ارزیابی سطح بیان let-7e-5p , mir-887-3p و mir-151a-5p در سرم بیماران مبتلا به سرطان پستان
Evaluation of the expression level of let-7e-5p , mir-887-3p , mir-151a-5p in serum of breast cancer patients
مجریان: سیما منصوری درخشان
خلاصه روش اجرا: ابتدا با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی و آنالیز 2 میکرواری پایگاه GEO و دریافت تائیدیه TCGA به کمک کد نویسی با نرم افزار R ، microRNAهایی با بیان تغییر یافته در سرم لیست شدند. با بررسی بیوانفورماتیکی دیتابیس های mirnet ، DIANNA و mirtarbase مسیر های تنظیم شونده توسط این miRNAها مورد بررسی قرار گرفت. از آنجاییکه مطالعه ای جامع برای بررسی بیان miRNAهای mir-151a-5p , mir-887-3p و let-7e-5p به صورت در سرم بیماران پستان صورت نگرفته است وmiRNAهای منتخب تا کنون در سطح سرم توسط تکنیک real-time pcr مورد تائید قرار نگرفته اند. لذا برآن شدیم که بیان این ژنها را در سرم این بیماران بررسی نماییم. ابتدا نمونه گیری از سرم افراد مبتلا به سرطان پستان از بیمارستان الزهرا شهر تبریز انجام خواهد شد. در مرحله بعد RNA استخراج شده و cDNA مربوط به آنها سنتز خواهد شد. در ادامه microRNAهای کاندید توسط تکنیک qPCR به طور کمی بررسی خواهند شد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 69907 |
| عنوان فارسی طرح | ارزیابی سطح بیان let-7e-5p , mir-887-3p و mir-151a-5p در سرم بیماران مبتلا به سرطان پستان |
| عنوان لاتین طرح | Evaluation of the expression level of let-7e-5p , mir-887-3p , mir-151a-5p in serum of breast cancer patients |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | ارائه الگوهای مناسب در مدیریت نظام سلامت |
| نوع مطالعه | بررسی مقطعی ( Cross Sectional) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | کارشناسی ارشد |
| مدت اجرا - ماه | 12 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | اگرچه تومورمارکرها در تشخیص سرطان کاربرد دارند اما روشی تهاجمی به شمار میآید و بررسی بافت مورد نظر توسط جراحی و نمونه گیری از بافت کاربرد آنها را محدود میکند. به همین دلیل نیاز به یک روش غیرتهاجمی برای تشخیص زودهنگام و امن هرچه بیشتر احساس میشود. استفاده از بیومارکر های گردشی در مایعات بدن مانند خون ، سرم و پلاسما برای تشخیص سرطان های مختف روز به روز در حال افزایش است. با شناسایی عملکرد و نقش های متفاوت miRna ها از جمله در تشخیص ( بیومارکر غیرتهاجمی) ، درمان (نقش تنظیمی در بیان یک یا چند ژن) و تعیین پروفایل ژنی ، ارزش mirna ها بیش از پیش افزوده می شود. بیان و نقش miRNAهای منتخب تا کنون غالبا ناشناخته است لذا امید می رود مطالعه حاضر کمکی به شفافیت نقش این miRNAها بنماید. |
| اهداف اختصاصی | اندازه گیری میزان بیان let-7e-5p , mir-887-3p & mir-151a-5p در سرم بیماران -اندازه گیری میزان بیان let-7e-5p , mir-887-3p & mir-151a-5p در سرم گروه کنترل -مقایسه میزان بیان let-7e-5p , mir-887-3p & mir-151a-5p در سرم افراد مبتلا به سرطان و سرم گروه کنترل |
