مدل سازی قطعات کوچک متغیرآنتی بادی(scfv) علیه گیرنده۲ فاکتور رشد اندوتلیال عروقی و ارزیابی مدل ساخته شده ومطالعات اینترکش ان ها با رسپتور
Modeling of single chain variable fragmet of antibodies (scFv) against receptor 2 vascular endothelial growth factor and their model validation and study of their interactions with receptor
مجریان: محمد رضا توحیدکیا
خلاصه روش اجرا: مدل سازی ساختار بانرم افزارهای بیوانفورماتیکی :باتوجه به اهمیت بیولوژیکی این انتی بادی وعدم وجود ساختار کریستالوگرافی آن باروش های بیوانفورماتیکی مدل سازی ساختارسه بعدی این انتی بادی طراحی می شود. وبهترین مدل استخراج می شود . اعتبارسنجی وارزیابی مدل شبیه سازی دینامیک مولکولی MD شبیه سازی داکینگ مولکولی به منظور بررسی اینترکش میان پروتئین و رسپتور
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 65956 |
| عنوان فارسی طرح | مدل سازی قطعات کوچک متغیرآنتی بادی(scfv) علیه گیرنده۲ فاکتور رشد اندوتلیال عروقی و ارزیابی مدل ساخته شده ومطالعات اینترکش ان ها با رسپتور |
| عنوان لاتین طرح | Modeling of single chain variable fragmet of antibodies (scFv) against receptor 2 vascular endothelial growth factor and their model validation and study of their interactions with receptor |
| نوع طرح | گرنت پژوهشی |
| اولویت طرح | مطالعات سلولی- مولکولی و ایمونولوژیک در زمینــه تولید واکسن |
| نوع مطالعه | طراحی نرم افزار یا ساختارهای مبتنی بر وب |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | خير |
| مقطع پایان نامه | |
| مدت اجرا - ماه | 18 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | باتوجه به اهمیت کاربرد آنتی بادی منوکلونال علیه گیرنده های فاکتور رشد اندوتلیال عروقی (VEGFR) که یکی از مهم ترین محرک های رگ زایی (Angiogenesis) می باشدو می تواند باعث مهار رشد تومور شود واینکه ساختارسه بعدی ان بدست نیامده است برآن شدیم تا در این تحقیق این انتی بادی ها را مدل سازی کنیم و نحوه واکنش های آن با رسپتور را بررسی کنیم |
| اهداف اختصاصی | بدست آوردن ساختار های سه بعدی آنتی بادی های scfv بدست آمده با روش کتابخانه فاژی -مقایسه وارزیابی کیفیت مدل های پیش بینی شده -شبیه سازی دینامیک مولکولی یا MD مدل های نهایی -شبیه سازی داکینگ مولکولی -شبیه سازی دینامیک مولکولی کمپلکس های برگزیده |
| چکیده انگلیسی طرح | Vascular endothelial growth factor (VEGF) is the most important factor in the physiological process of angiogenesis, which causes tumor growth in cancers. This factor acts by binding to its receptor, which is the vascular endothelium (VEGFR-2), the major regulator of cellular messaging in angiogenesis. Therefore, inhibiting the binding of factor to this receptor through monoclonal antibodies, which is one of the new and targeted methods in the treatment of cancer, can inhibit angiogenesis and stop the growth of cancer cells. In order to counter the limitations of large monoclonal antibodies, smaller fragments of a single antibody chain called scFv are recombinantly constructed. In this study, the obtained scFvs were studied by phage display technique. Considering that before producing a new drug, its structure and function should be evaluated and basically the biological functions of proteins are determined by its structure, so we in the first We modeled the steps of these scFvs with the help of bioinformatics methods and software. We also examined the connection points and how they interact with the receiver with the help of docking simulation |
| کلمات کلیدی | scFv: قطعات کوچک متغیرآنتی بادی VEGFR2:گیرنده2 فاکتور رشد اندوتلیال عروقی Modeling:مدل سازی MD: شبیه سازی دینامیک مولکولی Molecular Docking Simulation :شبیه سازی داکینگ مولکولی |
| ذینفعان نتایج طرح |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| محمد رضا توحیدکیا | مجری اول (اصلی-هیات علمی) |
| الهام ابراهیمی | همکار اصلی |
| میترا خیرآبادی | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر آنتی بادی های اختصاصی VEGFR2 از کتابخانه فاژی جدا و سپس اتصال انها به رسپتور مدل سازی گردید.متن خبر آنژیوژنز به عنوان یک علامت بارز تومور، نقش مهمی در رشد و توسعه سیستم عروق تومور ایفا می کند. شواهد زیادی وجود دارد که نشان می دهد گیرنده فاکتور رشد اندوتلیال عروقی (VEGFR-2)/VEGF-A محور یکی از عوامل اصلی رگزایی و متاستاز تومور است. بنابراین، مهار مسیر سیگنالینگ VEGFR-2 توسط mAb anti-VEGFR-2 می تواند رشد تومور را به تاخیر بیندازد. در این مطالعه، از فناوری نمایش فاژ و پوشش زیستی فاز محلول (SPB) برای جداسازی قطعات متغیر تک زنجیرهای خاص (scFvs) در برابر VEGFR-2 استفاده شد.بر اساس استنتاج از نتایج اتصال مولکولی، scFvs D3، E1، H1، و E9 حوزههای 2 و 3 را روی پروتئین VEGFR-2 شناسایی کردند و رقابت با VEGF-A را برای اتصال به VEGFR-2 نشان دادند. سنجش رقابت تایید کرد که scFvs H1 و D3 می توانند تعامل VEGFR-2/VEGF-A را مسدود کنند. در نتیجه، scFvهای جدید مسدودکننده VEGFR-2 شناسایی شدند که احتمالاً پتانسیل مهار رگزایی را در سلولهای تومور با بیان بیش از حد VEGFR-2 نشان میدهند. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
