طراحی، مدل سازی بیوانفورماتیکی، کلونینگ و بیان پپتیدهای غنی از دی سولفید مهار کننده VEGF
Bioinformatic modeling, cloning and expression of Anti-VEGF disulfid –rich peptide
مجریان: صفر فرج نیا , ابوالفضل برزگر
خلاصه روش اجرا: هدف طرح حاضرعبارتست از طراحی، مدل سازی بیوانفورماتیکی، کلونینگ و بیان مهارکننده مسیر انژیوژنز مبتنی بر پپتیدهای غنی از دی سولفید. فاکتور رشد اندوتلیال عروق (VEGF-A) از طریق فعال کردن مسیر پیامرسانی MAPK و PI3K افزایش بقا و تکثیر سلولهای توموری را پیش میبرند. مهار VEGF-A می تواند منجر به کاهش جوانه آنژیوژنز و عروق توموری گردد.پپتیدها ازجمله کاندیدهای مناسب برای مهار آنژیوژنز از طریق بلاک VEGF-A می باشند اما اغلب مهارکننده پپتیدی ثبات کمی دارد، یکی از استراتژیها جهت غلبه بر این محدودیت ، تولید آنها بصورت پیوند با پپتیدهای غنی از دی سولفید می باشد. در این مطالعه با استفاده ازنرم افزارهای متعدد بیو انفورماتیکی مهارکننده پپتیدی VEGF-A با معیارهای مناسب طراحی و به صورت پیوند شده با پپتیدهای غنی از دی سولفید تولید می شوند. برای این منظور سازه ژنی مربوطه طراحی و کلونینگ و بیان مهارکننده پپتیدی طراحی شده و پس از سابکلون در وکتور بیانی در میزبان باکتریایی تولید و تخلیص خواهند شد. در نهایت فعالیت پپتید های تولید شده بر روی سل لاین عروقی بیان کننده VEGF-R ارزیابی خواهد شد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 58656 |
| عنوان فارسی طرح | طراحی، مدل سازی بیوانفورماتیکی، کلونینگ و بیان پپتیدهای غنی از دی سولفید مهار کننده VEGF |
| عنوان لاتین طرح | Bioinformatic modeling, cloning and expression of Anti-VEGF disulfid –rich peptide |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | آنتی بادی های مونوکلونال و پروتئین های نوترکیب (از نظر: الف- جنبه های تولیدی و 2- پروتکل های درمانی) |
| نوع مطالعه | مطالعات علوم پایه (Experimental) |
| تحقیق در نظام سلامت | خیر |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | دکتری تخصصی PhD |
| مدت اجرا - ماه | 24 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | با توجه به نقش VEGF-A در سرطان های مختلف و نیاز کشور برای درمان و تشخیص های پاراکلینیکی این بیماری ها که طبق اسناد وزارت بهداشت و درمان، سالانه بالغ بر میلیون ها دلار، صرف خرید آنتی بادی های مونوکلونال از خارج از کشور می شود، بر آن شدیم با استفاده از مهارکننده پپتیدی مسیر انژیوژنز مبتنی بر پپتیدهای غنی از دی سولفید، رگزایی و رشد تومور را کاهش دهیم. هدف از این پروپوزال طراحی، مدل سازی بیوانفورماتیکی، کلونینگ و بیان مهارکننده مسیر انژیوژنز مبتنی بر پپتیدهای غنی از دی سولفید است. |
| اهداف اختصاصی | <p><span dir="RTL" lang="AR-YE" style="font-family:"Times New Roman",serif; font-size:14.0pt">طراحی و ساخت کنستراکت مهارکننده پپتیدی ضد </span><span style="font-family:"Times New Roman",serif; font-size:14.0pt">VEGF-A<span dir="RTL" lang="AR-YE"> متصل به پپتیدهای غنی از دی سولفید</span></span></p>-<p dir="RTL"><span style="font-size:12.0pt">کلونینگ و بیان پپتید طراحی شده به همراه </span><span style="font-size:12.0pt">پپتید </span><span style="font-size:12.0pt">غنی از دی سولفید </span><span style="font-size:12.0pt">در سیستم بیان </span><span dir="LTR" style="font-size:12.0pt">E. coli </span><span style="font-size:12.0pt"> و تخلیص آن</span></p>-<p><span dir="RTL" lang="AR-YE" style="font-family:"Times New Roman",serif; font-size:14.0pt">بررسی اتصال مهارکننده به </span><span style="font-family:"Times New