بررسی فیلوژنتیکی، تعیین ژنوتایپ ها و ساب تایپ های ویروس هپاتیت B در تبریز طی سال 1400
The phylogenetic investigation and determination of hepatitis B virus genotypes and subtypes in Tabriz during 2021
مجریان: وحدت پورطهماسبی , مهین آهنگر اسکوئی
خلاصه روش اجرا: در مطالعه حاضر نمونه خون 63 بیمار HBsAg مثبت در شهر تبریز جهت بررسی ژنوتیپ و زیرژنوتیپ ویروس در گردش ما بین جمعیت بیماران مبتلا تهیه میگردد. عفونت هپاتیت B عموما توسط تست های سرولوژی و با بررسی حضورآنتی ژن سطحی ویروس (HBsAg) با تست الایزا در خون بیماران تعریف می شود. در این طرح از ابتدا نمونه سرم جدا شده و از طریق تکنیک الایزا حضور HBeAg و حضور مارکر Anti-HBe و Anti-HBc در سرم بیماران حامل عفونت جهت پی بردن به پروفایل سرولوژیک مورد بررسی قرار گرفته و همه نمونه های HBsAg مثبت جهت انجام ادامه کار جدا می شوند و توسط کیت استخراج، ژنوم ویروس هپاتیت B استخراج می گردد و محصول استخراج ژنوم از همه نمونه های جمع آوری شده, برای تعیین حضور HBV-DNA از طریق Nested-PCR به علت اختصاصیت بالا و روش استاندارد طلایی مطرح در دنیا بررسی می گردد. بیمارانی که از نظر حضور ژنوم ویروس هپاتیت B مثبت با روش Nested-PCR تایید می شوند برای ژن HBsAg که حاوی 681 نوکلئوتید می باشد توسط روش Sanger توالی یابی خواهند شد. پس از توالی یابی با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی ژنوتیپ و زیرژنوتیپ های ویروس و موتاسیون های احتمالی مشخص خواهند شد و برای آنها درخت فیلوژنتیکی رسم می شود.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 67508 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی فیلوژنتیکی، تعیین ژنوتایپ ها و ساب تایپ های ویروس هپاتیت B در تبریز طی سال 1400 |
| عنوان لاتین طرح | The phylogenetic investigation and determination of hepatitis B virus genotypes and subtypes in Tabriz during 2021 |
| نوع طرح | گرنت - پایان نامه |
| اولویت طرح | غربالگری، اپیدمیولوژی، پیشگیری و مراقبت در بیماریهای دستگاه گوارش با تاکید بر هپاتیت و سیروز کبدی |
| نوع مطالعه | بررسی مقطعی ( Cross Sectional) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | کارشناسی ارشد |
| مدت اجرا - ماه | 10 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | آسیا دارای فراوانی نسبتاً بالایی برای شیوع HBV (بیش از 8%) نسبت به سایر مناطق دنیا است. با توجه به این واقعیت که انواع مختلفی از HBV در مناطق مختلف جغرافیایی و اقلیمی گزارش شده است، می توان با تجزیه و تحلیل انواع ژنوتیپ و زیر ژنوتیپهای مختلف HBV پراکنده شده در مناطق مختلف جغرافیایی و اقلیمی به درک کاملی از نژاد اولیه ویروس و خاستگاه و منشأ آن رسید. مطالعات حاصل از بررسی ژنوتیپها و زیر ژنوتیپهای HBV اطلاعات مفیدی را فراهم آوردهاند که بر شدت بیماری و نیز پاسخ به درمانهای ضدویروس نیز متفاوت و تأثیر گذارند که می تواند عامل مهمی در پیشرفت مشکلات حاد کبدی بهخصوص سرطان کبد باشند؛ لذا در این مطالعه بر آن شدیم تا با بررسی فیلوژنتیکی HBV بیماران حامل عفونت، ژنو تایپ، زیر ژنوتیپ و موتاسیونهای احتمالی ویروس در گردش مابین جمعیت استان آذربایجان شرقی را به عنوان اولین بار بررسی کنیم. |
| اهداف اختصاصی | ترسیم درخت فیلوژنی HBV بر اساس توالی HBsAg در بیماران مبتلا به HBV مزمن -تعیین ژنوتایپ (ها) و ساب تایپ (های) HBV در بیماران مبتلا به HBV مزمن -تعیین موتاسیون های HBsAg در بیماران مبتلا به HBV مزمن |
| چکیده انگلیسی طرح | In the present study, blood samples of 50 HBsAg positive patients in Tabriz were prepared to evaluate the genotype and subgenotype that circulate among the population of infected patients. Hepatitis B infection is usually defined by serological tests and by examining the presence of virus surface antigen (HBsAg) by ELISA in patients' blood. In this project, the serum sample was isolated from the beginning and through the ELISA technique, the presence of HBeAg and the presence of Anti-HBe and Anti-HBc markers in the serum of infected patients