بررسی تغییرات متیلاسیون در پروموتور ژنهای ZMYND-8 و RAR-Β2 در بافت توموری و حاشیه سالم در مبتلایان به سرطان ریه
Evaluation of RAR-Β2 and ZMYND-8 promoter methylation in tumor tissue and free margin in patients with lung cancer
مجریان: مرتضی رئیسی , حامد ولی زاده
خلاصه روش اجرا: هدف از بررسی حاضر بررسی بیان تغییرات متیلاسیون ژنهای ZMYND-8 و RAR-Β2 در بافت توموری و حاشیه تومور بیماران مبتلا به سرطان ریه می باشد. در این مطالعه 50 بیمار مبتلا به سرطان ریه با کسب رضایت شخصی از ایشان تحت مطالعه قرار می گیرند.که معیارهای ورود به مطالعه امضا رضایتنامه شخصی ، ابتلا به سرطان ریه ، سکونت در شمالغرب ایران ، عدم سابقه ابتلا به سرطان و ترک زبان بودن است. معیارهای خروج شامل عدم امضا رضایت نامه ، عدم سکونت در شمالغرب ، سابقه ابتلا به سایر سرطان ها و غیر ترک زبان بودن است. پس از کسب رضایتنامه از بیماران طی جراحی 2 نمونه بافتی از تومور و مارژین گرفته شده و سریعا به محلول نگهدارنده انتقال می یابند . پس از آن نمونه ها با رعایت زنجیره سرما به مرکز تحقیقات منتقل می شوند تا بررسی ها بعدی روی آنها انجام پذیرد. برای بررسی میزان متیلاسیون ژن مورد بررسی نیز ابتدا با کیت مخصوص DNA نمونه ها استخراج گردیده و بعد از استخراج با کیت ویژه متیلاسیون نمونه ها تیمار شده و میزان متیلاسیون ناحیه مورد نظر با روش msHRM ارزیابی خواهد شد
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 67567 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی تغییرات متیلاسیون در پروموتور ژنهای ZMYND-8 و RAR-Β2 در بافت توموری و حاشیه سالم در مبتلایان به سرطان ریه |
| عنوان لاتین طرح | Evaluation of RAR-Β2 and ZMYND-8 promoter methylation in tumor tissue and free margin in patients with lung cancer |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | اپیدمیولوژی، پیشگیری، تشخیص زودهنگام، درمان و بازتوانی در سرطانهای شایع |
| نوع مطالعه | مطالعه مورد/شاهد ( Case - Control ) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | دکتری عمومی |
| مدت اجرا - ماه | 12 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | سرطان یک بیماری ژنتیکی در سلول های پیکری به دلیل تقسیم سلولی غیر طبیعی یا از دست رفتگی مرگ طبیعی سلول (آپوپتوز) می باشد. سرطان، در حال حاضر پس از بیماری های قلبی عروقی دومین عامل مرگ ومیر محسوب می شود. به تقسیم بی رویه و غیر قابل کنترل سلول های بافت ریه ، سرطان ریه گفته می شود. نمود ظاهری این رشد و تقسیم، ایجاد توده ی توموری در بافت است که معمولا متراکم تر و قابل تشخیص از بافت طبیعی می باشد.علائم سرطان ریه عبارتند از : سرفه، ضعف و بی حالی ،تنگی نفس و خلط خونی. سرطان ریه دومین سرطان شایع در مردان و زنان است.در مردان سرطان پروستات شایع تر است ،این در حالی است که در زنان سرطان پستان شایع تر می باشد. انواع اصلی سرطان ریه: سرطانهای ریه سلول کوچک (SCLC)، که سرطان سلولی جو شکل نیز نام دارد و نوع دیگر سرطان ریه سلول غیر کوچک (NSCLC) می باشد. شایعترین علائم عبارتند از سرفه (همراه با خلط خونی)، کاهش وزن و تنگی نفس. درمانهای رایج، عبارتند از ، جراحی، شیمی درمانی و پرتو درمانی. گاهی اوقات NSCLC با جراحی قابل درمان است، اما معمولاً SCLC به شیمی درمانی و پرتودرمانی بهتر پاسخ می دهد. به دلیل اینکه متیلاسیون DNA در جایگاه های دی نوکلئوتیدهای CpG در پروموتور ژن ها، در تنظیم رونویسی دخیل هستند. این علائم اپی ژنتیکی اغلب در افراد اسکیزوفرن به همراه اندازه گیری مولکول های RNA متناظر بررسی می شوند. یک