بررسی متیلاسیون پروموتور ژن miR137 ، برای تشخیص زودرس تومورهای کولورکتال در مدفوع افراد مبتلا به این بیماری
Analysis of promotor methylation in miR137 gene for early detection of colorectal tumors in stool of patients with colorectal cancer.
مجریان: فرشاد مهدوی
خلاصه روش اجرا: سرطان کولورکتال یکی از رایج ترین سرطان ها در دنیا می باشد که با متوسط مرگ ومیر سالیانه 50000 نفر خود را به عنوان دومین سرطان کشنده در جهان مطرح کرده و آمار رو به رشدی نیز در ایالات متحده آمریکا وسراسر جهان دارد. همچنین گزارشات اپیدمیولوژی نشان داده است که بروز CRC ((colorectal cancer در میان ایرانیان به شدت افزایش یافته و به عنوان چهارمین سرطان رایج در میان هر دو جنس تخمین زده شده است. از تغییرات اپی ژنتیکی، به خصوص هایپرمتیلاسیون DNA ، می توان برای تشخیص زودرس زخم هایی که هنوز بدخیم نشده اند از جمله پولیپ های آدنوماتوز کولون استفاده کرد. علاوه بر کاربرد آنها به عنوان بیومارکرهای تشخیصی ، تغییرات اپی ژنتیکی، مانند بیومارکرهایی که میزان پاسخ به شیمی درمانی های خاص را نشان می دهند، می تواند نوید پیش بینی پیش اگهی (prognose ) سرطان را بدهد. در مورد سرطان کولورکتال ، اخیرا ژنهای بیومارکر مختلفی از این نوع مشخص شده اند که شاید بتوانند به عنوان بیومارکرهای نویدبخش تشخیصی عمل کنند. miR137 . در آگاهی از آغاز، پیشرفت و متاستاز کانسر کولورکتال و رسیدن به تشخیص سریعتر و درمان به موقع می¬تواند مفید باشد. بنا بر این در پروژه ی حاضر، هدف ما مشخص کردن یک سری از مارکرهای کاربردی متیلاسیون برای تشخیص زودرس CRC ، از طریق مقایسه ی سطح متیلاسیون این ژنها در نمونه های مدفوع با نمونه های مدفوع افراد کنترل در 50 بیمار مبتلا به این سرطان به واسطه ی روش بیسولفیت(Bisulphite) در این روش مقدار معینی از DNA استخراج شده که در عموم کیت ها 2تا5 میلی گرم است با توجه به مراحل توصیه شده در کیت به مدت 24 ساعت در معرض سدیم بی سولفیت قرار می گیرد سپس با استفاده از مواد مخصوص این DNA تیمار شده با استفاده از ستون های کروکاتوگرافی ویژه درون کیت جدا می شوند لازم به ذکر است که تیمار با بی سولفیت باعث تغییر سیتوزن های غیرمتیله موجود در جزایر CpG به تیمین می شود و این تغییرات در بررسی های بعدی که در این مطالعه روش و به دنبال آن با روش های گوناگون که در این مطالعه روش (MS-Sequencing Direct Sequencing) است مورد بررسی قرار می گیرد . در این روش پس از مشخص شدن ناحیه مورد بررسی با استفاده از روش های بیو انفورماتیک ، با استفاده از نرم افزار methPRIMER پرایمر های ویژه برای تکثیر ناحیه درگیر طرای و محصول حاصل جهت بررسی تغییرات حاصل از تیمار با بی سولفیت به توالی یابی ارسال می گردد. از آنجایی که نژاد و محیط معمولا در تنظیمات اپی ژنتیکی موثر هستند، در این مطالعه چون نمونه های تومورال و سالم هر دو از یک فرد گرفته می شوند، نقش مداخله گر نژاد و محیط حذف شده است.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا در دانشکده/مرکز |
| کد طرح | 59828 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی متیلاسیون پروموتور ژن miR137 ، برای تشخیص زودرس تومورهای کولورکتال در مدفوع افراد مبتلا به این بیماری |
| عنوان لاتین طرح | Analysis of promotor methylation in miR137 gene for early detection of colorectal tumors in stool of patients with colorectal cancer. |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | پیشگیری و اپیدمیولوژی سرطان های شایع |
| نوع مطالعه | مطالعه مورد/شاهد ( Case - Control ) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | دکتری عمومی |
| مدت اجرا - ماه | 12 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | کانسر کولورکتال از جمله کشنده ترین و شایع ترین کانسرهای شناخته شده می باشد.ازین رو شناخت روش های تشخیصی و درمانی بهتر از جمله اهداف و اولویت های پژوهشی می باشد. لذا در این مطالعه با این هدف به دنبال بررسی متیلاسیون پروموتور ژن miR137 ، برای تشخیص زودرس تومورهای کولورکتال در مدفوع افراد مبتلا به این بیماری هستیم. |
| اهداف اختصاصی | مقایسه الگوی متیلاسیون پروموتر ژن miR137 در نمونه بافت توموری و بافت نرمال در بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال |
