مقایسه میزان شیوع تیپ های CRISPR\Cas در انتروکوکوس فکالیس های جداشده از عفونتهای بالینی بیمارستان های آموزشی و درمانی امام رضا (ع) و کودکان تبریز، ارتباط آنها با مقاومت آنتی بیوتیکی، ویرولانس و ارزیابی اثر سیستم CRISPR\Cas بر مقاومت آنتی بیوتیکی به ونکومایسین و آمینوگلیکوزیدها
Comparison of the prevalence of CRISPR/Cas systems among Enterococcus faecalis strains isolated from clinical specimens of teaching and treatment hospitals of Emam Reza and pediatric of Tabriz, their association with antibiotic resistance and virulence factor and evaluation of CRISPR/Cas system’s effect on the antibacterial resistance against vancomycin and aminoglycosides
مجریان: حسین صمدی کفیل , محمد آقازاده
خلاصه روش اجرا: گسترش مقاومت های آنتی بیوتیکی و ظهور عفونت های میکروبی جدید ضرورت مطالعات جهت شناسایی روش های نوین درمانی و کنترل را افزایش داده است. لذا مطالعه حاضر بر آن است تا با استفاده از یافته های نوین ژنتیک و ملکولی به ارزیابی مکانیسم های دخیل در بیماریزایی و ایجاد عفونت توسط گونه ای از باکتری ها بنام انتروکوکوس فکالیس بپردازد. لذا در این مطالعه به ارزیابی نقش مکانیسم ژنتیکی Crisper /cas در میزان بیماری زایی و مقاومت آنتی بیوتیکی باکتری پرداخته و ارتباط بین بیان این ژن ها و ژن های ویرولانس و مقاومت آنتی بیوتیکی می پردازد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 59850 |
| عنوان فارسی طرح | مقایسه میزان شیوع تیپ های CRISPR\Cas در انتروکوکوس فکالیس های جداشده از عفونتهای بالینی بیمارستان های آموزشی و درمانی امام رضا (ع) و کودکان تبریز، ارتباط آنها با مقاومت آنتی بیوتیکی، ویرولانس و ارزیابی اثر سیستم CRISPR\Cas بر مقاومت آنتی بیوتیکی به ونکومایسین و آمینوگلیکوزیدها |
| عنوان لاتین طرح | Comparison of the prevalence of CRISPR/Cas systems among Enterococcus faecalis strains isolated from clinical specimens of teaching and treatment hospitals of Emam Reza and pediatric of Tabriz, their association with antibiotic resistance and virulence factor and evaluation of CRISPR/Cas system’s effect on the antibacterial resistance against vancomycin and aminoglycosides |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | مقاومت های میکروبی |
| نوع مطالعه | مطالعات علوم پایه (Experimental) |
| تحقیق در نظام سلامت | خیر |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | دکتری تخصصی PhD |
| مدت اجرا - ماه | 24 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | مطالعه حاضر به ارزیابی نقش حضور CRISPR\Cas در انتروکوکوس فکالیس های جدا شده از عفونتهای بالینی پرداخته و اثر آن را به عنوان یک مهار کننده برای کنترل عفونت و کاهش مقاومتهای انتروکوکوس فکالیس در عفونتهای دندانی و بیمارستانی ارزیابی می نماید تا به عنوان ابزاری نوین در طی پروسه های درمانی در آینده کاربرد داشته باشد. |
| اهداف اختصاصی | شناسایی و تعیین هویت انتروکوکوس فکالیس جدا شده از عفونتهای بالینی و انجام تست حساسیت آنتی­ بیوتیکی به روش کربی بایر -بررسی تشکیل بیوفیلم در انتروکوکهای جدا شده از عفونتهای بالینی -ارزیابی حضور ژنهای فاکتورهای ویرولانس انتروکوکوس فکالیس جدا شده از عفونتهای بالینی -بررسی ژنهای مقاومت به آنتی ­بیوتیکها -بررسی حضور لوکوس ژنی CRISPR/Cas در نمونه­ های ایزوله شده و تعیین ارتباط حضور آن با ژنهای ویرولانس و مقاومت آنتی­ بیوتیکی -طراحی و انتقال پلاسمید حاوی CRISPR/Cas9 مهندسی شده به سویه ­های دارای ژن مقاومت به ونکومایسین و آمینوگلیکوزید جهت بررسی تغییرات مقاومت آنتی­ بیوتیکی به ونکومایسین و آمینوگلیکوزید |
