چاپ صفحه |  صفحه نخست سامانه |  نویسندگان |  اطلاعات تفضیلی |  دانلود مقاله | دانشگاه علوم پزشکی تبریز |
| نویسنده | نفر چندم مقاله |
|---|---|
| محمد مصطفی پورسیف | اول |
| یداله امیدی | سوم |
| حکیمه مقدس ثانی | چهارم |
| عنوان | متن |
|---|---|
| کلمات کلیدی | واکسن اپی توپیک، کیست هیداتید، بیوانفورماتیک، آنتی ژن EG95 |
| خلاصه مقاله | مقدمه بیماری کیست هیداتید جزو بیماریهای زئونوز مابین سگ، انسان و گوسفند است که همه ساله بار مالی سنگینی را به نظام بهداشت و درمان و نیز صنعت دامپروری کشورها تحمیل می کند. امروزه مصرف قرص های ضدانگل و جراحی به عنوان تنها راههای کنترل و درمان این بیماری محسوب می شوند که با اثرات جانبی و خطراتی نیز همراه هستند. مزیت نسبی مولکولار واکسن های نسل جدید باعث شده تا توجه به واکسن های ضد انگل در سالهای اخیر بیشتر گردد. پیشگویی اپیتوپ های آنتی ژنهای کاندید واکسن با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک روشی نو برای طراحی هوشمندانه تر واکسن های اپیتوپیک است که البته نیازمند مطالعه مقدماتی برخی پارامترهای مهم در طراحی واکسن است شامل؛ سیگنال پپتید، ترانس ممبران توپولوژی، تغییرات پس ترجمه ای، نواحی حفاظت شده و آلرژی زایی احتمالی آنتی ژن. مواد و روشها براساس آنالیزهای فیلوژنیک توالی پروتئینی EG95 از وب سایت NCBI انتخاب شد ) AEA09014: GenBank). با استفاده از سرور SigP و مطالعات موجود در UniProt سیگنال پپتید احتمالی پیشگویی شد. الگوریتم TOPCONS برای پیشگویی نواحی ترانس ممبران، سرورهای NetOGlyc ،NetNGlyc و 0.v2 NetPhos به ترتیت برای پیشگویی O–گلیکولیزا سیون، N–گلیکولیزا سیون و فسفریلاسیون استفاده گردید. آلرژنیسیته احتمالی پروتئین بوسیله سرور AlgPred الگوریتم هیبرید آن (SVMc + known IgE epitopes + ARPs BLAST + MAST) انجام گرفت. نواحی حفاظت شده آنتی ژن EG95 توسط نرم افزار BioEdit و برای طراحی واکسنی وسیع طیف پیشگویی گردید. یافته ها براساس آنالیزهای in silico شمار 10 آمینواسید ابتدایی توالی EG95 به عنوان سیگنال پپتید شناخته شد. آمینواسیدهای 121 تا 100 به عنوان قطعه ی دارای ترانس ممبران شناخته شد. موقعیت های 63 ( Ser-Ile-Asn ) و 71 ( Ser-Pro-Asn ) به عنوان N–گلیکولیزیشن پیشگویی شد. وقوع O–گلیکولیزیشن احتمالی در آمینواسیدهای 29، 31، 58، 72، 97، 137، 138، 148 مشاهده شد. همچنین 6 سرین، 4 ترئونین و 1 تایروزین فسفریلشن در EG95 قابل انتظار خواهد بود. الگوریتم هیبرد پیشگویی آلرژنیسیتی که از چهار روش مختلف بصورت ترکیبی استفاده می کند، نشان داد EG95 به عنوان پروتین آلرژن محسوب نمی شود. منحنی shannon تر سیم شده توسط BioEdit (آستانه انتروپی=1) نواحی 25-32، 63-68 و 115-120 را بعنوان حفاظت شده نشان داد. بحث و نتیجهگیری آنالیزهای silico in در این مطالعه برای نخستین بار اطلاعاتی را در مورد برخی ویژگیهای ساختار اولیه آنتی ژن EG95 نشان داده اند که برای پیشگویی اپی توپ و سپس طراحی واکسن پلی توپیک بسیار مهم هستند. پارامترهای ارزیابی شده در این مطالعه، بخشهایی از سکانس را نشان میدهند که نمیتوانند در معرض سیستم ایمنی قرار گیرند و بنابراین کاندید اپیتوپ های سازه نهایی طراحی شده نخواهند بود. در پایان، سازه طراحی شده بر مبنای این داده ها احتمال نتایج جالب توجهی در خصوص اثربخشی بر روی میزبانهای حدواسط این انگل به همراه خواهد داشت. |
| نام فایل | تاریخ درج فایل | اندازه فایل | دانلود |
|---|---|---|---|
| Congress Booklet.pdf | 1399/11/12 | 15074976 | دانلود |
| CertificateEG95.jpg | 1399/11/12 | 80305 | دانلود |
