ارزیابی استخراج ستونی و غیر ستونی ژن ها از بافت های پارافنی سرطان کبد

Validation of Total RNA Spin-column and Non-column Extraction Methods for microRNA Expression Analyses in Formalin-fixed Paraffin-Embedded Liver Samples


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
چکیده مقاله
چکیده مقاله
نویسندگان
نویسندگان
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: زهرا آصفی , علیرضا ابهری , بهروز شکوهی گوگانی , زینب لطیفی , سعید نظری سلطان احمد , ناصر صمدی , محمد نوری

کلمات کلیدی: Keywords: Spin column extraction, miRNA, FFPE

نشریه: 0 , 3 , Vol. 6 , 2019

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله محمد نوری
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه بیماری های گوارش و کبد
کد مقاله 71684
عنوان فارسی مقاله ارزیابی استخراج ستونی و غیر ستونی ژن ها از بافت های پارافنی سرطان کبد
عنوان لاتین مقاله Validation of Total RNA Spin-column and Non-column Extraction Methods for microRNA Expression Analyses in Formalin-fixed Paraffin-Embedded Liver Samples
ناشر 8
آیا مقاله از طرح تحقیقاتی و یا منتورشیپ استخراج شده است؟ بلی
عنوان نشریه (خارج از لیست فوق) Crescent Journal of Medical and Biological Sciences
نوع مقاله Original Article
نحوه ایندکس شدن مقاله ایندکس شده سطح یک – ISI - Web of Science
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت

خلاصه مقاله
hide/show

Abstract Objectives: MicroRNAs are small (19–23nt) noncoding RNAs that adjust gene expression post-transcriptionally. In addition, microRNA (miRNA) profile modification is revealed in various abnormalities including cancer. Formalin-fixed paraffinembedded (FFPE) material archives are valued for searching human diseases. Therefore, the present study aimed to investigate FFPE samples for miRNA expression, as an alternative analyte for gene expression with the growing therapeutic and diagnostic potential. Further, the validity of RNA isolation kits was evaluated in order to identify a preferred method. Materials and Methods: The two extracted methods were qualitatively and quantitatively assessed in order to compare the archived specimens between these methods. The total RNA and gene expression were quantified in each method as well. Results: Based on the results, the level of RNA extracted from FFPE tissues and real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) of hsa-miR-623, hsa-miR-515-5pin miRNeasy FFPE (P value<0.047) was significantly higher than that in RNAX Plus (P<0.084). Conclusions: In general, the spin column method for miRNA expression profile had better expression compared to the noncolumn method. The results further confirmed the validity of FFPE tissues as an appropriate resource for miRNA analyses.

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
زهرا آصفیاول
علیرضا ابهریدوم
بهروز شکوهی گوگانیسوم
زینب لطیفیچهارم
سعید نظری سلطان احمدپنجم
ناصر صمدیهفتم
محمد نوریهشتم

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
pdf_CJMB_317.pdf1399/01/25195259دانلود