بررسی بیان و پلی مورفیسمهای ژن IL-23R rs6693831) و rs1884444) در بیماران اسپوندیلیت آنکیلوزان
Evaluation of Expression and Polymorphisms of IL-23R Gene (rs1884444,rs6693831) in Ankylosing Spondylitis
مجریان: توحید کاظمی , مهدی محمودی
خلاصه روش اجرا: 1-گرفتن نمونه خون بیماران AS در لوله حاوی EDTA 2- جداسازی PBMCs با کمک فایکول 3- جداسازی DNA از PBMCs به روش فنول- کلروفرم 4- تعیین خلوص DNA ( اندازه گیری OD نمونهها در 280 و 260 نانومتر توسط nanodrop) 5- ذخیره سازی نمونهها در 20- درجه سانتی گراد 6-طراحی پرایمر جهت بررسی پلیمورفیسم IL23R (rs6693831 وrs1884444) به روش آرمز با نرم افزار آنلاین WASP 7- ست آپ و انجام تکنیک ARMS PCR 8- ارزیابی نتایج PCR برروی ژل آگارز 2% و تهیه عکس از ژل 9- سکانس کردن جهت تایید تکنیک ARMS PCR 10- طراحی پرایمر جهت بررسی بیان ژن به روش Real-Time PCR سایبرگرین 11- استخراج mRNA و سنتز cDNA از سلولهای PBMC 12- بررسی بیان ژن به وسیله تکنیک Real-Time PCR سایبرگرین 13- آنالیز آماری نتایج
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 62415 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی بیان و پلی مورفیسمهای ژن IL-23R rs6693831) و rs1884444) در بیماران اسپوندیلیت آنکیلوزان |
| عنوان لاتین طرح | Evaluation of Expression and Polymorphisms of IL-23R Gene (rs1884444,rs6693831) in Ankylosing Spondylitis |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | ناهنجاریهای ماسکلواسکلتال با تاکید بر کمردرد و دیسکهای گردنی |
| نوع مطالعه | مطالعه مورد/شاهد ( Case - Control ) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | کارشناسی ارشد |
| مدت اجرا - ماه | 18 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | اسپوندیلیت آنکیلوزان (AS) یک بیماری مفصلی پیشرونده، مزمن و خودایمن میباشد که اغلب ستون فقرات و استخوانهای لگن را درگیر میسازد و بیمار به دلیل التهاب و خشکی ستون فقرات ممکن است حالت «خم شدن به جلو» داشته باشد. در این بیماری سلولهای سیستم ایمنی به شناسایی آنتیژنهای خودی میپردازند. این بیماری جزء بیماریهای روماتولوژیکی طبقهبندی میشود (1). عوامل ژنتیکی نقش بسیار مهمی در بروز بیماری AS دارند بهگونهای که ریسک به ارث رسیدن آن در دوقلوهای همسان 63% و در اقوام درجه یک 2/8% میباشد (2). HLA-B27 مهمترین علت ژنتیکی شناخته شده این بیماری است اما ژنهای مستعدکننده دیگری نیز در بروز این بیماری نقش دارند. مطالعات اخیر 25 لکوس ژنی خارج از ناحیه MHC را معرفی کردهاند که با بیماری در ارتباط میباشند. مهمترین ژنهایی که با بیماری در ارتباط بودهاند شامل IL-23R، IL12Rβ، TyK2، IL27، IL6R، RUNX3، ERAP1، ERAP2، CARD9، TNFRSF1A و IL7R میباشند (3). IL23R یک رسپتور سایتوکاینی نوع I است که ژن آن برروی کروموزوم 1p31 قرار گرفته است و پروتئین تولیدی آن با زیرواحد β1 گیرنده IL12 جفت میشود تا رسپتور IL23 ساخته شود. این احتمال وجود دارد که SNPs در IL23R در بیان یا عملکرد آن نقش داشته باشند (4). TGFβ در حضور IL6 منجر به بروز IL23R بر سطح سلول T بکر میشود سپس با اثر IL23 تولید شده توسط سلولهای ایمنی ذاتی منجر به تمایز سلولهای TH17 میگردد که در سیستم ایمنی میتواند بسیار حائز اهمیت باشد (5). مطالعات GWAS نقش پلیمورفیسم در ژن IL23R و ژنهای مسیر پیامرسانی IL23R را در حساسیت به بیماری AS نشان دادهاند (6). یکی از چالشهای بزرگ در فهم پاتوژنز بیماری، مشخص شدن تفاوتهای ژنتیکی در سیستم ایمنی و ارتباط آنها با پاتوژنز بیماری است (7). به همین دلیل مطالعات مختلفی به بررسی SNPهای مرتبط با AS در IL23R و ژنهای مسیر پیامرسانی IL23 پرداختهاند. با توجه به اهمیت پلی مورفیسمهای IL23R در بیماری AS، مطالعات زیادی در این زمینه صورت گرفتهاست. در مطالعه Big Yang و همکاران ارتباط قوی بین پلیمورفیسمهای IL23R (rs6693831 وrs1884444) در جمعیت چینی دیده شد (4). در این پژوهش سعی داریم بیان ژن IL23R و ارتباط پلیمورفیسمهای آن (rs6693831 وrs1884444) با بیماری AS را در جمعیت بیماران ایرانی بررسی کنیم. |
