بررسی عملکرد و هدف گیری پروتئین MET به عنوان یک انکوژن کیناز در آدنوکارسینوم مجرای پانکراس: یک مطالعه متاآنالیز
Investigating the function and targeting of MET protein as an oncogene kinase in pancreatic Ductal Adenocarcinoma: A Meta-analysis study
مجریان: سپیده پرویزپور
خلاصه روش اجرا: سرطان پانکراس یکی از مهم ترین عوامل مرگ و میر در جهان کنونی است. در این مطالعه ما قصد داریم از ترکیبات شیمیائی مستخرج از گیاه اMelilotus officinalis (Linn.) Pall (یونجه زرد ) بر علیه سرطان پانکراس استفاده کنیم. نام های دیگر این گیاه امهای دیگر آن عبارتند از: شبدر شیرین، اکلیلالملک، بسنگ، بسیه، شاهبسه، ناخنک، گیاه قیصر. گلهای یونجه زرد دارای خواص تشنّج، مرهم سینه، قبضکننده و ضد عفونی کنندهاست. فیتوکمیکال ها در سال های اخیر به دلیل اثرات دارویی متنوع خود در برابر سرطان ها توجه بسیاری را به خود جلب کرده اند. در این زمینه، طراحی دارو به کمک رایانه عمدتاً به عنوان یک روش مقرون به صرفه و با زمان برای کشف کاندیداهای درمانی بالقوه در برابر سرطان ریه قبل از آزمایش تجربی آنها در شرایط آزمایشگاهی و درون تنی استفاده می شود. بدین منظور ترکیبات انتخاب شده از این گیاه با توجه به خصوصیات فیزیکی و شیمیایی آنها تأیید و برای بررسی رفتار ترکیبات در مجاورت پروتئین هدف در بروز سرطان پانکراس با استفاده از ابزارهای شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار می گیرند.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 73175 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی عملکرد و هدف گیری پروتئین MET به عنوان یک انکوژن کیناز در آدنوکارسینوم مجرای پانکراس: یک مطالعه متاآنالیز |
| عنوان لاتین طرح | Investigating the function and targeting of MET protein as an oncogene kinase in pancreatic Ductal Adenocarcinoma: A Meta-analysis study |
| نوع طرح | طرح تحقیقاتی |
| اولویت طرح | مکانیسم سلولی مولکولی اثربخشی فرآوردههای دارویی، ترکیبات بیولوژیک |
| نوع مطالعه | طرح تحقیقاتی-پژوهشی |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | خير |
| مقطع پایان نامه | |
| مدت اجرا - ماه | 24 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | تا به امروز، توجه زیادی به فیتوکمیکال ها یا همان ترکیبات شیمیایی گیاهان به دلیل اثرات دارویی متنوع آنها بر روی انواع بیماری ها مانند سرطان انجام شده است.در این راستا، طراحی دارو به کمک کامپیوتر، به عنوان یک روش مقرون به صرفه است. بدین منظور در درجه اول برای بررسی کاندیداهای دارو قبل از هزینه بیشتر در شرایط in vitro و in vivo از روشهای بیوانفورماتیکی استفاده می شود. مطالعات قبلی فعالیت ضد سرطانی عصاره ها را از گیاه شبدر شیرین زرد (Melilotus officinalis (Linn.) Pall) از طریق مهار رشد سلول های تومورنشان داده است. از این نظر انگیزه زیادی برای مطالعه بیشتر ترکیب شیمیایی Melilotus officinalis (Linn.) Pall و اثرات فارماکولوژیک آن در برابر سرطان های مختلف وجود دارد. در این مطالعه، ما پروتکلی از رویکردهای in silico را برای غربالگری فیتوشیمیایی شبدر شیرین بر علیه سرطان انسان را به کار بردیم.که نتیجه آن : 1. استفاده از روش های محاسباتی برای معرفی کاندیدهای دارویی باعث می شود این پروسه با هزینه بسیار اندک و با دقتی مناسب مدالیته های درمانی کارآمد را معرفی نماید. 2. با پایه ریزی چنین پلتفرم هایی می توان راهکاری سریع برای مبارزه با بیماریهای سرطانی و عفونتهای نوظهور آینده طراحی کرد. |
| اهداف اختصاصی | شناسایی ژنهای موثر در کارسینوم پانکراس با روشهای متا آنالیز -غربالگری فیتوشیمیایی مبتنی بر فارماکوینفورماتیک و دینامیک مولکولی گیاه یونجه زرد بر علیه بیماری سرطان پانکراس در انسان. -مطالعه پایداری برهمکنش بین ترکیب گیاه یونجه زرد و پروتئین هدف در بروز سرطان پانکراس با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی |
| چکیده انگلیسی طرح | Pancreatic cancer adenocarcinoma (PDAC) is an extremely deadly disease with a 5-year survival rate less than 10% in the US. Transcriptome technology with a specific emphasis on kinase proteins, holds significant promise for precision medicine and drug discovery by identifying actionable genes with varying expression patterns. The mRNA expression data tumor samples and adjacent non-tumor samples of PDAC will obtain from GEO database, and three eligible GSE profiles of PDAC will choose and will combine. A table of Human Kinases will collect from KinHub. kinase genes with differentially expressed conditions will identify. The Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways and Gene Ontology will employed for the identification of biological processes. UALCAN website will use for survival analysis. A total of 40 phytochemicals will isolate from the yellow sweet clover plant, Melilotus officinalis (Linn.) Pall and will test against the selected protein. To do the virtual screening and molecular docking techniques will employ. From these experiments, four compounds will choose for further investigation due to their strong binding affinities with the protein. |
| کلمات کلیدی | Molecular dynamics (MD) is a computer simulation method for analyzing the physical movements of atoms and molecules. Molecular docking is the study of how two or more molecular structures (e.g., drug and enzyme or protein) fit together |
| ذینفعان نتایج طرح |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| سپیده پرویزپور | مجری اول (اصلی-هیات علمی) |
| جعفر رزم آرا | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر استفاده از ترکیبات یونجه زرد برای طراحی دارو جهت درمان سرطان پانکراس بود.متن خبر سرطان پانکراس یکی از مهم ترین عوامل مرگ و میر در جهان کنونی است. گیاهان حاوی ترکیبهای متنوعی هستند که میتوانند برای درمان و پیشگیری بیماریها استفاده شوند. این ترکیبات گیاهی می توانند اثرات مثبت بیشتر و عوارض جانبی کمتری نسبت به داروهای شیمیایی داشته باشند . این مطالعه برای کشف داروهای طبیعی شبیه مولکولی کوچک مبتنی بر هدف از گیاه یونجه زرد طراحی شده است که دارای پتانسیل ضد سرطانی بدون ایجاد عوارض جانبی جدی هستند. در این مطالعه ترکیبات گیاه یونجه زردبا استفاده از روشهای کامپیوتری شناسایی شده و پس از اطمینان از عدم حساسیت یا سمیت آنها برروی انسان با استفاده از روشهای کامپیوتری بر روی بیومارکرهای سرطان پانکراس تست شدند.در نهایت از بین آنها 3 ترکیب که هیچ حسایت یا سمیتی برای بدن نداشته و بهترین اینترکشن را با سلولهای سرطانی می دهند را انتخاب کرده و برای مطالعات بیشتر ازمایشگاهی معرفی کردیم. |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
