ارزیابی تاثیر مهار ژن mcr-1 با استفاده از پپتید نوکلئیک اختصاصی در حساسیت به کولیستین در ایزوله ی اشرشیا کلی مقاوم به کولیستین
Evaluation of the inhibition effect of mcr-1 gene using specific peptide nucleic acid in sensitivity to colistin in colistin-resistance Escherichia coli isolates
مجریان: حسین صمدی کفیل , محمد حسین سروش برحقی
خلاصه روش اجرا: افزایش روز به روز مقاومت های آنتی بیوتیکی و ظهور عفونت های میکروبی جدید و نوظهور ضرورت مطالعات جهت شناسایی روش های نوین درمانی و کنترل را افزایش داده است. لذا در این مطالعه تلاش داریم تا با استفاده از ابزارهای نوین ژنتیک و ملکولی راهی برای مهار بیماریزایی و ایجاد عفونت توسط باکتری اشرشیا کلی مقاوم به آنتی بیوتیک کولیستین را فراهم آوریم. لذا در این مطالعه با هدف قرار دادن ناحیه ژنی مرتبط با ژن mcr-1و با استفاده از تکنولوژی پپتید نوکلئیک اسید (PNA) برآن هستیم تا بیان این ژن را بطور کامل مهار نموده و بتوانیم عفونت های آن را کنترل نماییم. لذا توالی پپتید نوکلئیک اختصاصی برای نواحی پروموتوری(محل آغاز رونویسی) و نواحی ژنومی طراحی و سنتز می گردند. روش های انتقال داخل سلولی برای شناسایی بهترین مکانیسم ورود داخل سلولی ارزیابی می گردد و تاثیرPNA بر روی ژن مورد نظر ارزیابی می گردد. همچنین بیان ژن ذکر شده قبل و بعد از استفاده از PNA و طی ترانسفورماسیون داخل سلولی ارزیابی می گردد تا میزان تاثیرگذاریPNA بر روی سلول ها ارزیابی گردد. حساسیت باکتری مورد نظر پس از مهار ژن mcr-1 به روش فنوتیپی مورد ارزیابی قرار می گیرد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا در دانشکده/مرکز |
| کد طرح | 60511 |
| عنوان فارسی طرح | ارزیابی تاثیر مهار ژن mcr-1 با استفاده از پپتید نوکلئیک اختصاصی در حساسیت به کولیستین در ایزوله ی اشرشیا کلی مقاوم به کولیستین |
| عنوان لاتین طرح | Evaluation of the inhibition effect of mcr-1 gene using specific peptide nucleic acid in sensitivity to colistin in colistin-resistance Escherichia coli isolates |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | غربالگری، اپیدمیولوژی، پیشگیری و مراقبت در مقاومتهای میکروبی و عفونتهای بیمارستانی |
| نوع مطالعه | مطالعات علوم پایه (Experimental) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | کارشناسی ارشد |
| مدت اجرا - ماه | 12 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | پپتید نوکلئیک اسید طراحی شده در مطالعه حاضر میتواند به عنوان یک مهار کننده برای ژن mcr-1 به همراه آنتی بیوتیک و کنترل عفونتهای حاصل از اشرشیا کلی های مقاوم به کولیستین بلاخص در عفونت های ادراری و روند درمان کاربرد داشته باشد. |
| اهداف اختصاصی | هدف اختصاصی اول: طراحی بیوانفورماتیک نوکلئیک اسید اختصاصی بر علیه ژن mcr-1مرتبط با مقاومت داروئی در اشریشیا کلی . -ارزیابی تاثیر PNA طراحی شده بر روی بیان ژن mcr-1 در اشریشیا کلی -ارزیابی تاثیر PNA طراحی شده به همراه آنتی بیوتیک بر حساسیت سویه های مقاوم به کولیستین به روش MIC |
| چکیده انگلیسی طرح | The increasing antibiotic resistance and the emergence of new and emerging microbial infections have increased the need for studies to identify new treatment and control methods. Therefore, in this study, we are trying to provide a way to inhibit the pathogenesis and infection of colistin-resistant Escherichia coli bacteria using new genetic and molecular tools.Therefore, in this study, by targeting the gene region related to the mcr-1 gene and using peptide nucleic acid (PNA) technology, we aim to completely inhibit the expression of this gene and be able to control its infections. Therefore, specific nucleic acid peptide sequences are designed and synthesized for the promoter regions (transcription start site) and genomic regions.Intracellular delivery methods are evaluated to identify the best mechanism of intracellular entry and the effect of PNA on the target gene is evaluated. Also, the expression of the mentioned gene is evaluated before and after the use of PNA and during intracellular transformation to assess the effectiveness of PNA on the cells. The sensitivity of the target bacteria is evaluated phenotypically after inhibition of the mcr-1 gene. |