| اهداف اختصاصی | تعیین فراوانی ژنوتیپ‌ها و آلل‌های پلی‌مورفیسمrs6693831 ژن IL23R در بیماران مبتلا به اسپوندیلیت آنکیلوزان و افراد سالم -تعیین فراوانی ژنوتیپ‌ها و آلل‌های پلی‌مورفیسم rs1884444 ژن IL23R در بیماران مبتلا به اسپوندیلیت آنکیلوزان و افراد سالم -مقایسه هاپلوتایپ‌های دو پلی‌مورفیسم rs6693831) و rs1884444) در بیماران AS و افراد سالم - بررسی ارتباط فراوانی ژنوتیپ‌ها و آلل‌های rs6693831 با دیتاهای بالینی بیماران اسپوندیلیت آنکیلوزان ( BASFI, BASDAI, BASMI) -بررسی ارتباط فراوانی ژنوتیپ‌ها و آلل‌های rs1884444 با دیتاهای بالینی بیماران اسپوندیلیت آنکیلوزان ( BASFI, BASDAI, BASMI) -تعیین ارتباط بین بیان ژن IL23R و فراوانی پلی مورفیسم های rs1884444 و rs6693831 |
| چکیده انگلیسی طرح | Ankylosing spondylitis belongs to a group of arthritis conditions that tend to cause chronic inflammation of the spine (spondyloarthropathies). The tendency to develop ankylosing spondylitis is genetically inherited. The HLA-B27 gene can be detected in the blood of most patients with ankylosing spondylitis. |
| کلمات کلیدی | اسپوندیلیت آنکیلیوزان: یک بیماری خودایمنی که با مروز زمان که باعث ایجاد التهاب و درد در ستون فقرات میشود و در نهایت میتواند موجب اتصال مهره ها به هم شود. پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی(SNP): تغییراتی که در توالی اسیدنوکلئیک در یک نوکلئوتید خاص رخ میدهد و فراوانی آن در جامعه بیشتر از 1% میباشد. |
| ذینفعان نتایج طرح | با توجه به ناشناخته بودن مکانیسم بیماریزایی اسپوندیلیت آنکیلوزان، بررسی پلیمورفیسمها و پیدا کردن ارتباط بین آنها و بیماری ممکن است بتواند راهی برای شناخت مکانیسم بیماریزایی و یا تشخیص بیماری فراهم کند. |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| توحید کاظمی | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| عطیه ملتی | دانشجوی مالک پایان نامه |
| مهدی محمودی | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| نویده حق نواز | همکار اصلی |
| نجیبه شکاری | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر چند شکلی ژنی گیرنده سایتوکاین اینترلوکین 23 با اسپ.ندیلیت انکیلوزان ارتباط نداشت.متن خبر یکی از چالشهای بزرگ در فهم پاتوژنز بیماری، مشخص شدن تفاوتهای ژنتیکی در سیستم ایمنی و ارتباط آنها با پاتوژنز بیماری است . به همین دلیل مطالعات مختلفی به بررسی SNPهای مرتبط با AS در IL23R و ژنهای مسیر پیامرسانی IL23 پرداختهاند. با توجه به اهمیت پلی مورفیسمهای IL23R در بیماری AS، مطالعات زیادی در این زمینه صورت گرفتهاست. در این پژوهش بیان ژن IL23R و ارتباط پلیمورفیسمهای آن (rs6693831 وrs1884444) با بیماری AS در جمعیت بیماران ایرانی بررسی شده است. نتیجه مطالعه بر روی ارتباط چند شکلی ژنی در گیرنده اینترلوکین 23 بر روی بیماران مبتلا به اسپوندیلیت انکیلوزان در مقایسه با گروه سالم نشان داد که بین آلل ها و ژنوتی های این پی مورفیسم با استعداد ابتلا به اسپوندیلیت انکیلوزان و نیز اسکورهای بالینی ارتباط آماری معنی داری وجود ندارد. جهت یافتن نتایج مرتبط بالینی، نیاز به مطالعه بر روی مولکول های دیگر در گیر در فرایند بیماری اسپوندیلیت انکیلوزان می باشد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
