بررسی و مقایسه الگوی بیانی میکروآرناهای انتخاب شده (miR-17-5p, miR-29a, miR-106-5p, miR-125a, miR-140-3p, miR-191-5p, miR-200c-3p, miR-339-3p, miR-590-3p, miR-N367) در بیماران مبتلا به HIV، الیت کنترلر ها و بیماران مبتلا به عفونت همزمان HIV/HBV و HIV/HCV.
The assessment and comparison of the expression pattern of selected microRNAs (miR-17-5p, miR-29a, miR-106-5p, miR-125a, miR-140-3p, miR-191-5p, miR-200c-3p, miR-339-3p, miR-590-3p, miR-N367) in HIV-infected patients, Elite controllers, HIV/HBV co-infected patients and HIV/HCV co-infected patients.
مجریان: حسین بنازاده باغی
خلاصه روش اجرا: مطالعه حاضر یک مطالعه مورد-شاهدی با شش گروه موازی ( پنج گروه بیمار و یکی کنترل سالم) می-باشد و جمعیت مورد مطالعه آن در حدود 120 بیمار که به شش گروه تقسیم میگردد. گروه اول بیماران HIV مثبت به تعداد 20 نفر، گروه دوم بیماران الیت کنترلر به تعداد 20 نفر، گروه سوم بیماران HIV مثبت که تحت درمان با داروی ضدویروسی هستند به تعداد 20 نفر، گروه چهارم بیماران دارای عفونت همزمان HIV-HCV به تعداد 20 نفر و گروه پنجم بیماران دارای عفونت همزمان HIV-HBV به تعداد 20 نفر، گروه ششم افراد سالم به تعداد20 نفر میباشد . گرفتن نمونه خون کامل حاوی EDTA و بدون EDTA • سانتریفیوژ خون کامل با دور rpm 3000 برای 5 دقیقه • جداسازی سرم و سلولهای PBMC براساس پروتکل جداسازی فایکول (Ficoll-Hypaque isolation technique) • استخراج RNA توتال از سرم و PBMC جهت شناسایی میکروآرنا های مورد نظر • تعیین غلظت RNA با دستگاه نانودراپ • سنتز cDNA: به دلیل اندازه کوتاه میکروآرناها شناسایی این قطعات کوچک توسط پروتکل های معمول qRT-PCR به سختی انجام پذیر است. برای بلندتر کردن زنجیر کوتاه miRNAها، تمام RNA ابتدا توسط E.colli poly A polymerase (PAP) صاحب یک دم poly-A بلند در سمت 3' خود می شوند. کیت تمام مواد مورد نیاز برای واکنش polyadenylation را فراهم میکند. • تهیه پرایمرهای اختصاصی برای miRNAهای miR-17, miR-29, miR-106, miR-125, miR-140, miR-191, miR-200, miR-339, miR-590, miR-N367 universal reverse primer: اتصال به دم پلی A unique forward primer: برای افزایش اختصاصی ژن مورد نظر به کار رفته و از لحاظ توالی و اندازه مانند miRNA مورد نظر است. • انجام Quantitative real-time RT-PCR به روش سایبرگرین • شمارش سلول های TCD4 بیماران با دستگاه Pima™ CD4 analyser • تفسیر و آنالیز نتایج
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 67213 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی و مقایسه الگوی بیانی میکروآرناهای انتخاب شده (miR-17-5p, miR-29a, miR-106-5p, miR-125a, miR-140-3p, miR-191-5p, miR-200c-3p, miR-339-3p, miR-590-3p, miR-N367) در بیماران مبتلا به HIV، الیت کنترلر ها و بیماران مبتلا به عفونت همزمان HIV/HBV و HIV/HCV. |
| عنوان لاتین طرح | The assessment and comparison of the expression pattern of selected microRNAs (miR-17-5p, miR-29a, miR-106-5p, miR-125a, miR-140-3p, miR-191-5p, miR-200c-3p, miR-339-3p, miR-590-3p, miR-N367) in HIV-infected patients, Elite controllers, HIV/HBV co-infected patients and HIV/HCV co-infected patients. |
| نوع طرح | طرح تحقیقاتی |
| اولویت طرح | روشهای تشخیصی آزمایشگاهی برای بیماریهای واگیر |
| نوع مطالعه | مطالعه مورد/شاهد ( Case - Control ) |
| تحقیق در نظام سلامت | خیر |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | خير |
| مقطع پایان نامه | |
| مدت اجرا - ماه | 8 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | • بررسی میزان بیان میکروآرناهای مورد نظر و ارتباط آنها با فاکتورهای ویروسی، سلولی و بالینی بیماران در جمعیت های مورد نظر می تواند کاربردهای زیادی در درک پاتوژنز این عفونت ها داشته باشد. • بررسی میزان بیان میکروآرناهای مورد نظر در بیماران تحت درمان داروهای ضدویروسی و مقایسه با بیمارن درمان نشده و الیت کنترلر ها می تواند کاربردهای زیادی در پیشرفت روند درمان داشته باشد. • جمعیت الیت کنترلر ها به عنوان یک الگوی مهار کننده عفونت HIV در نظر گرفته می شود و با بررسی جنبه های مختلف این بیماران شاید بتوان برای درمان بیماران مبتلا به HIV از میکروآرنا ها استفاده نمود. • امکان استفاده از این میکروآرناهای در تشخیص و پیگیری درمان بیماران HIV مثبت • احتمال استفاده از این میکروآرناها به عنوان بیومارکرهای زیستی در تمیز افراد HIV مثبت تنها از افراد مبتلا به عفونت همزمان HIV/HCV و HIV/HBV |
| اهداف اختصاصی |
تعیین میزان بیان میکروآرنا های مورد نظر در افراد سالم -مقایسه بیان میکروآرنا های مورد نظر در افراد بیمار و سالم -بررسی ارتباط میزان بیان میکروآرنا های مورد نظر با فاکتورهای ویروسی مانند تعداد ویروس و فاکتورهای میزبانی مانند سن، جنس و تعداد سلول های TCD4 سیستم ایمنی |
