کبد و ریه گوسفندان کشتارگاه تبریز آسپیره شدند. نمونه DNA استخراج شده از پروتواسکولکسها به همراه پرایمرهای اختصاصی مستقیم )ATGTCTTCTCTCAGTAAGCGCGA )و معکوس )ATCGGCTTTCGGCGGTTCAG )طراحی شده براساس توالی آنتیژن 3-3-14 موجود در NCBI( کد دسترسی؛ AY942149 )مورد واکنش زنجیرهای پلیمراز )PCR )قرار گرفتند. سپس محصول PCR توالییابی شده و in silico آنالیزهای برای( Protein GenBank: AMX81438( NCBI در ثبت ضمن بومی 14-3-3 آنتیژن سکانس مورد استفاده قرار گرفت. پیشگویی اپیتوپ T برای آنالیز اتصال پپتیدها با مولکولهای MHC کالس I و II از طریق الگوریتمهای سرورهای IEDBو TmhcPred انجام گرفت )جزئیات سازه واکسن طراحی شده به همراه آزمایشات بالینی در مقاله کامل پژوهشی گزارش خواهد شد(. یافتهها ادغام نتایج سرورهای مورد استفاده از این قرار است؛ پپتیدهای 0تایی شامل LLSVAYKNV ،DMQTTHPIR و IMQLLRDNLبا باالترین میل اتصال به آلل MHCH2Db کالس Iموش c/BALB و اپیتوپهای HPIRLGLAL و DDAVAELDT به عنوان پپتیدهایی که حداکثر شمار آللهای Kd-H2 را پوشش دادند بدست آمدند. در ارتباط با MHC کالس II هم بیشترین میل اتصال در مورد اپیتوپهای SVAYKNVVGARRSSW ، FLKMKGDYYRYVAEF و TLIMQLLRDNLTLWN مشاهده شد. بحث و نتیجهگیری آنالیزهای silico in در این مطالعه برای نخستین بار اطالعاتی را در مورد اپیتوپهای cell-T آنتیژن 3-3-14 بومی ایران نشان دادند و با توجه به اهمیت این آنتیژن در سیکل زندگی انگل مذکور میتوان امیدوار بود که سازه واکسن طراحی شده بر مبنای این اپیتوپها با نتایج جالب توجهی در خصوص اثربخشی این واکسن بر روی موشهای آزمایشگاهی و نهایتا میزبانهای طبیعی این انگل همراه باشد.
کلمات کلیدیطراحی واکسن، اکینوکوکوس گرانولوزوس، اپی توپ، MHC کلاس I و II ،آنالیز in silico

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
Congress Booklet.pdf1399/11/1215074976دانلود
CertificateEG95_14-3-3.jpg1399/11/1255902دانلود