مطالعه in silico بر سلول های ارتشاح یافته CD8+ در تومور اولیه گلبوبلاستوما و تومور عود کننده گلیوبلاستوما

A bioinformatic study on tumor-infiltrating CD8+ subpopulations in primary and recurrent glioblastoma


چاپ صفحه 		پژوهان
صفحه نخست سامانه		 مجری و همکاران
مجری و همکاران		 اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی		 دانلود
دانلود 		دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

مجریان: بهزاد برادران

خلاصه روش اجرا: We will thoroughly analyze the 20 samples from the GSE182109 dataset using Python. For artificial intelligence, we used the Scanpy package to identify each cell residing in the tumor microenvironment. Then, we will analyze the RNA sequencing data of TCGA-GBM and GO to identify the prognostic values and molecular functions of the identified differentially expressed factors.

اطلاعات کلی طرح
hide/show

مرحله جاری طرح خاتمه قرارداد و اجرا
کد طرح 70035
عنوان فارسی طرح مطالعه in silico بر سلول های ارتشاح یافته CD8+ در تومور اولیه گلبوبلاستوما و تومور عود کننده گلیوبلاستوما
عنوان لاتین طرح A bioinformatic study on tumor-infiltrating CD8+ subpopulations in primary and recurrent glioblastoma
نوع طرح طرح تحقیقاتی
اولویت طرح ایمونوتراپی بیماری‌های شایع با استفاده از ژن درمانی
نوع مطالعه مطالعات علوم پایه (Experimental)
تحقیق در نظام سلامت خیر
آیا طرح پایان‌نامه دانشجویی است؟ خير
مقطع پایان نامه
مدت اجرا - ماه 12
نوآوری و ضرورت انجام تحقیق Glioblastoma multiforme (GBM) is a commonly diagnosed brain malignancy. Activating anti-tumoral responses to reject tumor tissues is the cornerstone of immunotherapeutic approaches; nevertheless, they don result in desirable outcomes for GBM patients. High tumor heterogeneity and immunosuppressive tumor microenvironment are implicated in the development and relapse of GBM. Herein, we will apply single-cell RNA sequencing to study the three subpopulations of tumor-infiltrating CD8+ T-cells, i,e., naïve, cytotoxic, and exhausted ones. With the high-resolution data, we will study a panel of inhibitory immune checkpoint molecules and the cross-talk in the tumor microenvironment of primary and recurrent GBM. Also, we will investigate the expression profile of each functional subpopulation in the primary and recurrent GBM.
اهداف اختصاصی
  1. Cytotoxic and exhausted tumor-infiltrating CD8+ T-cells might be decreased and increased in recurrent GBM tissues than in primary GBM tissues, respectively.
-
  1. There might be high heterogeneity between the expression of inhibitory immune checkpoints among the primary and recurrent glioblastoma tissues.
-
  1. Cytotoxic and exhausted tumor-infiltrating CD8+ T-cells might have low/high expression of inhibitory immune checkpoints in primary and recurrent glioblastoma tissues, respectively.
-
  1. Increased infiltration of cytotoxic tumor-infiltrating CD8+ T-cells might be associated with improved survival of primary GBM patients.
-
  1. The identified differentially expressed genes might have prognostic values in primary and recurrent GBM patients.
-
  1. In primary and recurrent glioblastoma, exhausted tumor-infiltrating CD8+ T-cells might have the most abundant interactions with tumor-infiltrating dendritic cells.
چکیده انگلیسی طرح Glioblastoma multiforme (GBM) is an incurable brain malignancy. Activating anti-tumoral responses to reject tumor tissues is the cornerstone of immunotherapeutic approaches; nevertheless, they have not led to meaningful outcomes for GBM patients. High tumor heterogeneity and immunosuppressive tumor microenvironment are implicated in the development and relapse of GBM. Herein, we will apply single-cell RNA sequencing to study the three subpopulations of tumor-infiltrating CD8+ T-cells, i,e., naïve, cytotoxic, and exhausted ones. With the high-resolution data, we will study a panel of inhibitory immune checkpoint molecules and the cross-talk in the tumor microenvironment of primary and recurrent GBM. Also, we will investigate the expression profile of each functional subpopulation in the primary and recurrent GBM.
کلمات کلیدی Glioblastoma multiforme یکی از تومرهای بسیار مهاجم و بدخیم اولیه مغز single-cell RNA sequencing روش نوین بررسی پروفایل ژنتیکی نمونه انسانی یا حیوانی در مقیاس سلولی
ذینفعان نتایج طرح بیماران

اطلاعات مجری و همکاران
hide/show

نام و نام‌خانوادگی سمت در طرح
مهدی عبدلی شادبادمجری دانشجویی(کمیته تحقیقات دانشجویی)
بهزاد برادرانمجری اول (اصلی-هیات علمی)

اطلاعات تفضیلی
hide/show

حوزه خبر خبر
رسانه ها و مردم
عنوان خبر
متن خبر
متخصصان و پژوهشگران
عنوان خبر
در ریزمحیط گلیوبلاستوما جمعیت های گوناگونی از CD8 وجود داشت.
متن خبر
ما داده‌های توالی‌یابی RNA تک سلولی را روی سلول‌های ساکن در ریزمحیط گلیوبلاستوما و تجزیه و تحلیل‌های RNA تومور را برای مطالعه اهمیت زیرجمعیت‌های CD8 TILs در گلیوبلاستوما اولیه و عودکننده، تحلیل کردیم. ما تعامل سلول-سلول بین CD8 TIL های Exhausted و سایر سلول های ایمنی ساکن در ریزمحیط های گلیوبلاستوما اولیه و عود کننده را بررسی کردیم و تغییرات بیان را پس از انتقال CD8 TIL ها از گلیوبلاستوما اولیه به گلیوبلاستوما عودکننده بررسی کردیم. TILهای Exhausted CD8 اکثر زیرجمعیتهای CD8 TILها در گلیوبلاستوما اولیه و عودکننده هستند، و CD8 TILهای سیتوتوکسیک کاهش بیان مولکولهای بازرسی ایمنی مهاری در گلیوبلاستوما اولیه و عودکننده داشتند. در ریزمحیط گلیوبلاستوما اولیه و عودکننده، TILهای CD8 Exhausted بیشتر با سلول‌های دندریتیک نفوذکننده تومور تعامل دارند.
سیاستگذاران درمانی
عنوان خبر
متن خبر
سیاستگذاران پژوهشی
عنوان خبر
متن خبر
لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1