| کلمات کلیدی | Peptide nucleic acid (PNA): این مولکول، دایمری از اسیدنوکلئیک و پپتید است و به همین علت تحت عنوان پپتید نوکلئیک اسید نامیده میشود، ازلحاظ ساختاری شبیه نوکلئیک اسید و ازلحاظ خواص شیمیائی شبیه پروتئین میباشد. آنتی سنس: به رشته DNA که به عنوان الگو برای سنتز RNA قرارمیگیرد، رشته آنتی سنس (رشته غیرکدکننده) و به رشته مقابل آن در مولکول DNA، رشته سنس (رشته کد کننده)گفته میشود. اشرشیا کلی: اشریشیا کلی باکتری میله ای شکل، گرم منفی، بی هوازی اختیاری و در خانواده ی انتروباکتریاسه ها می باشد پاتوتیپ: زیرگونهای از میکروارگانیسم ها که ازلحاظ بیماریزایی (بهویژه دامنهی میزبانی) متمایز باشد. کولی سیتین: یک آنتی بیوتیک لیپوپپتیدی می باشد که بر روی غشای سیتوپلاسمی باکتری های گرم منفی (انتروباکتریاسه ها) تاثیر گذاشته و باعث نشت محتویات داخل سلولی باکتری به بیرون و مرگ باکتری می شود. mobilized colistin resistance-1 (mcr-1): یک ژن قابل انتقال بین باکتری ها که قدرت فسفاتیدیل اتانول آمین ترانسفرازی دارد و باعث تغییر در لیپید A غشای سلولی باکتری و بروز مقاومت داروئی می گردد. |
| ذینفعان نتایج طرح | با توجه به موضوع طرح نتایج این تحقیق می تواند به عنوان امیدی برای مهار عفونت های حاصل از این گونه باکتریها بوده و مورد استفاده داروسازان ، متخصصان بیماری های عفونی و سایر سیستم های بهداشتی قرار گیرد. |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| حسین صمدی کفیل | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| محمد حسین سروش برحقی | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| محمد آهنگرزاده رضایی | مشاور |
| رضا قوطاسلو | مشاور |
| طاهره پیرزاده | مشاور |
| جواد نژادی | دانشجوی مالک پایان نامه |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر میان چگونگی مقاومت به آنتی بیوتیک کولیستین در باکتری های منطقه ما و جهان تفاوت وجود داردمتن خبر این مطالعه به ارزیابی مکانیسم های مقاومت به نوعی از آنتی بیوتیک به نام کولیستین پرداخت که در این مطالعه روش های شایع بروز مفاومت مورد ارزیابی قرار گرفت و یافته ها حامی از تفاوت در مکانیسم مقاومت میان باکتری های موجود در منطقه ما با سایر نقاط جهان داشت و در واقع روش های شایع بروز مفاومت به این نوع از آنتی بیوتیک ها در سایر نقاط جهان هنوز در منطقه ما شایع نشده اند لذا باید مراقبت های زیادی صورت گیرد تا چگونگی مقاومت در سایر نقاط جهان در منطقه ما وارد نشود و منسا خطر برای ما نگردد. |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر میان چگونگی مقاومت به آنتی بیوتیک کولیستین در باکتری های منطقه ما و جهان تفاوت وجود داردمتن خبر این مطالعه به ارزیابی مکانیسم های مقاومت به نوعی از آنتی بیوتیک به نام کولیستین پرداخت که در این مطالعه روش های شایع بروز مفاومت مورد ارزیابی قرار گرفت و یافته ها حامی از تفاوت در مکانیسم مقاومت میان باکتری های موجود در منطقه ما با سایر نقاط جهان داشت و در واقع روش های شایع بروز مفاومت به این نوع از آنتی بیوتیک ها در سایر نقاط جهان هنوز در منطقه ما شایع نشده اند لذا باید مراقبت های زیادی صورت گیرد تا چگونگی مقاومت در سایر نقاط جهان در منطقه ما وارد نشود و منسا خطر برای ما نگردد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر میان چگونگی مقاومت به آنتی بیوتیک کولیستین در باکتری های منطقه ما و جهان تفاوت وجود داردمتن خبر این مطالعه به ارزیابی مکانیسم های مقاومت به نوعی از آنتی بیوتیک به نام کولیستین پرداخت که در این مطالعه روش های شایع بروز مفاومت مورد ارزیابی قرار گرفت و یافته ها حامی از تفاوت در مکانیسم مقاومت میان باکتری های موجود در منطقه ما با سایر نقاط جهان داشت و در واقع روش های شایع بروز مفاومت به این نوع از آنتی بیوتیک ها در سایر نقاط جهان هنوز در منطقه ما شایع نشده اند لذا باید مراقبت های زیادی صورت گیرد تا چگونگی مقاومت در سایر نقاط جهان در منطقه ما وارد نشود و منسا خطر برای ما نگردد. |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر میان چگونگی مقاومت به آنتی بیوتیک کولیستین در باکتری های منطقه ما و جهان تفاوت وجود داردمتن خبر این مطالعه به ارزیابی مکانیسم های مقاومت به نوعی از آنتی بیوتیک به نام کولیستین پرداخت که در این مطالعه روش های شایع بروز مفاومت مورد ارزیابی قرار گرفت و یافته ها حامی از تفاوت در مکانیسم مقاومت میان باکتری های موجود در منطقه ما با سایر نقاط جهان داشت و در واقع روش های شایع بروز مفاومت به این نوع از آنتی بیوتیک ها در سایر نقاط جهان هنوز در منطقه ما شایع نشده اند لذا باید مراقبت های زیادی صورت گیرد تا چگونگی مقاومت در سایر نقاط جهان در منطقه ما وارد نشود و منسا خطر برای ما نگردد. |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