Roman",serif; font-size:14.0pt">VEGF-A<span dir="RTL"> </span></span><span dir="RTL" lang="FA" style="font-family:"Times New Roman",serif; font-size:14.0pt">با استفاده</span><span style="font-family:"Times New Roman",serif; font-size:14.0pt"> <span dir="RTL">از تکنیک الایزا یا مدل سیستم</span> <span dir="RTL"> </span></span><span style="font-family:"Times New Roman",serif; font-size:14.0pt">Surface plasmon resonance (SPR)</span></p>-<p><span dir="RTL" lang="FA" style="color:black; font-family:"Times New Roman",serif; font-size:14.0pt">ارزیابی سمیت سلولی پپتید بیان شده به روش </span><span style="color:black; font-family:"Times New Roman",serif; font-size:14.0pt">MTT</span></p> |
| چکیده انگلیسی طرح | Bioinformatic modeling, cloning and expression of Anti-VEGF disulfid –rich peptide Bioinformatic modeling, cloning and expression of Anti-VEGF disulfid –rich peptide |
| کلمات کلیدی | آنژیوژنز: آنژیوژنز فرایندی چندمرحله ای و شامل مهاجرت و تکثیر سلو لهای آندوتلیال و سازمان یابی توده های سلولی به شکل ساختارهای لوله مانند، اتصال ساختارهای لوله مانند به همدیگر و در نهایت بلوغ و تشکیل عروق پایدار است. vascular endothelial Growth factor) VEGF): از مهم ترین تنظیم کننده های اختصاصی آنژیوژنز است. خانوادة فاکتور های رشد آندوتلیال عروقی شامل گلیکوپروتئین های ترشحی به نام های VEGF-F ،VEGF-E ، VEGF-D ،VEGF-C ،VEGF-B ، VEGF-Aو فاکتور رشد جفتی (Placenta Growth factor : PIGF) است. vascular endothelial Growth factor reseptor) VEGFR) VEGF : عمل زیستی خود را روی سلو لهای هدف از طریق میانکنش با گیرنده های تیروزین کینازی موجود در غشای پلاسمایی سلول به انجام می رسانند که عبارتنداز (vascular endothelial Growth factor receptor-1) VEGFR-1، VEGFR-2، VEGFR-3و نوروپیلین ها. |
| ذینفعان نتایج طرح | بیماران ، مراکز تحقیقاتی و درمانی |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| صفر فرج نیا | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| ابوالفضل برزگر | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| بابک نگاهداری | مشاور |
| سمانه قاسمعلی | دانشجوی مالک پایان نامه |
| علی اعتمادی | همکار اصلی |
| داوود ربیعی | همکار اصلی |
| محمد رحمتی | مشاور |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر عنوان خبر: پپتید طراحی شده(Pep1) قادر به مهار آبشار پیام رسانی VEGF/VEGFR در سلولهای سرطانی است.متن خبر مسیر پیام رسانی گیرنده فاکتور رشد اندوتلیال عروقی (VEGFR) یک تنظیم کننده مهم تکثیر، تمایز،
بقای سلولی و همچنین توسعه سرطان در انسان است. فاکتور رشد اندوتلیال عروقی (VEGF) یک
لیگاند با میل ترکیبی بالا برای VEGFR است و نشان داده شده است که با مهار برهمکنش های
VEGF/VEGFR می توان از پیشرفت تومور جلوگیری کرد. در این مطالعه، کتابخانه ای از پپتیدهای
ضد VEGF که مناطق اتصال VEGFR بر روی VEGF را هدف قرار می دهند، طراحی شد. از بین
پپتید های مشتق شده از VEGFR2(PepA، SFTI-1- PepA-L1 و Pep1)، Pep1 با بهترین نتیجه
ELISA و بالاترین واکنشپذیری با VEGF برای تجزیهوتحلیل بیشتر در شرایط آزمایشگاهی انتخاب
شد. تجزیهوتحلیل وسترن بلات واکنش خاص پپتید انتخاب شده با VEGF را تائید کرد. سنجش MTT
اثر بازدارندگی رشد پپتید را بر سلولهای اندوتلیال ورید ناف انسان با مقدار IC50 363.5
میکرومولار نشان داد. یافتههای این مطالعه بینشهای جدیدی را برای توسعه درمانهای مبتنی بر پپتید
برای مهار آبشار پیام رسانی VEGFR در سلولهای سرطانی پیشنهاد کرد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
