بررسی تعداد کپی های رتروویروس اندوژن انسانی (HERV-W) و عناصر L1 retrotransposon ها در مبتلایان به پمفیگوس
Study of the DNA Copy Number and of Human Endogenous and Retrovirus-W (HERV-W) and LINE-1 elements in Pemphigus Volgaris Patients
مجریان: عباس کریمی
خلاصه روش اجرا: برای انجام این پروژه تحقیقاتی 30 بیمار مبتلا به پمفیگوس (بیماران بستری و سرپایی) که بیماری آنها قبلاً با IHC و علائم بالینی تأیید شده است، وارد مطالعه خواهد شد. متناظر با این تعداد افراد کنترل سالم ( همسازی شده از نظر سن و جنس) که هیچ گونه سابقه ای از نظر بیماری های اتوایمیون و PV نداشته باشند 5 سی سی نمونه خون گرفته خواهد شد تا استخراج DNA از آنها به عمل آید. به منظور تعیین ساختار ژن HERV-W در لوکوس های مختلف توالی کامل آنها از UCSC Genome Browser دانلود شده و موقعیت هرکدام از لکوس های HERV مشخص شده و برای توالی کانسنسوس env پرایمر و پروب طراحی خواهد شد. برای عناصرLINE-1، توالی کانسنوسی که در همه 145 L1 فعال مشترک هست مشخص شده و پرایمر و پروب طراحی خواهد شد. جهت بدست آوردن دده های valid برای بررسی تعداد کپی های این عناصر تکراری، متد TaqMan و با روش کمی سازی absulate Real Time PCR تعداد کپی های این عناصر در gDNA مشخص خواهد شد نتایج با تعداد کپی های گروه نرمال مقایسه خواهد شد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 59614 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی تعداد کپی های رتروویروس اندوژن انسانی (HERV-W) و عناصر L1 retrotransposon ها در مبتلایان به پمفیگوس |
| عنوان لاتین طرح | Study of the DNA Copy Number and of Human Endogenous and Retrovirus-W (HERV-W) and LINE-1 elements in Pemphigus Volgaris Patients |
| نوع طرح | گرنت پژوهشی |
| اولویت طرح | بیماری های اتوایمیون (آرتریت روماتوئید و لوپوس اریتماتوز سیستمیک) |
| نوع مطالعه | مطالعه مورد/شاهد ( Case - Control ) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | خير |
| مقطع پایان نامه | |
| مدت اجرا - ماه | 12 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | پمفیگوس گروهی از بیماریهای تاولی داخلی اپیدرمی اتوایمیون مزمن، نادر و کشنده هستند که به علت از دست رفتن چسبندگی بین سلولهای کراتینوسیت در اثر اتوآنتیبادیهای ایجادشده علیه پروتئینهای چسبندگی نظیر دسموگلین 1 و 3 در اپیدرم به وجود میآید. هنوز مکانیسم شکلگیری بیماری بهطور کامل مشخص نشده است. عوامل ژنتیکی و محیطی مختلفی در پاتوژنز PV دخیل هستند. مطالعات اخیر نشان دادهاند ارتباط معنی داری بین میزان بیان mRNA خانوادههای مختلف رتروویروسهای اندوژن انسانی human endogenous retroviruses (HERVs) با اختلالات اتوایمیون و برخی سرطانها وجود دارد. اخیراً نقش این عناصر تکررای (رتروویروسهای اندوژن) در پاتومکانیسم برخی از بیماریهای اتوایمیون پوستی از قبیل پسوریازس، سیستمیک اسکلروزیس، لوپوس اریتماتوس، لیکن پلاک lichen planus، موفه آ و ملانوما بررسی شده است. مطالعات محدودی در خصوص میزان بیان Long Interspersed Nuclear Element 1 Retroelements یا LINE-1 ها در بیماری های اتوایمیون سیستمیک نظیر primary Sjögren's syndrome (SS) انجام شده است. اینکه بیان این عناصر تحت تاثیر عوامل استرس زای خارجی هست یا به خاطر تفاوت در تعداد کپی های این عناصر هنوز در بیماری های اتوایمیون بررسی نشده