فرضیه بر این مسئله دلالت دارد که تغییر در متیلاسیون DNA پروموتور، یک شاخص بالقوه برای فعالیت بیان ژن تغییر یافته در جایگاه می باشد که سپس منجر به تغییر در سطح RNA متناظر می گردد. با این نگرش، سنجش کروماتین و بررسی علائم اپی ژنتیکی می تواند بینشی برای مکانیسم های بیان ژن طی تکامل و همچنین تغییرات بالقوه در بیماری های مثل سرطان فراهم آورد. همچنین این تغییرات ممکن است با توجه به تفاوت در محیط و وراثت در جوامع گوناگون تفاوت داشته باشد. متیلاسیون نا به جای DNA یکی از تغییرات اپی ژنتیکی است که مطالعات نسبتا زیادی درباره ی آن انجام شده است و این موضوع کاملا اثبات گردیده که ژنهای بازدارنده ی تومور مکررا به واسطه ی متیلاسیون جزایر CpG که معمولا در ناحیه ی 5' حدود نیمی از ژنهای انسان قرار دارند، غیرفعال می شوند. خاموش شدن رونویسی از ژنهای بازدارنده ی تومور، به عنوان مرحله ای مهم در پروسه ی چندمرحله ای کارسینوژنز در سرطان مشخص گردیده است .هایپر متیلاسیون به عنوان بیومارکرهای تشخیصی ، تغییرات اپی ژنتیکی، مانند بیومارکرهایی که میزان پاسخ به شیمی درمانی های خاص را نشان می دهند، می تواند نوید پیش بینی پیش اگهی (prognose ) سرطان را بدهد. در سرطان ریه، روش های مطالعه ی سیستمیک در کل ژنوم، ژنهای مختلفی را مشخص کرده است که هایپرمتیلاسیون مخصوص به تومور را در پروموتور خود نشان می دهند و قابلیت این را دارند که در بالین به عنوان بیومارکرهایی برای تشخیص، پیش اگهی و پیش بینی کننده کاربرد دارند. بیشتر بیماری ها، شامل تومورها، به طور جدا نشدنی با متیلاسیون ژن مرتبط اند. فرضیه ای پیشنهاد می کند که متیلاسیون نابجای DNA ممکن است مقدم بر وقوع سلول های سرطانی باشند. مطالعات اخیر نشان داده است که متیلاسیون چندگانه ی ژن یک ارتباط قطعی با شدت سرطان و حساسیت شیمی درمانی دارد. وقوع تومور نه تنها با تکثیر غیر عادی و تمایز سلول ها، بلکه با آپوپتوز غیر عادی سلول ها نیز ارتباط دارد. تغییرات متیلاسیون ژن RAR-Β2 قبلا در جوامع مختلف در سرطان ریه بررسی شده و حتی ارزش بیومارکری آن نیز اثبات گردیده است که متاسفانه بررسی مشابهی در جامعه مورد هدف این مطالعه انجام نگرفته است . مطالعات اخیر نقش تغییرات ZMYND-8را در متاستازهای ریوی سرطان پستان را به اثبات رسانده حال آنکه تغییرات اپی ژنتیک این انکوژن تا به حال در سرطان ریه به تنهایی بررسی نشده است. بررسی بیوانفورماتیک بر در پایگاه های داده GEO و XENA browser نشان دهنده تغییرات متیلاسیون در پروموتور دو ژن ZMYND-8و RAR-Β2 است . هدف این مطالعه ارزیابی نقش متیلاسیون دو ژن مورد بحث در تشخیص و پیش آگهی سرطان ریه از طریق مقایسه ی سطح متیلاسیون این ژن در نمونه های بافت توموری و نمونه های بافت حاشیه تومور 50 بیمار مبتلا به این سرطان به روش بیسولفیت(Bisulphite) می باشد. از آنجایی که نژاد و محیط معمولا در تنظیمات اپی ژنتیکی تاثیر دارند ، در این مطالعه چون نمونه های تومورال و سالم هر دو از یک فرد اخذ می شوند، نقش مداخله گر نژاد و محیط حذف گردیده است. امید داریم در صورت مشاهده ی تفاوت معنی دار سطح متیلاسیون در تعداد قابل ملاحظه ای از بیماران و تایید ژن های کاندید به عنوان بیومارکر، مطالعات خود را در مسیر یافتن روشهای غیرتهاجمی با حساسیت و صحت و دقت بالا برای غربالگری سرطان ریه در stage های پایین، ادامه دهیم. |
| اهداف اختصاصی | مقایسه الگوی متیلاسیون ZMYND-8 در نمونه های توموری سرطان ریه و نمونه های مارژین سالم -مقایسه الگوی متیلاسیون RAR-Β2 در نمونه های توموری سرطان ریه و نمونه های مارژین سالم -بررسی تغییرات الگوی متیلاسیون RAR-Β2 در نمونه های توموری سرطان ریه با ویژگی های بالینی متفاوت -بررسی تغییرات الگوی متیلاسیون ZMYND-8 در نمونه های توموری سرطان ریه با ویژگی های بالینی متفاوت |
