شناسایی پپتید های متصل شونده به گیرنده تیروزین کینازیRON با استفاده از روش نمایش فاژی و مدل بندی مولکولی اتصال آنها
Identification of RON Receptor Tyrosine Kinase-Binding Peptides using Phage Display Method and Molecular Modeling of their Binding Mode
مجریان: سیاوش دستمالچی , مریم حمزه میوه رود
خلاصه روش اجرا: هدف از این طرح، شناسایی پپتید(های) متصل شونده به گیرنده تیروزین کینازی RON - که در اغلب سرطان ها بیان بیش از حد داشته و یک هدف بالقوه برای درمان سرطان محسوب میگردد - با استفاده ازروش نمایش فاژی میباشد. چنانچه بتوان یک پپتید که توانایی اتصال به گیرنده مورد نظر را داشته باشد شناسایی کرد، میتوان در آینده از آن به عنوان لیگاندی برای اتصال داروهایی مختلف ضد سرطان جهت هدف درمانی ضد سرطان استفاده نمود. همچنین میتوان، توانایی این پپتید را در جلوگیری از اتصال لیگاند اختصاصی به گیرنده RON و مهار سیگنال داخل سلولی القا شده توسط آن را که در تومورزایی و متاستاز سلول های سرطانی نقش دارد را مورد بررسی قرار داد و آن را کاندیدی برای داروی پپتیدی ضدسرطان معرفی نمود. برای اجرای کار با استفاده از فاژهایی که پپتیدهای 12 اسید آمینه ای با تنوع زیاد را در سطح خود بیان میکنند و پروتئین نوترکیب قسمت خارج سلولی گیرنده RON ویا رده سلولی بیان کننده RON ، به عنوان هدف، فاژهایی که قادر به اتصال به گیرنده RON باشند غربال شده فاژهایی که توانایی اتصال به گیرنده RON را دارند در مراحل مختلف جداسازی و تکثیر شده و افینیتی این فاژ(ها) در اتصال به گیرنده مورد نظر با ELISA مورد ارزیابی قرار میگیرد. سپس توالی پپتید(ها) در فاژ(ها)یی که افینیتی بالاتری نسبت گیرنده دارند مشخص میگردد. در ادامه نحوه اتصال و بر همکنش پپتید(ها)ی انتخاب شده با گیرنده RON با استفاده از روش های مدل بندی مولکولی مورد بررسی قرار میگیرد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا در دانشکده/مرکز |
| کد طرح | 61854 |
| عنوان فارسی طرح | شناسایی پپتید های متصل شونده به گیرنده تیروزین کینازیRON با استفاده از روش نمایش فاژی و مدل بندی مولکولی اتصال آنها |
| عنوان لاتین طرح | Identification of RON Receptor Tyrosine Kinase-Binding Peptides using Phage Display Method and Molecular Modeling of their Binding Mode |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | تولید آنتی بادیهای منوکلونال و پروتئینهای نوترکیب (جنبههای تولیدی و پروتکل درمانی) و واکسن |
| نوع مطالعه | مطالعات علوم پایه (Experimental) |
| تحقیق در نظام سلامت | خیر |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | دکتری تخصصی PhD |
| مدت اجرا - ماه | 36 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | هیچ گزارشی مبنی برشناسایی پپتید متصل شونده به گیرنده RON موجود نیست. |
| اهداف اختصاصی | 1) شناسایی پپتید(ها)ی که قابلیت اتصال به قسمت خارج سلولی گیرنده تیروزین کینازیRON را دارندبا استفاده از روش نمایش فاژی -2) تعیین توالی فاژ(های) انتخاب شده ای که توانایی اتصال به قسمت خارج سلولی گیرنده تیروزین کینازیRON را داشته. -3) مدلبندی مولکولی (molecular modeling) کمپلکس گیرنده- لیگاند برای بررسی کنش متقابل لیگاند با گیرنده |
| چکیده انگلیسی طرح | The aim of this project is to identify peptide(s) that bind to RON tyrosine kinase receptor - which is overexpressed in most cancers and is considered a potential target for cancer treatment - using phage display method. If it is possible to identify a peptide that has the ability to bind to the desired receptor, it can be used as a ligand to bind different anti-cancer drugs for the purpose of anti-cancer treatment. It is also possible to examine the ability of this peptide to prevent the specific ligand from binding to the RON receptor and to inhibit the intracellular signal induced by it, which plays a role in tumorigenesis and metastasis of cancer cells, and introduce it as a candidate for an anticancer peptide drug. The decision to implement the work using phages that express 12-amino acid peptides with great diversity on their surface and the recombinant protein of the extracellular part of the RON receptor or the cell line expressing RON, as the target, phages that are able to bind to the RON receptor are screened, phages that are capable of binding to the RON receptor are screened, and the phages that are capable of binding to the RON receptor are isolated and propagated at different stages, and the affinity of these phage(s) in binding to the desired receptor is evaluated by ELISA. Then the sequence of the peptide(s) is determined in the phage(s) that have a higher affinity to the receptor. Next, the binding and interaction of the selected peptide(s) with the RON receptor will be investigated using molecular modeling methods. |
| کلمات کلیدی | نمایش فاژی: استفاده از باکتریوفاژهای بیان کننده پپتید برای شناسایی پپتیدهای متصل شونده به گیرنده مورد نظر |
| ذینفعان نتایج طرح |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| سیاوش دستمالچی | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| مریم حمزه میوه رود | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| امید زارعی | دانشجوی مالک پایان نامه |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر پپتید متصل شونده به گیرنده تیروزین کینازی RON شناسایی شدمتن خبر این مطالعه منجر به شناسایی و معرفی یک پروتئین کوتاه گردید که می تواند به گیرنده هایی در بدن انسان اتصال یابد و با مهار کردن این گیرنده ها باعث بهبودی سرطان شود. این پروتئین کوتاه همچنین می تواند برای طراحی سیستم های دارو رسانی هدفمند به سلولهای سرطانی استفاده نمود. |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر پپتید متصل شونده به گیرنده تیروزین کینازی RON شناسایی شدمتن خبر این مطالعه منجر به شناسایی و معرفی یک پپتید ۱۲ امینو اسیدی گردید که می تواند به گیرنده تیروزین کینازی RON اتصال یابد. از آنجاییکه این گیرنده در سطح سلولهای سرطانی به مقدار بسیار زیاد بیان می شود، این پپتید می تواند به برای توسعه داروهای ضد سرطانی بر پایه پپتید به کار گرفته شود همچنین می توان ازآن برای طراحی سیستم های دارو رسانی هدفمند به سلولهای سرطانی استفاده نمود. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