است. هدف از این مطالعه بررسی تعداد کپی های عناصر L1 یا LINE1 که می توانند تمامیت ژنوم با تنوع ساختاری و ناپایداریهای ژنومی با مکانیسم های مختلف از بین ببرند و همچنین بررسی تعداد کپی های روتروویرس اندوژن انسانی HERV-W – یک لوکوس از HERV-W به ژن ERVWE1 در طول تکامل تغییر یافته و کد کننده پروتئین Syncytin هست که نقش آن پیشتر در بیماری Multiple Sclerosis (MS) مشخص شده است پروتئین Syncytin در شکل گیری بندناف نقش دارد – با استفاده از متد TaqMan® real-time PCR با روش کمی سازی absulate می باشد. با مشخص شدن تعداد کپی های این عناصر تکراری و ارتباط copy number variation(CNV) در سیر پیشرفت بیماری، میتوان تشخیص زودرس بیماری و درمانهای هدف دار نظیر استفاده از آنتی ویرال های داخلی و خارجی برای و بابلاک کردن بیان LINE-1بیماران و پیشگیری در افراد مستعد به پمفیگوس را توسعه داد. |
| اهداف اختصاصی | 1) بررسی تعداد کپی های LINE-1 ها در بیماران نسبت به نرمال ها با آنالیز کمی(مطلق و نسبی) -2) بررسی تعداد کپی های HERV-W در بیماران نسبت به نرمال ها با آنالیز کمی(مطلق و نسبی) -3) بررسی شدت بیماری، سن شروع بیماری و میزان اتوآنتی بادی Dsg1&3 با تغییرات کپی نامبر(CNVs) |
| چکیده انگلیسی طرح | Study of the DNA Copy Number and of Human Endogenous and Retrovirus-W (HERV-W) and LINE-1 elements in Pemphigus Volgaris Patients |
| کلمات کلیدی | HERVs; human endogenous retroviruses Long interspersed nucleotide elements|LINE-1: PV: Pemphigus vulgaris LTR: Long Terminal Repeat |
| ذینفعان نتایج طرح | بیماران مبتلا به بیماری های اتوایمیون تاولی پوستی از قبیل پمفیگوس و سایر بیماری های اتو ایمیون تاولی پوست نظیر پسوریازیس اگزما، مورفه آ، همانژیوما که پاتوژنز مشترک با پمفیگوس دارند. 1- در صورت مشخص شدن CNVs یا تغییرات کپی نامبر در این بیماران، می توان با بررسی تعداد کپی ها در افراد مستعد – که سابقه خانوادگی دارند یا نشانه های اولیه را دارند - اقدام به تشخیص زودهنگام بیماری کرد و اقدامات درمانی را زودتر انجام داد و تا مورتالیتی و کوموربیدیتی را کاهش داد یا اینکه با مشخص شدن تعداد کپی های افراد مستعد می توان اقدامات پیشگیرانه از قبیل کاهش استرس و عدم مواجهه با استرس زا های خارجی و داخلی را به بیماران پیشنهاد کرد. 2- در صورت مشخص شدن یک ارتباط قوی بین تغیرات کپی نامبر این عناصر، می توان مطالعات گسترده ای به ترتیب برای کاهش بیان HERV-W و بلاک کردن بیان L1 ها داروهای (پمادهای) ضدویروسی و مونوکلونال آنتی بادی های بلاک کننده بیان LINE-1 ORF1p انجام داد تا از درد و آلام این بیماری کشنده کاسته شود. |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| عباس کریمی | مجری اول (اصلی-هیات علمی) |
| محمد علی ذوالفقاری | همکار اصلی |
| هومن کهربا | همکار اصلی |
| محمدرضا رنجکش | همکار اصلی |
