Computational predictive approaches for interaction and structure of aptamers

Computational predictive approaches for interaction and structure of aptamers


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
چکیده مقاله
چکیده مقاله
نویسندگان
نویسندگان
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: ندا امامی , پروین صمدی پاکچین , رضا فردوسی

کلمات کلیدی: Aptamer, Interaction prediction, Structure prediction, Affinity, Machine learning

نشریه: 18707 , 110268 , 497 , 2020

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله رضا فردوسی
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه دانشکده مدیریت و اطلاع رسانی پزشکی
کد مقاله 71945
عنوان فارسی مقاله Computational predictive approaches for interaction and structure of aptamers
عنوان لاتین مقاله Computational predictive approaches for interaction and structure of aptamers
ناشر 3
آیا مقاله از طرح تحقیقاتی و یا منتورشیپ استخراج شده است؟ بلی
عنوان نشریه (خارج از لیست فوق)
نوع مقاله Review Article
نحوه ایندکس شدن مقاله ایندکس شده سطح یک – ISI - Web of Science
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت

خلاصه مقاله
hide/show

Aptamers are short single-strand sequences that can bind to their specific targets with high affinity and specificity. Usually, aptamers are selected experimentally via systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX), an evolutionary process that consists of multiple cycles of selection and amplification. The SELEX process is expensive, time-consuming, and its success rates are relatively low. To overcome these difficulties, in recent years, several computational techniques have been developed in aptamer sciences that bring together different disciplines and branches of technologies. In this paper, a complementary review on computational predictive approaches of the aptamer has been organized. Generally, the computational prediction approaches of aptamer have been proposed to carry out in two main categories: interaction-based prediction and structure-based predictions. Furthermore, the available software packages and toolkits in this scope were reviewed. The aim of describing computational methods and tools in aptamer science is that aptamer scientists might take advantage of these computational techniques to develop more accurate and more sensitive aptamers.

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
ندا امامیاول
پروین صمدی پاکچیندوم
رضا فردوسیسوم

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
Computational predictive approaches for interaction and structure of aptamers.pdf1399/02/021430444دانلود