| چکیده انگلیسی طرح | Breast cancer is the most prevalent cancer in women. The etiology of breast cancer is not fully understood yet ; however the role of many genetics and epigenetics factors have been determined. One of the most intriguing of these factors are microRNAs . microRNAs or miRs are 18-25 nt long RNAs which play an important role in gene expression regulation by repressing mRNA translation. In recent years the use of circulating miRs in serum as diagnostic biomarkers has been developed. To identify differentially expressed miRs that may have a significant impact on cell cycle and cancer formation , we have analysed four GEO NCBI microarray datasets (tissue and serum separately) with R program. The derived miRs was validated with TCGA RNA-seq datasets too. Three miRs including let-7e-5p , mir-151a-5p and mir-887-3p were chosen for further studies as they have not been confirmed by PCR before . The pathway analyses conducted by web based softwares suggest important targets in cell cycle for these miRs. We will measure serum and tissue levels of these miRs in breast cancer patients and a control group with qPCR technique . Furthermore the results will be tested by statistical analyses to see if there is a significant relation between these miRs and breast cancer. |
| کلمات کلیدی | microRna: Rna هایی با طول 18-24 نوکلئوتید که در تنظیم پس از رونویسی mRna ها نقش دارند. Margin tissue : بافت حاشیه تومور که از لحاظ پاتولوژیک نشان دهنده بافت سالم و مجزا از سرطان میباشد. Gain of function : افزایش عملکرد یا بیان یک ژن در اثر جهش Real Time PCR: به طور کلی Real Time PCR تکنیکی برای مشاهده بی وقفه ی پیشرفت واکنش PCR در طول زمان می باشد. همچنین با این روش می توان مقادیر تولید PCR (DNA، RNA یا CDNA) را نیز اندازه گیری نمود. |
| ذینفعان نتایج طرح | بیماران مبتلا به سرطان پستان : در صورت وجود رابطه معنی دار ، میتوان به عنوان بیومارکر شناسایی کننده بی خطر از miR های مذکور بهره مند شد. پژوهشگران : پر کردن خلا های علمی حال حاضر راجب miRNA های یاد شده صنعت : در داروسازی با اهداف درمانی |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| امیر ابراهیمی | دانشجوی مالک پایان نامه |
| سیما منصوری درخشان | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| محمود شکاری خانیانی | مشاور |
| سولماز هاشمی | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر بیان let-7e-5p، mir-151a-5p و mir-887-3p درسرطان پستان تغییر داشته و میتوانند در تشخیص زودهنگام و تعیین پیش آگهی بیماری مفید باشند.متن خبر سرطان پستان از شایع ترین بدخیمی های کشنده با شیوع بالا در بین زنان است .در این سرطان استفاده از مارکرهای ژنتیکی و اپی ژنتیکی به دلیل نقش بالای این فاکتورها در پیدایش سرطان، اهمیت دارد. در بین عوامل اپی ژنتیکی، miRNA ها با کنترل بیان ژن ها و مسیر های مهم سلولی نقش غیرقابل انکاری در بروز و پیشروی سرطان ایفا میکنند. با بررسی های بیوانفورماتیکی داده های ریزآرایه، سه miRNA با تغییر بیان معنی دار (let-7e-5p و mir-151a-5p افزایش و mir-887-3p کاهش بیان) در سرم زنان مبتلا بدست آمد که تاکنون بیان آنها در سطح سرم بیماران سرطان پستان توسط تکنیک RT-PCR تایید نشده بودند. لذا، با بررسی بیان این سه ژن با RT-PCR در نمونه های سرمی زنان مبتلا ، تغییر بیان های مشاهده شده در مطالعات بیوانفورماتیکی تائید شدند. سپس با بررسی های غنی سازی صورت گرفته، نقش این miRNA ها در بروز سرطان، چرخه سلولی، تنظیم بیان p53 و ... مشاهده گردید. در نهایت با استفاده از منحنی ROC اثبات گردید که این miRNA ها به عنوان بیومارکر تشخیصی، دارای توانایی تفکیک قابل توجه بین مبتلایان به سرطان پستان و افراد سالم می باشند. نتایج آنالیز های بقا نیز نشان از وابستگی معنی دار بین تغییرات بیان miRNA های مذکور و طول عمر بیماران داشتند. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