| سیدابوالقاسم سیادت پناه | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر ویروس قدیمی انسانی HERV-W باعث بیماری پمفیگوس وولگاریس می شودمتن خبر بیماری پمفیگوس یک بیماری اتوایمیونی بولوس مزمن و بازگشت پذیر است که با تشکیل حباب و زخم های پوستی ناشی از آنتی بادی های IgG و از دست دادن اتصالات سلولی در لایه بیرونی پوست همراه است. توالی های ویروس قدیمی انسان (HERV) و محصولات آنها (RNA، DNA سیتوزولیک و پروتئین ها) می توانند به اتوایمونیته کمک کرده و سیستم ایمنی را تنظیم کنند. در این مطالعه، نسبتاً سطح کپی های DNA محیط HERV-W در بیماران پمفیگوس وولگاریس و افراد سالم مرد و زن ارزیابی شد. نتایج نشان داد که سطح نسبتاً کپی های DNA محیط HERV-W در بیماران به طور قابل توجهی بالاتر از کنترل ها بود. همچنین، تفاوت معناداری بین کپی های محیط HERV-W مردان و زنان بیمار وجود داشت. با توجه به داده های به دست آمده، بین کپی های HERV-W env و پاتوژنز پمفیگوس ارتباط مثبت وجود دارد. |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر ارتباط کپیهای رتروویروس درونزای انسانی (HERV-W) با پمفیگوس ولگاریسمتن خبر ماری پمفیگوس یک بیماری پوستی اتوایمونیتهای است که با تشکیل حباب و زخمهای پوستی همراه است. توالیهای ویروس قدیمی انسان (HERV) و محصولات آنها میتوانند به اتوایمونیته کمک کنند. در این مطالعه با استفاده از qPCR سطح کپی DNA محیط HERV-W در سلولهای خون محیطی بیماران پمفیگوس و افراد سالم مرد و زن ارزیابی شد. نتایج نشان داد که سطح کپی DNA محیط HERV-W در بیماران پمفیگوس بالاتر از افراد سالم است. همچنین، تفاوت معناداری بین کپیهای محیط HERV-W مردان و زنان بیمار وجود داشت. در این مطالعه، هیچ رابطهای بین تعداد کپیهای محیط HERV-W و شروع بیماری یافت نشد. همچنین، هیچ رابطهای بین تعداد کپیهای محیط HERV-W و سطح Dsg1 و Dsg3 در سرم گزارش نشد. به طور کلی، نتایج نشان داد که بین کپیهای HERV-W env و پاتوژنز پمفیگوس ارتباط مثبت وجود دارد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر رابطه مثبت بین رتروویروسهای درونزای انسانی (HERV-W) با پمفیگوس ولگاریسمتن خبر بیماری پمفیگوس یک بیماری خودایمنی حبابدار مزمن است که باعث تشکیل حباب و زخم پوستی می شود. دنباله های ویروس رتروی اندوژن انسانی (HERV) ممکن است در پاتوژنز پمفیگوس دخالت داشته باشد. یک مطالعه بر روی ۳۱ بیمار و شاهد سالم انجام شد که نشان داد سطح نسبی تعداد کپی DNA HERV-W env در بیماران به طور قابل توجه ای بالاتر از شاهدان بود (۱.۶۷±۰.۸۶ در مقابل ۱.۱۷±۰.۷۵) و تفاوت قابل توجه بین تعداد کپی HERV-W env بین بیماران مرد و زن وجود داشت. این نتایج نشان می دهد که تعداد کپی HERV-W env در PBMCs ممکن است به عنوان یک بیومارکر برای پمفیگوس استفاده شود. |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر ارتباط کپی های اندوژن انسانی-W (HERV-W) با پمفیگوس ولگاریسمتن خبر هدف این مطالعه بررسی و مقایسه تعداد کپی DNA HERV-W env در بین بیماران مبتلا به پمفیگوس ولگاریس و شاهدان سالم بود. پمفیگوس یک بیماری خودایمنی حبابدار است که باعث از هم جدا شدن سلولهای پوست میشود. HERV-W env یک دنباله ویروس رتروی اندوژن انسانی است که ممکن است در ایجاد خودایمنی نقش داشته باشد. برای این منظور، سطح نسبی تعداد کپی DNA HERV-W env در سلولهای خون محیطی 31 بیمار و 31 شاهد با استفاده از qPCR اندازه گیری شد. نتایج نشان داد که بیماران سطح بالاتری از تعداد کپی DNA HERV-W env داشتند و این تفاوت در بین جنسها نیز مشاهده شد. همچنین، هیچ رابطهای بین تعداد کپی DNA HERV-W env و شروع بیماری و سطح آنتیبادیهای Dsg1 و Dsg3 در سرم یافت نشد. نتیجه گیری این است که تعداد کپی DNA HERV-W env ممکن است در پاتوژنز پمفیگوس دخالت داشته باشد و به عنوان یک بیومارکر مورد بررسی قرار گیرد. |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