| چکیده انگلیسی طرح | The aim of the present study was to investigate the expression of methylation changes in ZMYND-8 and RAR-Β2 genes in tumor tissue and tumor margins of lung cancer patients. In this study, 50 patients with lung cancer will be studied with their personal consent. The criteria for inclusion in the study are personal signature, lung cancer, living in northwestern Iran, no history of cancer and being Turk . Exclusion criteria include not signing a consent form, not living in the Northwest, a history of other cancers and not being a Turk. After obtaining the consent of the patients during surgery, 2 tissue samples are taken from the tumor and the margin and are immediately transferred to the maintenance solution. The samples are then transported to a research center with a cold chain for further examination. In order to evaluate the methylation rate of the studied gene, the samples were first extracted with a special DNA kit and after extraction, the samples were treated with a special methylation kit and the methylation rate of the target region will be evaluated by msHRM method. |
| کلمات کلیدی | سرطان ریه : بدخیمی مربوط به بافت ریه ژن ZMYND-8:یکی از تومور ساپرسور ژن های عمده در گیر در چرخه سلولی ژن RAR-Β2: یکی از ژنهای کروموزوم 2 که بنابه گزارش برخی مطالعات دارای افزایش بیان در سرطان ریه است |
| ذینفعان نتایج طرح |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| میلاد اسدی | همکار اصلی |
| میلاد جابری | همکار اصلی |
| مهدیه پوراصغری آذر | دانشجوی مالک پایان نامه |
| مرتضی رئیسی | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| شهریار هاشم زاده | مشاور |
| حامد ولی زاده | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| حبیب ذره دار | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر میزان متیلاسیون ژنهای ZMYND8 و RARB2 در بیماران مبتلا به سرطان ریه نسبت به افراد سالم متفاوت میباشد.متن خبر سرطان به عنوان یک بیماری پیچیده،پس از تجمع تغییرات ژنتیکی و اپیژنتیکی در سلولهای نرمال بروز میکند.سرطان ریه، شایعترین سرطان در سراسر جهان بشمار می آیدو سالیانه تقریبا 6 /1 میلیون نفر در جهان به سرطان ریه مبتلا میگردند.طی مطالعات انجام شده در دو دهه ی اخیر دانشمندان به این نتیجه رسیده اند که در سلولهای سرطانی یک سری تغییرات اپیژنتیک رخ میدهد که در سلولهای سالم این تغییرات یا به کل مشاهده نمیشود و یا به میزان ناچیز اتفاق میافتد. از این دست تغییرات اپیژنتیک میتوان به متیلاسیون اشاره کرد. پروسه ی متیلاسیون در قسمتهای مختلفی از ژنوم به طور طبیعی رخ میدهد. اما در
بخشهای خاصی مانند پروموتور ژنهای سرکوبگر تومور فقط در شرایط سرطانی رخ میدهد.از ژنهای مهم درگیر در سرطان ریه می توان به ژنهای ZMYND8 و RARB2 اشاره کرد.در این مطالعه، تغییر میزان متیلاسیون ژنهای ZMYDN8 و RARB2 در بیماران مبتلا به سرطان ریه مورد ارزیابی قرار گرفت و با توجه به نتایج به دست آمده میزان متیلاسیون
این ژنها در بافت بیماران با افراد سالم متفاوت بود.همچنین یافته ها حاکی از ارتباط بیان این ژنها با ویژگیهای پاتوبیولوژیکی می باشد. هرچند که برای اثبات این ادعا نیاز به بررسیهای بیشتری است . |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
