جریان ژنی جمعیت های اکینوکوکوس گرانولوزوس بر اساس توالی های میتوکندریایی: یک دستاورد مطمئن جهت عرضه رانش اپیدمیولوژیکی انگل در میان کشورهای همسایه

Gene flow for Echinococcus granulosus metapopulations determined by mitochondrial sequences: A reliable approach for reflecting epidemiological drift of parasite among neighboring countries


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
چکیده مقاله
چکیده مقاله
نویسندگان
نویسندگان
دانلود مقاله
دانلود مقاله
دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دانشگاه علوم پزشکی تبریز

نویسندگان: محمود محامی اسکوئی , عادل اسپوتین , عباس شهبازی سیاه اسطلخی , محمد ادیب پور , احسان احمدپور

کلمات کلیدی: Echinococcus granulosus Gene flow Nad1 Cox1 Northwest Iran

نشریه: 55162 , 117 , 2016 , 2016

اطلاعات کلی مقاله
hide/show

نویسنده ثبت کننده مقاله عادل اسپوتین
مرحله جاری مقاله تایید نهایی
دانشکده/مرکز مربوطه مرکز تحقیقات ایمونولوژی
کد مقاله 59299
عنوان فارسی مقاله جریان ژنی جمعیت های اکینوکوکوس گرانولوزوس بر اساس توالی های میتوکندریایی: یک دستاورد مطمئن جهت عرضه رانش اپیدمیولوژیکی انگل در میان کشورهای همسایه
عنوان لاتین مقاله Gene flow for Echinococcus granulosus metapopulations determined by mitochondrial sequences: A reliable approach for reflecting epidemiological drift of parasite among neighboring countries
ناشر 7
آیا مقاله از طرح تحقیقاتی و یا منتورشیپ استخراج شده است؟ بلی
عنوان نشریه (خارج از لیست فوق)
نوع مقاله Original Article
نحوه ایندکس شدن مقاله ایندکس شده سطح یک – ISI - Web of Science
آدرس لینک مقاله/ همایش در شبکه اینترنت http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S001448941630279X

خلاصه مقاله
hide/show

In genetic diversity and population structure of Echinococcus granulosus, the gene flow can illustrate how the Echinococcus isolates have epidemiologically drifted among endemic neighboring countries. 51 isolates of hydatid cysts were collected from human, dog, cattle and sheep in northwest Iran, where placed co-border with Turkey. DNA samples were extracted, amplified and subjected to sequence analysis of NADH dehydrogenase subunit 1 (nad1) and cytochrome oxidase subunit 1 (cox1) genes. As well, sequences of Echinococcus at east to the southeast regions of Turkey were retrieved from GenBank database for the cox1 gene. The confirmed isolates were grouped as G1 (n ¼ 74) and G3 (n ¼ 6) genotypes. 31 unique haplotypes were identified inferred by the analyzed sequences of cox1 among two distinct populations. A parsimonious network of the sequence haplotypes displayed star-like features in the overall population containing TUR1, IR15 and IR22 as the most common haplotypes. According to AMOVA test, the high value of haplotype diversity (0.94758e0.98901) of E. granulosus was reflected the total genetic variability within populations while nucleotide diversity was low (0.00727e0.01046) in Iranian and Turkish metapopulations. Neutrality indices of the cox1 were shown negative values (15.078 to 10.057) in Echinococcus populations which indicating a significant divergence from neutrality. A pairwise fixation index (Fst) as a degree of gene flow was partially high value for all populations (0.151). The statistically Fst value indicates that E. granulosus sensu stricto (G1-G3) are genetically moderate differentiated among Iranian and Turkish isolates. The occurrence of TUR1 and IR15 elucidate that there is possibly the dawn of domestication due to transfer of alleles between populations

نویسندگان
hide/show

نویسنده نفر چندم مقاله
محمود محامی اسکوئیاول
عادل اسپوتینسوم
عباس شهبازی سیاه اسطلخیچهارم
محمد ادیب پورپنجم
احسان احمدپورششم

لینک دانلود مقاله
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
exp par.pdf1395/08/221632632دانلود
Tasviye letter.jpg1395/09/071499211دانلود