| چکیده انگلیسی طرح | The spread of antibiotic resistance and the emergence of new microbial infections have increased the need for studies to identify new treatments and controls. Therefore, the present study aims to evaluate the mechanisms involved in pathogenesis and infection by a species of bacteria called Enterococcus faecalis using new genetic and molecular findings. Therefore, in this study, the role of Crisper / cas genetic mechanism in pathogenicity and antibiotic resistance of bacteria is evaluated and the relationship between the expression of these genes and virulence genes and antibiotic resistance is investigated. |
| کلمات کلیدی | انتروکوکوس فکالیس: یکی از باکتریهای گرم مثبت کامنسال روده انسان هستند که باعث عفونتهای فرصت طلب بالینی و مقاوم به چند دارو در انسان می شود. Multi-drug resistant (MDR): مقاومت به چند خانواده از آنتی بیوتیکها است. سیستم CRISPR\Cas: سیستم دستجات منظم متقاطع کوتاه پالیندرومی تکراری (CRISPR; Clustered Regularly interspaced Short Palindromic Repeats) همراه با پروتئین های مرتبط با CRISPR (Cas; CRISPR-associated proteins)، سیستم ایمنی اکتسابی یوباکتری ها و آرکه آ باکتری هاست. این سیستم، ارگانیسم ها را در برابر DNAهای خارجی بالقوه خطرناک مانند عناصر ترانسپوزونی، فاژها و پلاسمیدها مصون می¬دارد. بیوفیلم (Biofilm): بیوفیلم ها اجتماعات باکتریایی هستند که به سطوح زنده یا غیرزنده متصل میشوند و در مقاومت باکتریها به شرایط سخت محیطی بسیار مؤثر میباشند. |
| ذینفعان نتایج طرح | با توجه به موضوع طرح نتایج این تحقیق می تواند به عنوان امیدی برای مهار عفونت های این باکتری بوده و مورد استفاده داروسازان و دندان پزشکان و سایر سیستم های بهداشتی قرار گیرد. |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| حسین صمدی کفیل | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| محمد آقازاده | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| رضا قوطاسلو | مشاور |
| محمد آهنگرزاده رضایی | مشاور |
| پوریا قلیزاده | دانشجوی مالک پایان نامه |
| طاهره پیرزاده | مشاور |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر سیستم CRISPR-Cas بر فاکتورهای ویرولانس و مقاومت آنتی بیوتیکی باکتری ها اثر داشتمتن خبر سیستم CRISPR-Cas باعث مقاومت باکتری ها در برابر DNA مهاجم مانند پلاسمیدها، ترانسپوزونها و باکتریوفاژها می گردد. طی مطالعات قبلی انجام شده، این سیستم با فاکتورهای بیماریزایی باکتری انتروکوکوس فکالیس ارتباط خاصی ندارد ولی با حساسیت به آنتی بیوتیکها در این باکتری ارتباط مستقیم دارد. در این مطالعه ارتباط حضور ژن های بیماریزا و مقاومت آنتی بیوتیکی و کریسپر ها به روش ملکولی ارزیابی شد. همچنین، با طراحی پلاسمید حاوی این سیستم، مقاومت به ونکومایسین و جنتامیسین در باکتری انتروکوکوس فکالیس از میان رفت. نتایج نشان داد ارتباط معنی داری بین حضور ژن های کریسپر و ژن های بیماریزا وجود ندارد ولی با ژن های مقاومت ارتباط معکوس دارد. استفاده از پلاسمید کریسپر در از میان بردن مقاومت میکروبی موفقیت آمیز بود. بدین ترتیب امید است با استفاده از این سیستم، بتوان تغییراتی موثری در ژنوم باکتری ها ایجاد کرد و همچنین، درمانی موثر برای عفونتهای باکتریایی مقاوم به چند دارو را طراحی کرد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
