: بررسی ارتباط ژنوتیپ های کپسولی، مقاومت آنتی بیوتیکی و فاکتورهای ویرولانس کلبسیلا پنومونیه های جدا شده از نمونه های بالینی شهر تبریز در سال 1396.
Relationship between capsule genotypes, antibiotic resistance and virulence factors in klebsiella pneumoniae isolated from clinical specimens in Tabriz, 1396.
مجریان: آلکا حسنی , محمد آهنگرزاده رضایی
خلاصه روش اجرا: نمونه های کلبسیلا پنمونیه بیماران سرپایی و بستری شده از بیمارستان آموزشی و درمانی سینا تبریز به آزمایشگاه میکروب شناسی دانشکده پزشکی منتقل شده و در محیط های مربوطه کشت داده می شود. جهت شناسایی و تعیین هویت ایزوله های کلبسیلا پنومونیه از تست های استاندارد بیوشیمیایی استفاده می شود. پس از تایید، نمونه ها در لوله های حاوی محیط trypticase soy broth به همراه20% گلیسرول کشت شده و در دمای C °20- برای بررسی های بعدی ذخیره می شوند.در ادامه حساسیت به آنتی بیوتیکی ایزوله ها با روش Kirby – Bauer تعیین خواهد شد. پس از استخراج DNA ژنومی باکتری های جدا شده، با استفاده از پرایمرهای اختصاصی و روش های مولکولی برخی از ویژگی ها مثل تیپ های کپسولی، چند فاکتور ویرولانس و حضور ژن های کارباپنماز در باکتری ها مورد مطالعه قرار خواهند گرفت. پس از انجام PCR محصول های واکنش بر روی ژل آگارز الکتروفورز شده و به کمکSyber safe stain رنگ آمیزی و بررسی خواهند شد در نهایت داده های به دست آمده توسط نرم افزار SPSS19 و روش های آماری کیفی (درصد و فراوانی) تجزیه و تحلیل شده و ارتباط بین مقاومت آنتی بیوتیکی و فاکتورهای ویرولانس ایزوله ها با انواع عفونت های بالینی بررسی خواهند شد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 58664 |
| عنوان فارسی طرح | : بررسی ارتباط ژنوتیپ های کپسولی، مقاومت آنتی بیوتیکی و فاکتورهای ویرولانس کلبسیلا پنومونیه های جدا شده از نمونه های بالینی شهر تبریز در سال 1396. |
| عنوان لاتین طرح | Relationship between capsule genotypes, antibiotic resistance and virulence factors in klebsiella pneumoniae isolated from clinical specimens in Tabriz, 1396. |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | غربالگری، اپیدمیولوژی، پیشگیری و مراقبت در مقاومتهای میکروبی و عفونتهای بیمارستانی |
| نوع مطالعه | مطالعات علوم پایه (Experimental) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | کارشناسی ارشد |
| مدت اجرا - ماه | 12 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | کلبسیلا پنومونیه از پاتوژن های مهم بیمارستانی است که غالبا عامل پنمونی، عفونت محل زخم، خون و عفونت مجاری ادراری می باشد. با وجود اینکه کلبسیلا پنومونیه یکی از مهمترین باکتری های فرصت طلب بشمار می رود اما تاکنون اطلاعات ما در رابطه با مکانیسم بیماری زایی این باکتری کامل نگردیده و هنوز جای بحث دارد. پیش از این در ایران چندین مطالعه به بررسی مقاومت آنتی بیوتیکی یا فاکتورهای ویرولانس پرداخته است اما براساس مقالات منتشر شده اطلاعاتی در رابطه با ارتباط بین این دو وجود ندارد. مطالعات اخیر در رابطه با مکانیسم های مقاومت یا بررسی حضور تنها سروتایپ کپسولی K1,K2 یا K5 و یا مطالعه 3الی 5 فاکتور ویرولانس در نمونه های انسانی و دامی بوده است. در واقع مطالعات گسترده ای در رابطه با این