| نویسنده ثبت کننده مقاله | محمد مصطفی پورسیف |
| مرحله جاری مقاله | تایید نهایی |
| دانشکده/مرکز مربوطه | مرکز تحقیقات ریز فناوری دارویی |
| کد مقاله | 75013 |
| عنوان فارسی مقاله | پیشگویی اپی توپ های T MHC های کلاس I و II مربوط به آنتی ژن 14-3-3 انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس (سویه بومی ایران) با استفاده از الگوریتم های IEDB و TmhcPred |
| عنوان لاتین مقاله | Prediction of T-cell MHC class I and II epitopes for Echinococcus granulosus 14-3-3 antigen (Iran isolate) using IEDB and TmhcPred algorithms |
| نوع ارائه | پوستر |
| عنوان کنگره / همایش | چهاردهمین کنگره سراسری بیوشیمی ایران (مبانی مولکولی تشخیص و درمان بیماری ها) |
| نوع کنگره / همایش | ملی |
| کشور محل برگزاری کنگره/ همایش | Iran (Islamic Republic) |
| شهر محل برگزاری کنگره/ همایش | تهران |
| سال انتشار/ ارائه شمسی | 1395 |
| سال انتشار/ارائه میلادی | 2017 |
| تاریخ شمسی شروع و خاتمه کنگره/همایش | 1395/05/26 الی 1395/05/28 |
| آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت | https://www.conferenceyab.ir/10420/conferences/congress-medicine-and-health/fourteenth-congress-of-iran-biochemistry |
| آدرس علمی (Affiliation) نویسنده متقاضی | Research Center for Pharmaceutical Nanotechnology, Biomedicine Institute, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran |
| نویسنده | نفر چندم مقاله |
|---|---|
| محمد مصطفی پورسیف | اول |
| یداله امیدی | سوم |
| عنوان | متن |
|---|---|
| خلاصه مقاله | مقدمه اکینوکوکوس گرانولوزوس عامل عفونی بیماری کیست هیداتید است که از یک سو نظام بهداشت و درمان کشور و از سوی دیگر توسعه صنایع دامپروری را با مشکالت عدیدهای مواجه کرده است. مزیت نسبی مولکوالر واکسن های نسل جدید نسبت به استراتژیهای کنترل و درمان رایج )همچون داروهای ضد انگل و جراحی( باعث شده تا توجه به واکسنهای ضد انگل در سالهای اخیر روز به روز بیشتر گردد. این پاتوژن انگلی جزو بیماریهای مشترک بین انسان و عمدتا سگ و گوسفند است. ایده استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک برای طراحی هوشمندانهتر و در عین مقرون به صرفهتر واکسنهای اپی- توپیک میتواند طراحی واکسن را با علم به اطالعات ایمونولوژیک و بیوتکنولوژیک در سطح silico in مهندسی کند. در این مطالعه قصد داریم اپیتوپهای T مربوط به MHCهای کالس I و II آنتیژن 3-3-14 ایزوله ایرانی انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس را برای طراحی واکسنی پلیتوپیک مورد پیشگویی قرار دهیم. مواد و روشها پروتواسکولکسهای انگل مذکور از کبد و ریه گوسفندان کشتارگاه تبریز آسپیره شدند. نمونه DNA استخراج شده از پروتواسکولکسها به همراه پرایمرهای اختصاصی مستقیم )ATGTCTTCTCTCAGTAAGCGCGA )و معکوس )ATCGGCTTTCGGCGGTTCAG )طراحی شده براساس توالی آنتیژن 3-3-14 موجود در NCBI( کد دسترسی؛ AY942149 )مورد واکنش زنجیرهای پلیمراز )PCR )قرار گرفتند. سپس محصول PCR توالییابی شده و in silico آنالیزهای برای( Protein GenBank: AMX81438( NCBI در ثبت ضمن بومی 14-3-3 آنتیژن سکانس مورد استفاده قرار گرفت. پیشگویی اپیتوپ T برای آنالیز اتصال پپتیدها با مولکولهای MHC کالس I و II از طریق الگوریتمهای سرورهای IEDBو TmhcPred انجام گرفت )جزئیات سازه واکسن طراحی شده به همراه آزمایشات بالینی در مقاله کامل پژوهشی گزارش خواهد شد(. یافتهها ادغام نتایج سرورهای مورد استفاده از این قرار است؛ پپتیدهای 0تایی شامل LLSVAYKNV ،DMQTTHPIR و IMQLLRDNLبا باالترین میل اتصال به آلل MHCH2Db کالس Iموش c/BALB و اپیتوپهای HPIRLGLAL و DDAVAELDT به عنوان پپتیدهایی که حداکثر شمار آللهای Kd-H2 را پوشش دادند بدست آمدند. در ارتباط با MHC کالس II هم بیشترین میل اتصال در مورد اپیتوپهای SVAYKNVVGARRSSW ، FLKMKGDYYRYVAEF و TLIMQLLRDNLTLWN مشاهده شد. بحث و نتیجهگیری آنالیزهای silico in در این مطالعه برای نخستین بار اطالعاتی را در مورد اپیتوپهای cell-T آنتیژن 3-3-14 بومی ایران نشان دادند و با توجه به اهمیت این آنتیژن در سیکل زندگی انگل مذکور میتوان امیدوار بود که سازه واکسن طراحی شده بر مبنای این اپیتوپها با نتایج جالب توجهی در خصوص اثربخشی این واکسن بر روی موشهای آزمایشگاهی و نهایتا میزبانهای طبیعی این انگل همراه باشد. |
| کلمات کلیدی | طراحی واکسن، اکینوکوکوس گرانولوزوس، اپی توپ، MHC کلاس I و II ،آنالیز in silico |
| نام فایل | تاریخ درج فایل | اندازه فایل | دانلود |
|---|---|---|---|
| Congress Booklet.pdf | 1399/11/12 | 15074976 | دانلود |
| CertificateEG95_14-3-3.jpg | 1399/11/12 | 55902 | دانلود |