مطالعات کامپیوتری جهت شناسایی آگونیست های قوی و انتخابی گیرنده های اسفنگوزین 1-فسفات نوع 1
Computational studies for identification of potent and selective agonists of sphingosine 1-phosphate type 1
مجریان: علی اکبر علیزاده
خلاصه روش اجرا: در مطالعه حاضر ساختار سه بعدی 62 آگونیست گیرنده های S1P1 و S1P3 در نرم افزار HyperChem تولید خواهد شد. این ترکیبات توسط Bolli و همکارانش سنتز شده و اثرات آگونیستی آن بر روی گیرنده های S1P1 و S1P3 اندازه گیری شده است. ترکیبات تولید شده بر روی گیرنده های S1P1 و S1P3 داک شده و بهترین کنفورماسیون به دست آمده از داکینگ برای هر ترکیب شناسایی شده و جهت تولید مدل های QSAR سه بعدی به کار گرفته خواهد شد. مدل های به دست آمده با استفاده از روش های ارزیابی متقاطع داخلی و خارجی و نیز بر اساس میزان خطاهای پیش بینی مورد بررسی قرار خواهند گرفت. جهت شناسایی ترکیبات قوی تر نسبت به ترکیبات مورد مطالعه، با استفاده از ساختار پایه این ترکیبات پایگاه داده ای PubChem جست وجو خواهد شد تا ترکیباتی که از نظر ساختاری شبیه به مولکول های مورد مطالعه هستند به دست آیند. سپس این ترکیبات بر روی گیرنده های S1P1 و S1P3 داک خواهد شد و فعالیت آن ها با استفاده از مدل های QSAR سه بعدی تولید شده پیش بینی خواهد شد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 62634 |
| عنوان فارسی طرح | مطالعات کامپیوتری جهت شناسایی آگونیست های قوی و انتخابی گیرنده های اسفنگوزین 1-فسفات نوع 1 |
| عنوان لاتین طرح | Computational studies for identification of potent and selective agonists of sphingosine 1-phosphate type 1 |
| نوع طرح | گرنت پژوهشی |
| اولویت طرح | مکانیسم سلولی مولکولی اثربخشی فرآوردههای دارویی، ترکیبات بیولوژیک |
| نوع مطالعه | مطالعات علوم پایه (Experimental) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | خير |
| مقطع پایان نامه | |
| مدت اجرا - ماه | 10 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | امروزه کشف و ارزیابی داروهایی که بتوانند در تعدیل پاسخ های ایمنی نقش داشته باشند بسیار ارزشمند است و می توانند در بیماری های ایمنی مانند مالتیپل اسکلروزیس مورد استفاده قرار گیرند. فینگولیمد دارویی است که به عنوان آگونیست S1P1 در درمان مالتیپل اسکلروزیس مورد استفاده قرار می گیرد. از آنجائیکه بیشتر عوارض جانبی داروهای این دسته به اثرات آگونیستی همزمان این داروها بر روی گیرنده های S1P1 و S1P3 نسبت داده می شود، شناسایی ترکیبات آگونیست انتخابی و در عین حال قوی گیرنده S1P1 ضروری به نظر می رسد. |
| اهداف اختصاصی | تولید ساختار سه بعدی ترکیبات و داکینگ مولکولی -ایجاد مدل های سه بعدی QSAR -جست وجوی پایگاه داده ای PubChem |
| چکیده انگلیسی طرح | Sphingosine 1-phosphate type 1 (S1P1) receptors are expressed on lymphocytes and regulate immune cells trafficking. Sphingosine 1-phosphate and its analogues cause internalization and degradation of S1P1 receptors, preventing the auto reactivity of immune cells in the target tissues. It has been shown that S1P1 receptor agonists such as fingolimod can be sitable candidates for treatment of autoimmune diseases. The current study aimed to generate GRIND-based 3D-QSAR predictive models for agonistic activities of 2-imino-thiazolidin-4-one derivatives on S1P1 to be used in virtual screening of chemical libraries. The developed model for the S1P1 receptor agonists will be evaluated from predictivity point of view.The generated model will be used for revealing the important variables affecting the potency and selectivity of these compounds towards S1P1 receptor. To propose potential chemical entities with S1P1 agonistic activity, PubChem chemicals database will be searched and the selected compounds will be virtually tested for S1P1 receptor agonistic activity using the generated model. Moreover, the affinities of the identified compounds towards S1P1 receptor will be evaluated using molecular dynamics simulation. The findings in the current work may be useful for the identification of potent and selective S1P1 receptor agonists with potential use in diseases such as multiple sclerosis. |
| کلمات کلیدی | S1P1: اسفنگوزین 1-فسفات QSAR: مدل بندی کمی ساختار-فعالیت |
| ذینفعان نتایج طرح | ترکیبات معرفی شده در طرح حاضر می توانند گزینه مناسبی برای پژوهشگران در حوضه صنعت باشند تا این ترکیبات را سنتزکرده و مورد ارزیابی های بالینی قرار دهند. در صورتی که این ترکیبات تولید و اثرات آن ها مورد تایید قرار گرفت می توانند در بیماری های اتوایمیون مورد استفاده قرار گیرند. |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| علی اکبر علیزاده | مجری اول (اصلی-هیات علمی) |
| سیاوش دستمالچی | همکار اصلی |
| بهزاد جعفری | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر آگونیست های جدید گیرنده های اسفنگوزین نوع یک شناسایی شدندمتن خبر در مطالعه حاضر با استفاده از ساختار سه بعدی آگونیست گیرنده های S1P1 مدل های پیش بینی به صورت سه بعدی تولید شدند. این مدل ها برای جست و جوی کتابخانه ترکیبات شیمیایی و همچین داروی تایید شده توسط FDA مورد استفاده قرار گرفتند تا از بین آن ها ترکیباتی که امکان اتصال به گیرنده اسفنگوزین نوع یک را دارند شناسایی شوند. نتیجه مطالعه منجر به شناسایی تعدادی ترکیب شیمیایی و چند دارو شد که امکان فعالیت آگونیستی بر روی این گیرنده را دارند. ترکیبات شناسایی شده باید در محیط آزمایشگاه مورد بررسی قرار گیرند تا اثرات آن ها مورد ارزیابی قرار گیرد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