موضوع در آذربایجان صورت نگرفته است لذا با جمع آوری چنین اطلاعاتی در منطقه آذربایجان می توان تا حدودی با خصوصیات اپیدمیولوژیکی ایزوله های بومی آشنا شد و از این اطلاعات در مسیر یافتن راهکارهایی در خصوص پیشگیری و نیز درمان عفونت های مربوطه استفاده نمود. با بررسی فاکتورهای ویرولانس ،سروتیپ های موجود- الگوی مقاومتی آنتی بیوتیکی و با مطالعه مکانیسم های مقاومت ژن های کارباپنماز می توان پزشکان را در ارائه دارویی مناسب برای کنترل و کاهش میزان چسبندگی باکتری ها کمک کرد. لذا وجود یک بانک اطلاعاتی در خصوص مشخصات مولکولی سویه های هر منطقه ضروری به نظر می رسد. مطالعات ارتباط بین مقاومت و ویرولانس را با یک الگو از مدل داروینی نشان می دهد. در این مطالعات سویه هایی که یک مزیت خاص را دارند انتخاب می شوند و نتایج آنها تثبیت می شوند مثلا افزایش مقاومت به همراه افزایش ویرولانس خیلی سریع انتخاب خواهد شد. آن انتخاب هایی که ظاهرا بصورت منفی معنا می شوند مقاومت را با کاهش ویرولانس تحت یک پروسه انتخابی طولانی افزایش می دهد تا زمانی که یک مزیت ویرولانس خاص انتخاب شود در جمعیت نتایج آن دیده و تثبیت شود.بنابراین ما احساس می کنیم که مقاومت آنتی بیوتیکی، مکانیسم ویرولانس و ارتباط آن ها با انواع عفونت ها را مطالعه کنیم. هدف اصلی این مطالعه بررسی حضور مقاومت آنتی بیوتیکی بخصوص کارباپنمازها و ژن های ویرولانس در ایزوله های بالینی کلبسیلا پنومونیه از منابع مختلف بالینی است. |
| اهداف اختصاصی | <ol>
<li dir="RTL" style="text-align:justify"><span style="font-size:14.0pt"><span style="font-family:"B Nazanin"">شناسایی ایزوله های بالینی <em>کلبسیلا پنومونیه</em> با روش های فنوتیپی و ژنوتیپی، </span></span><span style="font-size:14.0pt"><span style="font-family:"B Nazanin"">ارزیابی حساسیت آنتی بیوتیکی باکتری ها به روش </span></span><span dir="LTR" style="font-size:14.0pt">Disc diffiusion agar</span><span style="font-size:14.0pt"><span style="font-family:"B Nazanin""> و تعیین فراوانی سروتیپ های کپسولی باکتری توسط </span></span><span dir="LTR" style="font-size:14.0pt">Multiplex PCR</span><span style="font-size:14.0pt"><span style="font-family:"B Nazanin"">.</span></span></li>
</ol>
<p dir="RTL" style="margin-left:0cm; margin-right:25.1pt; text-align:justify"> </p>-<p><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:14.0pt"><span style="font-family:"B Nazanin"">غربال گری ایزوله های <em>کلبسیلا پنومونیه</em> از نظر حضور ژن های کارباپنماز </span></span><em><span style="font-size:14.0pt"><span style="font-family:"Times New Roman","serif""> bla<sub>NDM−1</sub>, bla</span></span></em><sub><span style="font-size:14.0pt"><span style="font-family:"Times New Roman","serif"">KPC</span></span></sub><em><span style="font-size:14.0pt"><span style="font-family:"Times New Roman","serif"">, bla<sub>VIM</sub>, bla<sub>IMP</sub>, </span></span></em><span style="font-size:14.0pt"><span style="font-family:"Times New Roman","serif"">,<em>bla<sub>OXA−48</sub></em></span></span></p>- تعیین فراوانی ژن های ویرولانس magA- k2A- rmpA- wabG- uge- allS- fimH- mrkD- wcaG- kpn- ycfM- entB- iutA- iroN- hly- cnf-l در ایزوله ها به روش Multiplex PCR . -ارزیابی ارتباط بین مقاومت دارویی و 16 فاکتور ویرولانس ایزو له ها با انواع عفونت های ایجاد شده. |
