Pseudomonas khazarica sp. nov., a polycyclic aromatic hydrocarbon-degrading bacterium isolated from Khazar Sea sediments

Pseudomonas khazarica sp. nov., a polycyclic aromatic hydrocarbon-degrading bacterium isolated from Khazar Sea sediments


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
چکیده مقاله
چکیده مقاله
نویسندگان
نویسندگان
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: ویدا ابراهیمی , وحیده طرح ریز , محمد سعید حجازی

کلمات کلیدی: Pseudomonas khazarica  Polycyclic aromatic hydrocarbons  Khazar (Caspian) sea

نشریه: 0 , 1-12 , 112 , 2019

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله وحیده طرح ریز
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی
کد مقاله 70442
عنوان فارسی مقاله Pseudomonas khazarica sp. nov., a polycyclic aromatic hydrocarbon-degrading bacterium isolated from Khazar Sea sediments
عنوان لاتین مقاله Pseudomonas khazarica sp. nov., a polycyclic aromatic hydrocarbon-degrading bacterium isolated from Khazar Sea sediments
ناشر 10
آیا مقاله از طرح تحقیقاتی و یا منتورشیپ استخراج شده است؟ خیر
عنوان نشریه (خارج از لیست فوق) Antonie van Leeuwenhoek Journal of Microbiology
نوع مقاله Original Article
نحوه ایندکس شدن مقاله ایندکس شده سطح یک – ISI - Web of Science
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت

خلاصه مقاله
hide/show

A novel Gram-negative, aerobic, motile and rod-shaped bacterium with the potential to biodegrade polycyclic aromatic hydrocarbons, was isolated from Khazar (Caspian) Sea. Strain TBZ2T grows in the absence of NaCl and tolerates up to 8.5% NaCl. Growth occurred at pH 3.0–10.0 (optimum, pH 6.0–7.0) and 10–45 C (optimum, 30 C). The major fatty acids are C18:1 x7C, C16:1 x7C/ C15:0 iso 2-OH, C16:0, C12:0, C10:0 3-OH, C12:0 3-OH. The major polar lipids include iphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, phosphatidylcholine and the predominant respiratory quinone is ubiquinone Q-9. The 16S rRNA gene sequence analysis showed that strain TBZ2T is a member of the genus Pseudomonas with the highest similarity to P. oleovorans subsp. oleovorans DSM 1045T (98.83%), P. mendocina NBRC 14162T (98.63%), P. oleovorans subsp. lubricantis RS1T (98.61%) and P. alcaliphila JCM 10630T (98.49%) based on EzBioCloud server. Phylogenetic analyses using housekeeping genes (16S rRNA, rpoD, gyrB and rpoB) and genome sequences demonstrated that the strain TBZ2T formed a distinct branch closely related to the type strains of P. mendocina and P. guguanensis. Digital DNA-DNA hybridisation and average nucleotide identity values between strain TBZ2T and its closest relatives, P. mendocina NBRC 14162T (25.3%, 81.5%) and P. guguanensis JCM 18146T (26.8%, 79.0%), rate well below the designed threshold for assigning prokaryotic strains to the same species. On the basis of phenotypic, chemotaxonomic, genomic and phylogenetic results, it is recommended that strain TBZ2T is a novel species of the genus Pseudomonas, for which the name Pseudomonas khazarica sp. nov., is proposed. The type strain is TBZ2T (= LMG 29674T = KCTC 52410T).

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
ویدا ابراهیمیپنجم
وحیده طرح ریزاول
محمد سعید حجازیدهم

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
Tarhriz2019_Article_PseudomonasKhazaricaSpNovAPoly.pdf1398/09/24755459دانلود