تعیین خصوصیات هات اسپات های درگیر در تشکیل کمپلکس RON-MSP با استفاده از جهش زایی آلانین اسکینگ محاسباتی و شبیه سازی دینامیک مولکولی

Characterizing the Hot Spots Involved in RON-MSPβ Complex Formation Using In Silico Alanine Scanning Mutagenesis and Molecular Dynamics Simulation


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
چکیده مقاله
چکیده مقاله
نویسندگان
نویسندگان
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: امید زارعی , مریم حمزه میوه رود , سیاوش دستمالچی

کلمات کلیدی: Alanine screening; Cancer; Drug design; MSP; Molecular dynamic simulation; RON

نشریه: 952 , 1 , 7 , 2017

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله سیاوش دستمالچی
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی(زیست فناوری)
کد مقاله 60676
عنوان فارسی مقاله تعیین خصوصیات هات اسپات های درگیر در تشکیل کمپلکس RON-MSP با استفاده از جهش زایی آلانین اسکینگ محاسباتی و شبیه سازی دینامیک مولکولی
عنوان لاتین مقاله Characterizing the Hot Spots Involved in RON-MSPβ Complex Formation Using In Silico Alanine Scanning Mutagenesis and Molecular Dynamics Simulation
ناشر 5
آیا مقاله از طرح تحقیقاتی و یا منتورشیپ استخراج شده است؟ بلی
عنوان نشریه (خارج از لیست فوق)
نوع مقاله Original Article
نحوه ایندکس شدن مقاله ایندکس شده سطح یک – ISI - Web of Science
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت http://journals.tbzmed.ac.ir/APB/Abstract/APB_1965_20170227093554

خلاصه مقاله
hide/show

Purpose: Implication of protein-protein interactions (PPIs) in development of many diseases such as cancer makes them attractive for therapeutic intervention and rational drug design. RON (Recepteur d'Origine Nantais) tyrosine kinase receptor has gained considerable attention as promising target in cancer therapy. The activation of RON via its ligand, macrophage stimulation protein (MSP) is the most common mechanism of activation for this receptor. The aim of the current study was to perform in silico alanine scanning mutagenesis and to calculate binding energy for prediction of hot spots in protein-protein interface between RON and MSPβ chain (MSPβ). Methods: In this work the residues at the interface of RON-MSPβ complex were mutated to alanine and then molecular dynamics simulation was used to calculate binding free energy. Results: The results revealed that Gln193, Arg220, Glu287, Pro288, Glu289, and His424 residues from RON and Arg521, His528, Ser565, Glu658, and Arg683 from MSPβ may play important roles in protein-protein interaction between RON and MSP. Conclusion: Identification of these RON hot spots is important in designing anti-RON drugs when the aim is to disrupt RON-MSP interaction. In the same way, the acquired information regarding the critical amino acids of MSPβ can be used in the process of rational drug design for developing MSP antagonizing agents, the development of novel MSP mimicking peptides where inhibition of RON activation is required, and the design of experimental site directed mutagenesis studies.

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
امید زارعیاول
مریم حمزه میوه روددوم
سیاوش دستمالچیپنجم

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
APB-7-141.pdf1396/02/23963218دانلود