| چکیده انگلیسی طرح | نمونه های کلبسیلا پنمونیه بیماران سرپایی و بستری شده از بیمارستان آموزشی و درمانی سینا تبریز به آزمایشگاه میکروب شناسی دانشکده پزشکی منتقل شده و در محیط های مربوطه کشت داده می شود. جهت شناسایی و تعیین هویت ایزوله های کلبسیلا پنومونیه از تست های استاندارد بیوشیمیایی استفاده می شود. پس از تایید، نمونه ها در لوله های حاوی محیط trypticase soy broth به همراه20% گلیسرول کشت شده و در دمای C °20- برای بررسی های بعدی ذخیره می شوند.در ادامه حساسیت به آنتی بیوتیکی ایزوله ها با روش Kirby – Bauer تعیین خواهد شد. پس از استخراج DNA ژنومی باکتری های جدا شده، با استفاده از پرایمرهای اختصاصی و روش های مولکولی برخی از ویژگی ها مثل تیپ های کپسولی، چند فاکتور ویرولانس و حضور ژن های کارباپنماز در باکتری ها مورد مطالعه قرار خواهند گرفت. پس از انجام PCR محصول های واکنش بر روی ژل آگارز الکتروفورز شده و به کمکSyber safe stain رنگ آمیزی و بررسی خواهند شد در نهایت داده های به دست آمده توسط نرم افزار SPSS19 و روش های آماری کیفی (درصد و فراوانی) تجزیه و تحلیل شده و ارتباط بین مقاومت آنتی بیوتیکی و فاکتورهای ویرولانس ایزوله ها با انواع عفونت های بالینی بررسی خواهند شد. |
| کلمات کلیدی | Klebsiella pneumonia: باکتری گرم منفی، غیرمتحرک ، دارای کپسول، تخمیرکننده لاکتوز، بیهوازی اختیاریو استوانه ای شکل است. مقاومت دارویی: عدم پاسخ به درمان آنتی بیوتیکی باکتری های بیماریزا و بالقوه بیماریزا که با جهش ژنی(موتاسیون) یا سایر مکانیسم ها نسبت به این داروها مقاوم شدند و نسلهای جدیدی از باکتری ها به وجود آیند، که نتوان با آنها مبارزه کرد. از مهمترین عوامل این نوع مقاومت های دارویی،تغییرات ژنوتیپی و فنوتیپی باکتری، مقاومت ذاتی باکتری، مصرف خودسرانه و یا بیش از حد آنتی بیوتیکهاست،که باکتری ها فرصت تطابق یابند. MDR: سویه ای از باکتری که به سه یا بیش از سه گروه مجزا ازآنتی بیوتیکها مقاوم می باشد. کارباپنم:خانواده ای از آنتی بیوتیک های بتالاکتام است که برای درمان عفونت های شدید کاربرد دارند. کارباپنماز: گروهی از آنزیم های تولید شده توسط باکتری ها می باشند که آنتی بیوتیک های بتالاکتام از جمله آنتی بیوتیک های گروه کارباپنم را غیر فعال می کنند وبا واسطه ی پلاسمید بین باکتری های گرم منفی انتشار می یابد کارباپنماز ها چهار نوع هستند. IMP: جز خانواده متالوبتالاکتمازها می باشد و عضو گروه B آمبلر می باشد. VIM: جز خانواده متالوبتالاکتمازها می باشد و عضو گروه B آمبلر می باشد. KPC: کارباپنمازهای تولید شده توسط باکتری کلبسیلا پنومونیه می باشد. NDM: جز خانواده متالوبتالاکتامازها می باشد و عضو گروه B آمبلر می باشد. OXA-48وOXA-181: جز خانواده متالوبتالاکتمازها می باشد و عضو گروهD آمبلر می باشد. پلاسمید:مولکول DNA کوچکی است که بطور مجزا از کروموزوم در سلول وجود دارد، و تکثیر می یابد و حامل ژنهای مقاومت دارویی، فاکتورهای ویرولانس و سایر ژن های کمکی برای باکتری است. MDR: سویه ای از باکتری که به دو گروه مجزای آنتی بیوتیکی مقاوم است. Invitro: شرایط آزمایشگاهی جهت انجام کارهای تحقیقایی را شامل می شود. فاکتورهای ویرولانس: شدت و قدرت تهاجمی یک عامل عفونی بیماریزا را میزان ویرولانس آن گویند و فاکتورهای ویرولانس در واقع ژن های موجود در ژنوم باکتریایی هستند که با تولید پروتئین های مهم بیماری زا به بافت میزبان حمله کرده و مستقر می گردند. |