were examined to find the old or current active infection and all samples HBsAg-positive are isolated for further work, and the hepatitis B virus genome is extracted by the extraction kit, and the genome extraction product is collected from all collected samples to determine the presence of HBV-DNA via Nested-PCR due to high specificity and The gold standard method in the world is examined. Patients who are confirmed for the presence of the hepatitis B virus-positive genome by Nested-PCR will be sequenced for the HBsAg gene, which contains 681 nucleotides, by the Sanger method. After sequencing using bioinformatics methods, the genotype and subgenotypes of the virus and possible mutations will be identified and a phylogenetic tree will be drawn for them. |
| کلمات کلیدی | ویروس هپاتیت B: عامل مولد هپاتیت B است و جزء ویروس های کبدی DNA دار طبقه بندی می شود که در خانواده هپادناویریده قرار دارد. بافت هدف این بیماری و میزبان آن محدود است فقط در کبد و گاهی پانکراس و کلیه انسان و میمون را نیز آلوده می کند .این ویروس کوچک، دارای انولپ، حاوی DNA دو رشته ای حلقوی ناقص است. نوکلئوکپسید ویروس پس از ورود به داخل هپاتوسیت ها، بدون تغییر به درون هسته هدایت می شود و در آن جا به DNA حلقوی آزاد شده و به صورت کووالانسی به DNA حلقوی بسته (cccDNA) تبدیل می شود که یک واسطه مهم در همانندسازی بوده و عامل مهمی در عفونت نهفته می باشد. پایداری طولانی مدت مولکول های cccDNA همراه با نیمه عمر بالای سلول های کبدی، حتی با وجود مهار رونویسی و همانندسازی ویروس، عامل مهمی در برقراری عفونت می باشد. ژنوتیپ: اختلاف توالی نوکلئوتیدی > 7.5٪ به عنوان آستانه پیشنهادی برای تمایز ژنوتیپ های HBV تعریف شده است.حدود 10 ژنوتیپ برای HBV مطرح شده است. ساب ژنوتیپ: ژنوتیپ ها خود بر اساس ویژگی ها همچون: اختلاف 4- 7.5% در monophyletic clustering و ارتباط با clade ها به زیر ژنوتیپ های بیشتر طبقه بندی می شوند که تا به امروز بالای 40 ساب تایپ برای در نظر گرفته شده است. |
| ذینفعان نتایج طرح |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| وحدت پورطهماسبی | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| حسین بنازاده باغی | مشاور |
| مهین آهنگر اسکوئی | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| نادر محمدزاده | همکار اصلی |
| فاطمه ابراهیمی | دانشجوی مالک پایان نامه |
| جاوید صادقی | مشاور |
| محمد آهنگرزاده رضایی | مشاور |
| امید قلیزاده | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر بررسی فیلوژنتیکی، تعیین ژنوتایپ و سابتایپ در افراد مبتلا به عفونت هپاتیت B در تبریز طی سال 1400 انجام شد.متن خبر هدف از مطالعه حاضر ایجاد بینش وسیعی در مورد تکامل ویروس هپاتیت HBV) B) در منطقه آذربایجان شرقی، تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک بر اساس توالی پروتئین سطحی ویروس (HBsAg) و تعیین ژنوتیپها و سابتیپهای HBV بود. نتایج حاصل از این تحقیق از اهمیت بالایی برخوردار بوده و میتواند در نظام بهداشت عمومی برای ارتقاء روند پیشگیری، درمان و تشخیص سویههای جهشیافته در اپیتوپهای آنتیژنیک HBsAg که قابلیت فرار از تشخیص را یافتهاند کمک به سزایی کند. در مطالعه حاضر، نمونه سرمی 95 بیمار مبتلا به عفونت مزمن HBV بررسی شدند. نمونهها برای تعیین حضور HBV-DNA از طریق Nested-PCR بررسی شدند. ژن HBsAg تحت توالییابی و آنالیز فیلوژنتیک قرار گرفت. نتایج نشان داد که در مجموع، ژنوتیپ D و سابتیپ ayw2 در استان آذربایجان شرقی، غالب بودند و جهشهای فراوانی در پروتئین HBsAg رخ داده بود. این جهشها میتوانند با توانایی خنثی کردن آنتیبادیها برای اتصال به سطح ویروس تداخل داشته باشند و موجب پیامدهای بالینی قابل توجهی مانند فرار از پاسخ ایمنی ناشی از واکسیناسیون بشوند. با آگاهی از تنوع ژنومی HBV، عملکرد بالینی و نتایج قطعا بهبود خواهند یافت. این موضوع مهم است و پیشنهاد میشود که تحقیقات بیشتری با حجم نمونه بزرگتر انجام شود. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
