طراحی ترکیبات جدید علیه گیرنده هیستامین H4 با استفاده از روش Scaffold Hopping
Design of novel ligand(s) against histamine H4 receptors based on scaffold hopping method
مجریان: مریم حمزه میوه رود , سیاوش دستمالچی
خلاصه روش اجرا: در طرح حاضر، ترکیبات معرفی شده بعنوان آنتاگونیست گیرنده H4 به منظور افزایش میزان تمایل اتصال به گیرنده و بهبود خصوصیات فیزیکوشیمیایی مورد اصلاحات ساختاری با استفاده از روشهای in silico قرار خواهند گرفت. بدین منظور، بر اساس فارماکوفور اتصالی آنتاگونیست های حاضر، با استفاده از روشهای scaffold hopping ایزواسترهای مختلف توسط نرم افزار های مربوطه جایگزین خواهد شد، سپس ترکیبات طراحی شده از لحاظ خصوصیات ADME و معیارهای مختلف druglikeness بررسی خواهند شد. در ادامه، داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی برای ساختارهای بدست آمده از نتایج بهینه سازی، انجام خواهد گردید و میزان انرژی اتصال به گیرنده با استفاده از روش MM/PB(GB)SA پیش بینی و بر اساس سیستم امتیاز دهی از بین آنها بهترین و مناسب ترین ترکیب جهت مطالعات بعدی بروشهای تجربی معرفی خواهد گردید.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 73007 |
| عنوان فارسی طرح | طراحی ترکیبات جدید علیه گیرنده هیستامین H4 با استفاده از روش Scaffold Hopping |
| عنوان لاتین طرح | Design of novel ligand(s) against histamine H4 receptors based on scaffold hopping method |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | انفورماتیک زیستی (bioinformatics) و زیست شناسی سامانه ای (systems biology) |
| نوع مطالعه | مطالعات علوم پایه (Experimental) |
| تحقیق در نظام سلامت | خیر |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | دکتری عمومی |
| مدت اجرا - ماه | 12 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | استفاده از تکنیک scaffold hopping جهت انجام بهینه سازی ساختاری و معرفی ترکیبات جدیدی که برهمکنش های موثرتری با گیرنده چهارم هیستامین دارند. |
| اهداف اختصاصی | بهینه سازی و اصلاح ساختاری ترکیبات معرفی شده بعنوان آنتاگونیستهای گیرنده های H4 و سپس بررسی خصوصیات ADME و ویژگی های druglikeness -پیش بینی برهمکنش های موثر توسط روش داکینگ مولکولی ترکیبات در جایگاه فعال مدل گیرنده H4 -انجام شبیه سازی دینامیک مولکولی و محاسبه انرژی بایندیگ برای کمپلکس لیگاند و گیرنده |
| چکیده انگلیسی طرح | In the present work, previously identified compounds as H4 receptor antagonists will be structurally optimized in terms of physicochemical properties and binding affinities. To this end, based on the pharmacophore model proposed for the selected candidate molecules, different bioisosteres will be replaced using scaffold hopping method. Then, the designed compounds will be inspected from ADME and drug-likeness properties. In the following step, molecular docking and simulation studies will be performed for the selected compounds with subsequent calculation of binding free energy using MM/PB(GB)SA method. According to the obtained results, the best and suitable compounds will be introduced for further biological evaluations in future. |
| کلمات کلیدی | Scaffold-hopping: اصلاحات اسکلتی : جایگزین کردن قسمت هایی از اسکلت مولکول توسط بایوایزواسترها به منظور بهبود خواص فیزیکوشیمیایی Docking: داکینگ (انطباق مولکولی): پیش بینی برهمکنش های لیگند با گیرنده توسط روش های محاسباتی Molecular dynamics simulation: شبیه سازی دینامیک مولکولی: شبیه سازی رفتار مولکولی لیگاند با گیرنده مربوطه در طول زمان |
| ذینفعان نتایج طرح |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| مریم حمزه میوه رود | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| سیاوش دستمالچی | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| نازنین سید اسماعیلی | دانشجوی مالک پایان نامه |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر ترکیبات جدید علیه گیرنده چهارم هیستامین با استفاده از تکنیک اصلاح ساختاری طراحی گردید.متن خبر اصلاحات ساختاری بر روی ترکیب toreforant بعنوان مهارکننده و آنتاگونیست گیرنده چهارم هیستامین با هدف بهینه سازی و بهبود خصوصیات فیزیکوشیمیایی انجام گردید و ترکیبات جدید طراحی و معرفی گردید. نتایج حاصل از این پایاننامه میتواند زمینه جدیدی جهت سنتز و بررسی فعالیتهای بیولوژیکی ترکیبات منتخب بهینه شده را فراهم آورد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
