توزیع عناصرمتحرک کاتابولیک آرژینین مرتبط با ژن های arcA وopp-3 در ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین جمع آوری شده از بخش های مراقبت ویژه بزرگسالان بیمارستان سینا در سال1399
Distribution of the arginine catabolic mobile element associated arcA and opp-3 genes among methicillin resistant Staphylococcus aureus isolated from intensive care units, Sina Hospital, 2020
مجریان: محمد آقازاده , آلکا حسنی
خلاصه روش اجرا: خلاصه روش اجرا: در مطالعه ی حاضر 95 نمونه ی مختلف استافیلوکوکوس اورئوس شامل نمونه های (زخم، خون و....) ارجاع داده شده به آزمایشگاه میکروب شناسی بیمارستان سینا تبریز از بیماران بستری در 5 بخش مختلف ICU تهیه می گردد.ایزولاسیون، شناسایی و تعیین هویت ایزوله ها با تست های فنوتیپی معمول صورت می گیرد.الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی نمونه ها به روش کربی بائر و طبق دستورالعمل های CLSI انجام خواهد گرفت.جهت بررسی ریسک فاکتورهای مرتبط با عفونت های MRSA سابقه ی بالینی بیماران بررسی خواهد شد. جهت استخراج DNA از روش CTAB استفاده خواهد شد.پس از استخراج DNA جهت ردیابی ژن mecA ،عناصر متحرک کاتابولیک آرژینین(arc-A ,opp-3)، پروتئین های ادهزین(,fnbB, fnbA, clfB, clfA) و فاکتور های ویرولانس(luk-pv, tst, eta, etb) از PCR استفاده خواهیم کرد.و همینطور جهت ردیابی SCCmec از روشPCR-multiplex استفاده خواهد شد. و در آخرجهت ردیابی ژن های agr از PCR با پرایمرهای اختصاصی استفاده خواهد شد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 66420 |
| عنوان فارسی طرح | توزیع عناصرمتحرک کاتابولیک آرژینین مرتبط با ژن های arcA وopp-3 در ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین جمع آوری شده از بخش های مراقبت ویژه بزرگسالان بیمارستان سینا در سال1399 |
| عنوان لاتین طرح | Distribution of the arginine catabolic mobile element associated arcA and opp-3 genes among methicillin resistant Staphylococcus aureus isolated from intensive care units, Sina Hospital, 2020 |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | مطالعات سلولی- مولکولی و ایمونولوژیک در زمینــه تولید واکسن |
| نوع مطالعه | مطالعات غیر مداخله ای (همبستگی - توصیفی) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | کارشناسی ارشد |
| مدت اجرا - ماه | 12 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | استافیلوکوکوس اورئوس یکی از پاتوژن های مهم در ایجاد بیماری و مرگ و میر در ایران و جهان است. عفونت های ناشی از این پاتوژن در ICU معمولا بشکل سپسیس، پنومونی مرتبط با دستگاه ونتیلاتور و عفونت های ناشی از جراحی می باشند. از آنجایی که ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس حمل کننده ی ACME توانایی های منحصر بفردی مانند تحمل شرایط اسیدی و تحمل سمیت پلی آمین ها را دارند و از بین ژن های مختلف ACME ،فقط حضور ژن speG در نمونه های زخم بررسی شده و تمرکز خاصی بر روی ژن های arc-A وopp-3 صورت نگرفته است این مطالعه با هدف بررسی ژن های arcA وopp-3 در نمونه های مختلف بالینی بدست آمده از بخش های مختلف ICU بیمارستان سینا تبریز انجام خواهد گرفت. از آنجایی که تیپ های SCCmec و agrبر اساس خاصیت و شیوع در مناطق جغرافیایی مختلف متفاوت است و شناسایی انواع غالب در هر منطقه ممکن است کارآیی خوبی داشته باشد و مقایسه ی تیپ های مختلف SCCmec و agr در بین بخش های مختلف ICU تا کنون در ایران و تبریز صورت نگرفته است این مطالعه با هدف تعیین و مقایسه ی تیپ های SCCmec و agr در بین بخش های مختلف ICU بیمارستان سینا تبریزانجام خواهد گرفت. |
| اهداف اختصاصی | جداسازی،تعیین هویت والگوی حساسیت آنتی بیوتیکی ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس از نمونه های بیماران بستری در بخش های مختلف ICU و شناسایی سویه های MRSA -مقایسه ی فراوانی عفونت های MRSAدربین بخش های مختلفICU -تعیین ریسک فاکتورهای مرتبط با عفونت های MRSA در بیماران بستری در ICU -تعیین و مقایسه ی توزیع ژن های کد کننده ی پروتئین های ادهزین ( fnbA, fnbB, clfA, clfB) ،فاکتورهای ویرولانس(luk-pv,tst,eta,etb) و عناصر متحرک کاتابولیک آرژینین(arc-A,opp-3) -تعیین و مقایسه ی تیپ های SCCmecو agrدرایزوله های MRSA |
