Computational explorations to gain insight into the structural features of TNF-α receptor I inhibitors

Computational explorations to gain insight into the structural features of TNF-α receptor I inhibitors


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
چکیده مقاله
چکیده مقاله
نویسندگان
نویسندگان
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: سیاوش دستمالچی , مهدی شریفی , علی اکبر علیزاده , مریم حمزه میوه رود

کلمات کلیدی: TNFR1 · Computational study · 3D-QSAR · GRID/GOLPE · Model building · Docking studies

نشریه: 55363 , 11 , 15 , 2018

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله سیاوش دستمالچی
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی(زیست فناوری)
کد مقاله 64607
عنوان فارسی مقاله Computational explorations to gain insight into the structural features of TNF-α receptor I inhibitors
عنوان لاتین مقاله Computational explorations to gain insight into the structural features of TNF-α receptor I inhibitors
ناشر 4
آیا مقاله از طرح تحقیقاتی و یا منتورشیپ استخراج شده است؟ خیر
عنوان نشریه (خارج از لیست فوق)
نوع مقاله Original Article
نحوه ایندکس شدن مقاله ایندکس شده سطح یک – ISI - Web of Science
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت

خلاصه مقاله
hide/show

TNF-α is a crucial cytokine in the process of inflammatory diseases. The adverse effect of TNF-α is mostly mediated by interaction of TNF-α with TNF-α receptor type I (TNFR1); therefore, discovery of molecules which can bind to TNFR1 preventing TNF-α-receptor complex formation would be of great interest. In the current study, using GRID/GOLPE program, a 3D-QSAR study was conducted on a series of synthetic TNFR1 binders, which resulted in a 3D-QSAR model with appropriate power of predictivity in internal (r2=0.94 and q2LOO=0.74) and external (r2=0.66 and SDEP=0.42) validations. The structural features of TNFR1 inhibitors essential for exerting activity were explored by analyzing the contour maps of the 3D-QSAR model showing that steric interactions and hydrogen bonds are responsible for exerting TNFR1 inhibitory activity. To propose potential chemical entities for TNFR1 inhibition, PubChem database was searched and the selected compounds were virtually tested for anti-TNFR1 activity using the generated model, resulting in two potential anti-TNFR1 compounds. Finally, the possible interactions of the compounds with TNFR1 were investigated using docking studies. The findings in the current work can pave the way for designing more potent anti-TNFR1 inhibitors.

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
سیاوش دستمالچیچهارم
مهدی شریفیاول
علی اکبر علیزادهاول
مریم حمزه میوه رودسوم

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
JICS_10.1007@s13738-018-1440-x.pdf1397/08/223204145دانلود