| ذینفعان نتایج طرح | کسب نتایج حاصله از این طرح ، میتواند در اطلاع رسانی در برنامه ریزی کشوری در گروه های مختلف ذیل موثر باشد: 1)شرکت های دارویی 2)معاونت غذا و دارویی وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی 3)معاونت غذا و دارویی دانشگاه های علوم پزشکی کشور 4)پزشکان و متخصصان دارویی جهت انتخاب صحیح دارو برای درمان عفونت های مقاوم دارویی 6)بیماران و جامعه جهت آگاهی بخشی از مقاومت های آنتی بیوتیکی و نحوه صحیح مصرف داروها برای پیشگیری از مقاومت های دارویی و کاهش هزینه های درمانی. |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| آلکا حسنی | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| محمد آهنگرزاده رضایی | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| طاهره پیرزاده | مشاور |
| مهین آهنگر اسکوئی | مشاور |
| اکبر حسنی | مشاور |
| القار سلطانی | دانشجوی مالک پایان نامه |
| پوریا قلیزاده | دانشجوی مالک پایان نامه |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر انواع خاصی از باکتری کلبسیلا پنومونیه با عفونت سوختگی و عفونت ریوی مرتبط هست.متن خبر کلبسیلا پنومونیه نوعی باکتری می باشد که در بدن انسان در ناحیه روده مستقر هستند، این باکتری همچنین در خاک، آب، گیاهان و حیوانات یافت می شوند. این باکتری در بدن انسان عفونت های مختلفی ایجاد می کند که شامل عفونت های مجاری ادراری، عفونت های جریان خون، پنومونی (عفونت ریه)، عفونت های داخل حفره شکمی و عفونت های زخم می باشد. در این مطالعه، باکتری کلبسیلا پنومونیه از انواع نمونه بالینی (ادرار، خون، زخم و ...) بیماران جدا گشت و ویژگی ها و خصوصیات مختلف این باکتری و همچنین نوع مقاومتی که نسبت به آنتی بیوتیک های مختلف ایجاد می کردند، مورد بررسی قرار گرفت. بیماران سوخته و بیماران با عفونت ریوی با نوع خاصی از باکتری کلبسیلا پنومونیه ارتباط دارند. در نهایت این مطالعه در انتخاب داروی مناسب جهت تجویز به افراد مبتلا به این نوع عفونت کمک خواهد کرد. |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر سروتیپ K20 با عفونت سوختگی و سروتیپ K54 با عفونت ریوی ارتباط دارد.متن خبر در این مطالعه، ایزوله هایی با سروتیپ K20، ژن کارباپنماز blaOXA-48 و با الگوی ویرولانس rmpA، iutA و kpn از نمونه زخم افراد دچار سوختگی جدا شدند و این سروتیپ نسبت به آنتی بیوتیک های خانواده آمینوگلیکوزید مقاوم بود. هم چنین فاکتورهای ویرولانس rmpA، iutA و kpn با ایزوله های ESBL در ارتباط می باشند. از طرفی سروتیپ کپسولی K54 و فاکتور ویرولانس wcaG بیشتر از نمونه افراد مبتلا به عفونت های ریوی جدا گشتند که سروتیپ K54با مقاومت سیپروفلوکساسین و ژن ویرولانس wcaG با ایزوله های MDR در ارتباط می باشند. مطالعه حاضر در بررسی اپیدمیولوژیکی، انتخاب درمان مناسب برای افراد دچار سوختگی و بیماران مبتلا به عفونت های ریوی در شهر تبریز مفید می باشد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