| چکیده انگلیسی طرح | In the present study, 95 different samples of Staphylococcus aureus, including samples (wounds, blood, etc.) referred to the microbiology laboratory of Sina Hospital in Tabriz, are prepared from patients admitted to 5 different ICU wards. Isolation and identification of isolates is done by routine phenotypic tests. The antibiotic susceptibility pattern of the samples will be performed by Kirby Bauer method according to CLSI instructions. To evaluate the risk factors related to MRSA infections, patients' clinical history is examined. CTAB method will be used for DNA extraction. After DNA extraction to trace mecA gene, catabolic moving elements of arginine (arc-A, opp-3), adhesin proteins (fnbB, fnbA, clfB , clfA) and virulence factors (virulence (luk-pv, tst, eta, etb) We will use PCR. PCR-multiplex method will also be used to detect SCCmec. Finally, PCR with specific primers will be used to detect agr genes. |
| کلمات کلیدی | MRSA : استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین نوعی عفونت مسری باکتریایی است که در برابر آنتی بیوتیک های بیشماری از جمله متی سیلین، آموکسی سیلین، پنی سیلین و اگزاسیلین مقاوم است. این مقاومت باعث سخت تر شدن روند درمان می شود. ACME : یک لوکوس 33 ژنی می باشد که شامل ژن های مهمی برای arc, opp-3,speG است و ایزوله های حمل کننده ی این لوکوس ژنی توانایی های منحصر بفردی مانند تحمل شرایط اسیدی و تحمل سمیت پلی آمین ها دارند. Arc : گروه arc در ACME یک مسیر کامل آرژینین د آمیناز را کد می کند.که در این مسیر L -آرژینین به کربن دی اکسید ، ATP وآمونیاک تبدیل می شود و این امر به بقای باکتری در PH های پایین کمک می کند. Opp-3 : سیستم الیگوپپتید پرمه آز(کدکننده ی سیستم انتقال ABC) در ACME با فرایند هایی مانند جذب مواد مغذی پپتیدی،کوروم سنسینگ،کموتاکسی و انتقال فرمون ها در ارتباط است. SpeG : مقاومت به پلی آمین ها در ایزوله های استافیلوکوکوی اورئوس با پلی آمین -Nاستیل ترانسفراز از speG کد شده بر روی ACME مرتبط است. SCCmec : جزایر ژنومی منحصر به فردی هستند که در انتقال افقی ژن ها ی مقاوم در بین سویه های استافیلوکوکوس نقش دارد.سویه های استافیلوکوکوس اورئوس حساس به متی سیلین(MSSA) با کسب SCCmec تبدیل به MRSA شدند.SCCmec دارای عناصری است که ژن mecA را حمل می کنند که این ژن مسئول مقاومت به متی سیلین می باشد. Agr : یکی از مهم ترین فاکتورهای کنترل کننده در بیان ژن های استافیلوکوکوس اورئوس سیستم agr می باشد.در واقع اپران agr شامل (agrA,agrB,agrC,agrD ) می باشد که بیش از 70 ژن را در استافیلوکوکوس اورئوس تنظیم می کند و کنترل کننده ی بیماری زایی و عفونت های مهاجم آن می باشد. |
| ذینفعان نتایج طرح | با تشخیص نقش عناصر متحرک آرژینین کاتابولیک مرتبط با ژن های arc-A و opp-3 در ویرولانس استافیلوکوکوس اورئوس های مقاوم به متی سیلین، تشخیص و هدف گذاری جهت درمان این ژن ها تسهیل گردیده و از طول مدت بستری شدن بیماری در بخش مراقبت های ویژه کاسته می شود. |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| محمد آقازاده | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| آلکا حسنی | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| محمد آهنگرزاده رضایی | مشاور |
| جاوید صادقی | مشاور |
| محمد یوسف معمار | مشاور |
| مریم زارع نهندی | مشاور |
| پریا شکراللهی | دانشجوی مالک پایان نامه |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر شیوع ژن های مرتبط با ACME در ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس جمع آوری شده از بیماران بستری در بخش های ICU بیمارستان سینا تبریز نسبتا بالا بود.متن خبر به طور کلی ایزوله های حمل کننده ی این لوکوس ژنی توانایی های منحصر بفردی مانند تحمل شرایط اسیدی و تحمل سمیت پلی آمین ها و در نتیجه توانایی زنده ماندن در شرایط سخت محیطی را دارند. از طرفی روند رو به افزایش مقاومت ضد میکروبی، پزشکان را در انتخاب آنتی بیوتیک مناسب برای درمان عفونت های ایجاد شده با مشکلات مختلفی مواجه می کند. زیرا باکتری ها اغلب در مقابل گروه های مختلف آنتی بیوتیک با مکانیسم های مختلف، مقاومت کسب می نمایند. این مسئله به دلیل میزان مرگ و میر، افزایش مدت بستری در بیمارستان و افزایش بار مالی حائز اهمیت می باشد. از مجموع 95 ایزوله ی استافیلوکوکوس اورئوس گردآوری شده از بخش های ICU بیمارستان سینا تبریز 24 ایزوله دارای ژن arcA و 15 ایزوله دارای ژن opp3 بودند. از سوی دیگر وجود ژن های مرتبط با ACME در ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس و ترکیب این ژن ها با فاکتورهای ویرولانس هم چون pvl امکان ایجاد مقاومت چند دارویی و گسترش سریع باکتری را فراهم می سازد. همچنین در مقاومت به آنتی بیوتیک ها بیشترین مقاومت مربوط به اریترومایسین،کلیندامایسین و پنی سیلین بود که نشان دهنده ی عملکرد ضعیف آنها در برابر عفونت های ناشی از استافیلوکوکوس اورئوس در منطقه ی ما می باشد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