| چکیده انگلیسی طرح | Colorectal cancer is one of the most common cancers in the world, with an average death toll of 50,000 annually being the second deadliest cancer in the world, with increasing numbers in the United States and around the world. Epidemiological reports have also shown that the incidence of colorectal cancer among Iranians has increased dramatically and is estimated to be the fourth most common cancer among both sexes. Epigenetic changes, particularly DNA hypermethylation, can be diagnosed Early ulcers that have not yet been malignant, including colon adenomatous polyps, can be used in addition to their use as diagnostic biomarkers, epigenetic alterations, such as biomarkers that show a response to specific chemotherapy, Prognosis of cancer.In colorectal cancer, several biomarker genes of this type have recently been identified that may serve as promising diagnostic biomarkers. miR137. It can be helpful to be aware of the onset, progression and metastasis of colorectal cancer and to achieve faster diagnosis and timely treatment. Therefore, in the present project, we aimed to identify a set of functional methylation markers for early detection of CRC by comparing the methylation level of these genes in stool samples with those of control subjects in 50 patients with this cancer. Bisulphite followed by MS-Sequencing (Bisulfite Direct Sequencing). |
| کلمات کلیدی | هیپرمتیلاسیون : تغییرات اپی ژنتیکی که در ناحیه پروموتر ژن های گوناگون اتفاق می افتد و شامل قرار گرفتن گروه متیل روی سیتوزین های جزایر CpG می باشد؛ نقش مهمی در ایجاد سرطان ایفا می کند. CRC : یکی از سرطان های شایع دستگاه گوارش که دومین سرطان کشنده در بین تمام سرطان ها است. MCRC : سرطان کولورکتال دارای متاستاز Sequencing ( Bisulfite Direct Sequencing ) MS : روشی مولکولی که به واسطه آن هر گونه تغییر در توالی DNA قابل شناسایی بوده و نیز توانایی بررسی متیلاسیون نمونه های مختلف را دارا است. |
| ذینفعان نتایج طرح | بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال ، انکولوژییست ها و پژوهش گران این حوزه |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| فرشاد مهدوی | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| سعید پاکروان | دانشجوی مالک پایان نامه |
| میلاد اسدی | همکار اصلی |
| حمیده اشرفی | همکار اصلی |
| ونوس ظفری | همکار اصلی |
| مجید خلیلی | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر نقش عوامل مولکولی در کنار عوامل محیطی در احتمال ابتلا به سرطان های روده بزرگمتن خبر سرطان کولورکتال یکی از شایعترین سرطان های درگیر کننده و درواقع سومین سرطان شایع می باشد که همانند تمامی سرطان های دیگر دارای 2 نوع خانوادگی و تک گیر است. با توجه به شیوع روز افزون سرطان های روده بزرگ ، بر آن شدیم که نقش یکی از عوامل مولکولی مرتبط با این بیماری تحت عنوان میکرو RNA137 را در جامعه شمال غرب ایران مورد بررسی قرار دهیم. از نمونه مدفوع 40 فرد مبتلا به این بیماری و 40 فرد سالم جهت این مطالعه استفاده شد.میزان بیان ژن(تولید پروتئین مرتبط با ژن ) این میکروRNA در نمونه های مدفوعی ارزیابی شد. نتیجه حاصله قابل قبول بود و کاهش تولید این میکرو RNA در نمونه های مدفوعی بیماران اثبات شد و با توجه به قابل ارزیابی بودن تغییرات مولکولی بسیار قبل تر از ابتلا به خود بیماری ، میتوان جهت پیش گیری یا تشخیص زودتر ار موعد موارد احتمالی بیماری اقدام نمود. |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر نقش متیلاسیون پروموتور ژن micro RNA137 در احتمال ابتلا به سرطان کولورکتالمتن خبر سرطان کولورکتال یکی از شایعترین سرطان های درگیر کننده و درواقع سومین سرطان شایع می باشد که همانند تمامی سرطان های دیگر دارای 2 نوع خانوادگی و تک گیر است. با توجه به شیوع روز افزون سرطان های روده بزرگ ، بر آن شدیم که نقش یکی از عوامل مولکولی مرتبط با این بیماری تحت عنوان میکرو RNA137 را در جامعه شمال غرب ایران مورد بررسی قرار دهیم.نقش این میکروRNA در ابتلا به سرطان کولون طی مطالعات اخیر انجام شده با نمونه نسجی کولون بیماران مبتلا اثبات شده است و حاکی از نقش تومورساپرسوری این میکرو RNA می باشد. در مطالعه حاضر از نمونه مدفوعی 40 فرد مبتلا و 40 فرد سالم به عنوان گروه کنترل استفاده شد تا به جای نمونه نسجی در نمونه های مدفوعی نیز احتمال کاهش این میکرو RNA بررسی گردد. نتیجه حاصله از مطالعه روی نمونه های مدفوع تفاوت چندانی با مطالعات نسجی نداشت و حاکی از کاهش بیان ژن این میکروRNA در نمونه های مدفوعی بود.با توجه به قابل ارزیابی بودن تغییرات مولکولی بسیار قبل تر از ابتلا به خود بیماری ، میتوان جهت پیش گیری یا تشخیص زودتر از موعد موارد احتمالی بیماری از طریق آنالیز سریال نمونه مدفوع اقدام نمود. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
