ارزیابی الگوهای جهانی تنوع ژنتیکی در جمعیت Strongyloides stercoralis تعیین شده توسط توالی های میتوکندریایی: یک مطالعه مروری نظام مند
Assessment of the global paradigms of genetic variability in Strongyloides stercoralis infrapopulations determined by mitochondrial DNA sequences
مجریان: عادل اسپوتین
خلاصه روش اجرا: در این مطاالعه با استفاده از موتورهای جستجوگر مقالات مرتبط با تنوع ژنتیکی انگل استرونژیلوییدس استرکورالیس بین سال های2010 تا 2019 از پایگاه های اطلاعاتی ساده شامل Science Direct ، Scopus ، Google Scholar ، MEDLINE و PubMedمورد شناسایی قرار خواهد گرفت. به منظور مقایسه تنوع ژنتیکی انگل از توالی های ژن cox1 سیتوکروم اکسیداز ثبت شده از بانک جهانی ژنGenBankاستفاده خواهد شد. کلمات کلیدی استخراج شده از MeSH جهت جستجو شامل: “Strongyloides stercoralis”, “canine strongyloidiasis”, “human strongyloidiasis”, “Genetic diversity/Genetic variation”, “Gene migration”, “Population genetic structure”, “Phylogeography”, “Intraspecific variation”, “Genetic polymorphism”, “Mitochondrial Cox1 DNA sequences” خواهند بود. مقاله های دوپلیکیت و مقالاتی غیر از زبان انگلیسی از مطالعه حذف خواهند شد مقالات استخراج شده توسط افراد حاضر در طرح بررسی و پس از تایید به دنبال استخراج نوالی های cox1 با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیک نظیر, Sequencher, MEGA5, DNASP, BIOEDIT, POPARTجهت انجام مطالعات جریان ژنی در کشورهای همسایه، تعیین موتاسیون ها و انالیز های فیلوژنتیکی آنالیز خواهند شد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 64057 |
| عنوان فارسی طرح | ارزیابی الگوهای جهانی تنوع ژنتیکی در جمعیت Strongyloides stercoralis تعیین شده توسط توالی های میتوکندریایی: یک مطالعه مروری نظام مند |
| عنوان لاتین طرح | Assessment of the global paradigms of genetic variability in Strongyloides stercoralis infrapopulations determined by mitochondrial DNA sequences |
| نوع طرح | طرح تحقیقاتی |
| اولویت طرح | غربالگری، اپیدمیولوژی، پیشگیری و مراقبت در بیماریهای نوپدید و بازپدید |
| نوع مطالعه | مطالعات مرور سیستماتیک |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | خير |
| مقطع پایان نامه | |
| مدت اجرا - ماه | 12 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | مطالعه در مورد خصوصیات ژنتیک انگل استرونژیلوئیدس استرکورالیس می تواند اطلاعات ارزشمندی در مورد دینامیک انتقال، تنوع ژنتیکی، موتانت های مقاوم به درمان و مهاجرت ژنی انگل در کشورهای همسایه به منظور اتخاذ روش های درمانی و پیشگیرانه ارایه نماید. |
| اهداف اختصاصی | ترسیم درخت فیلوژنتیک به منظور روابط فیلوژنی و قرابت ژنتیکی ایزوله ها -ترسیم شبکه هاپلوتایپی به منظور نشان دادن روابط شجره ایی ایزوله ها -مشخص کردن شاخص fstبرای نشان دادن ساختار ژنتیک جمعیت و مهاجرت های ژنی |
| چکیده انگلیسی طرح | In this study, we will identify articles related to the genetic diversity of the parasite Strongyloides stercoralis between 2010 and 2019 from simple databases including Science Direct, Scopus, Google Scholar, MEDLINE, and PubMed. To compare the genetic diversity of the parasites, the cox1 cytochrome oxidase gene sequences registered by the GenBank World Bank will be used. The keywords extracted from MeSH for search include: “Strongyloides stercoralis”, “canine strongyloidiasis”, "Human strongyloidiasis", "Genetic diversity / Genetic variation", "Gene migration", "Population genetic structure ”,“ Phylogeography ”,“ Intraspecific variation ”,“ Genetic polymorphism ”, Will be "Mitochondrial Cox1 DNA sequences". Duplicate articles and articles other than English will be excluded. Articles extracted by those present in the study will be reviewed and approved following cox1 extraction using bioinformatics software such as Sequencher, MEGA5, DNASP, BIOEDIT, and POPART. Neighboring studies in the neighboring countries will identify mutations and phylogenetic analyzes |
| کلمات کلیدی | استرونژیلوئیدس استرکورالیس: نماتود منتقله از طریق خاک و فرصت طلب در افراد با نقص سیستم ایمنی Cox1: ژن سایتوکروم اکسیداز در مطالعات فیلوژنتیکی و ساختار ژنتیک انگل ها به دلیل ماهیت نیمه حفاظت بودن کاربرد فراوانی دارد Fst: شاخص مهاجرت ژنی میکروارگانیسم ها در بین کشورها به منطور نشان دادن راندگی اپیدمیولوژیکی انگلها. |
| ذینفعان نتایج طرح |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| عادل اسپوتین | مجری اول (اصلی-هیات علمی) |
| محمود محامی اسکوئی | همکار اصلی |
| صنم نامی | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر تنوع ژنتیکی بالای انگل استرونژیلوییدس استرکورالیس در جهان وجود دارد.متن خبر استرونژیلوئیدس استرکورالیس یک کرم لوله ایی منتقله از راه خاک می باشد که در افراد نقص سیستم ایمنی سبب کشندگی می شود. بررسی خصوصیات ژنومی این انگل می تواند اطلاعات ارزشمندی در مورد دینامیک انتقال، موتانت های مقاوم به درمان و مهاجرت ژنی انگل در نقاط مختلف جهان نشان دهد.
در این مطالعه مروری نظام مند توالی های میتوکندریایی انگل استرونژیلوییدس استرکورالیس از بانک جهانی ژن استخراج و پس از آنالیزهای بیوانفورماتیکی تنوع ژتتیکی، ساختار ژنتیک جمعیت انگل و مهاجرجت های ژنی آن در بین قاره های مختلف جهان تعیین گردید.
نتایج شاخص fst نشان داد که تنوع ژنتیکی بالایی از این انگل در انسان و جهان در حال گردش است. تفاوت های ژنتیکی بالایی در جمعیت های انگلی در کشورهای شرق آسیا مشاهده شد.
خصوصیات ژنومی این انگل نشان می دهد با توجه وقوع موتاسیون های، روش های درمانی و پیشگیرانه بویژه در افراد با نقص سیستم ایمنی باید اتخاذ شود. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