| چکیده انگلیسی طرح | Hepatitis C virus (HCV) and hepatitis B virus (HBV) are bloodborne viruses that emerged as the leading cause of mortality and morbidity due to liver cancer in the last two decades. One of the most important viruses that have a common transmission pathway with these agents is the human immunodeficiency virus (HIV). HIV belongs to the Retroviridae family that causes the acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). Additionally, various definitions have been proposed to categorize HIV-infected subjects including those known as viremic progressors (VPs) and long-term non-progressors (LTNP). VPs are HIV-positive patients with low CD4+ T-cell count and high HIV viral load, that progress towards AIDS if they do not receive ART. HIV-related LTNP, including elite controllers (ECs), and viremic controllers, are small subsets of HIV-infected individuals who can control the HIV-1 replication for several years without receiving ART. Without therapy, the viral load and CD4-cell count in the EC group can reach an undetectable level (less than 50 copies/mL) and a normal level (200 -1000 cells/mL), respectively. Co-infections of HCV and/or HBV among HIV carriers are more prevalent due to the common transmission routes. In co-infection, the existence of one virus modifies the natural history of another virus. HIV can accelerate HCV/HBV mediated-liver diseases and hepatitis co-infection management of HIV infection. MicroRNAs (miRNAs) are a class of non-coding regulatory small RNAs of ∼21–25 nucleotides (nt) in length. These agents regulate the gene expression post-transcriptionally, through either translational repression or messenger RNA (mRNA) degradation, over 30% of the genes in humans. Viruses are intracellular parasites that can alter the behavior of host cells by involving in the regulation of cellular processes such as the deregulation of miRNAs. With regard to the interaction between viruses, it is possible that the expression pattern of viral and cellular factors such as microRNAs in the mono-infection will be different from co-infections. Accordingly, the aim of the present study was to examine the expression level of miR-17, miR-29, miR-106, miR-125, miR-140, miR-191, miR-200, miR-339, miR-590, miR-N367 in PBMCs of HIV-1 infected naïve patients, HIV-infected ART patients, Elite controllers, and HBV/HIV coinfected patients and HCV/HIV coinfected patients. Also, the correlation between the expression level of these miRNAs and viral load, and CD4+ T-cell count, was investigated . |
| کلمات کلیدی | • ویروس نقص ایمنی اکتسابی انسان (HIV): نوعی ویروس که با مختل کردن کارکرد و از بین بردن گونهای از سلول های ایمنی مسؤول هماهنگی ایمنی منجر به نقص دستگاه ایمنی بدن انسان شده و عامل بیماری ایدز است. • میکروآرنا: نوعی RNA غیر کد کننده با طول حدود 17- 23 نوکلئوتید که وظیفه اصلی آن در تنظیم پس از رونویسی است؛ و با برهمکنش با mRNA و خاموش کردن آن تولید پروتئین ژن مورد نظر را سرکوب و بعضاً فعال میکند. PCAF: فاکتور مرتبط با P300 / CBP که همچنین به عنوان لیزین استیل ترانسفراز2B نیز شناخته می شود، ژن انسانی و کواکتیویتور رونوشت برداری مرتبط با ژن p53 می باشد. ژن کد کننده این پروتئین بر روی کروموزوم سوم (3p24.3) قرار گرفته است و پروتئین Tat ویروس HIV از طریق تعامل با PCAF آپوپتوز را فعال می کند. |
| ذینفعان نتایج طرح |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| حسین بنازاده باغی | مجری اول (اصلی-هیات علمی) |
| جاوید صدری نهند | همکار اصلی |
| محسن موقوفه ئی | همکار اصلی |
| پریسا شیری آقباش | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر بررسی بیان میکروآرناها وارتباط آنها با فاکتورهای ویروسی در درک پاتوژنز بیماران مبتلا به HIV و عفونت همزمان HIV/HCV و HIV/HBVکاربرد دارد.متن خبر ویروس نقص ایمنی اکتسابی انسان (HIV) نوعی ویروس که با مختل کردن کارکرد و از بین بردن گونهای از سلول های ایمنی مسؤول هماهنگی ایمنی منجر به نقص دستگاه ایمنی بدن انسان شده و عامل بیماری ایدز است و میکروآرناها نوعی RNA غیر کد کننده با طول حدود 17- 23 نوکلئوتید هستند که وظیفه اصلی آن در تنظیم پس از رونویسی است که با برهمکنش با mRNA و خاموش کردن آن تولید پروتئین ژن مورد نظر را سرکوب و بعضاً فعال میکند.
با توجه به این نقش میکروآرنا ها در روند های مختلف عفونت HIV و عدم اطلاعات روشن از میزان بیان میکروآرناها و توزیع آنها در جمعیت مختلف مبتلا به HIV و عفونت های همزمان HIV/HCV و HIV/HBV در این تحقیق برآورد میزان بیان این عوامل ژنتیکی و تعیین ارتباط آن با عوامل ویروسی و بالینی مورد بررسی قرار گرفت. پس ازآنکه برآورد میزان بیان این عوامل ژنتیکی و تعیین ارتباط آن با عوامل ویروسی و بالینی مشخص گردید نشان داد که نتایج این طرح می تواند در شناسایی بیومارکرهای تشخیصی در روند بیماری، تمییز گروه های مختلف آلوده به HIV و همچنین بررسی احتمال نقش درمانی برخی از میکروآرنا ها در آینده مورد استفاده قرار بگیرد. |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
