نقش متیلاسیون پروموتور و سطح بیان ژنهای VDR و TNF آلفا به عنوان بیو مارکر در تشخیص بیماری بهجت
VDR and TNF-α promoter rmethylation and expression level in patients with Behcet’s Disease can act as diagnostic biomarkers
مجریان: محمد نوری , ابراهیم سخی نیا
خلاصه روش اجرا: از 40 بیماران مراجعه کننده به کلینیک روماتولوژی که بیماری بهجت در آنها توسط متخصص روماتولوژی محرز گردیده است، نمونه خون گرفته ، DNA و RNA نمونه¬ها بر اساس پروتکل استخراج می¬شود. برای اندازه¬گیری سطح متیلاسیون ژن¬ها از تکنیک MeDIP-qPCR استفاده می¬شود. در این روش DNA استخراج شده توسط دستگاه سونیکاسیون به قطعات200 تا 1000bp تبدیل شده و سپس قطعات DNA متیله با استفاده از آنتی بادی ضد 5- متیل سیتوزین رسوب داده می¬شوند و برای تشخیص سطح متیلاسیون پروموتر ژنها از تکنیک Real-time PCR استفاده خواهد شد. همین فرایند در گروه کنترل انجام خواهد شد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا |
| کد طرح | 57694 |
| عنوان فارسی طرح | نقش متیلاسیون پروموتور و سطح بیان ژنهای VDR و TNF آلفا به عنوان بیو مارکر در تشخیص بیماری بهجت |
| عنوان لاتین طرح | VDR and TNF-α promoter rmethylation and expression level in patients with Behcet’s Disease can act as diagnostic biomarkers |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | بیماری های اتوایمیون (آرتریت روماتوئید و لوپوس اریتماتوز سیستمیک) |
| نوع مطالعه | مطالعه مورد/شاهد ( Case - Control ) |
| تحقیق در نظام سلامت | بلی |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | دکتری تخصصی PhD |
| مدت اجرا - ماه | 15 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | نقش عوامل ژنتیک و اپی¬ژنتیک در پاتوژنز بیماری¬های خود¬ ایمنی و استفاده از مارکرهای ژنتیکی در تشخیص و درمان بیماری بهجت با توجه به نقش اثبات شده ژن¬ ها یTNF آلفا و VDR در بیماری¬های روماتولوژیک و بهجت و عدم مطالعه بر روی اپی¬ژنتیک ناحیه پروموتری این¬ ژن ها و شیوع بالای بیماری بهجت در ایران و نقش مهم ویتامین D وTNF آلفا در پاسخ¬های اتوایمیون ما را بر آن داشت که الگوی متیلاسیون پروموتر این ژن¬ ها را در بیماران بهجتی مورد ارزیابی قرار دهیم. |
| اهداف اختصاصی | <ul style="list-style-type:circle"> <li dir="RTL">تعیین میزان متیلاسیون پروموتر ژن <span dir="LTR">VDR</span> در افراد مبتلا به بیماری بهجت و مقایسه آن با گروه کنترل</li> </ul> <p dir="RTL" style="margin-right:85.0pt"> </p>-<ul style="list-style-type:circle"> <li dir="RTL">اندازه گیری سطح بیان ژن<span dir="LTR">VDR</span> در بیماران مبتلا به بهجت و مقایسه این الگو با گروه کنترل</li> </ul>-<p dir="RTL" style="margin-right:18.0pt">تعیین میزان متیلاسیون پروموتر ژن <span dir="LTR">TNF-α</span>در افراد مبتلا به بیماری بهجت و مقایسه آن با گروه کنترل</p>-<p><span dir="RTL">اندازه گیری سطح بیان ژن</span> TNF-α <span dir="RTL">در بیماران مبتلا به بهجت و مقایسه این الگو با گروه کنترل</span> </p>-<ul style="list-style-type:circle"> <li dir="RTL">تعیین ارتباط بین میزان متیلاسیون و بیان ژن <span dir="LTR">VDR </span> و <span dir="LTR">TNF</span> آلفا</li> </ul> |
| چکیده انگلیسی طرح | .از 40 بیماران مراجعه کننده به کلینیک روماتولوژی که بیماری بهجت در آنها توسط متخصص روماتولوژی محرز گردیده است، نمونه خون گرفته ، DNA و RNA نمونه¬ها بر اساس پروتکل استخراج می¬شود. برای اندازه¬گیری سطح متیلاسیون ژن¬ها از تکنیک MeDIP-qPCR استفاده می¬شود. در این روش DNA استخراج شده توسط دستگاه سونیکاسیون به قطعات200 تا 1000bp تبدیل شده و سپس قطعات DNA متیله با استفاده از آنتی بادی ضد 5- متیل سیتوزین رسوب داده می¬شوند و برای تشخیص سطح متیلاسیون پروموتر ژنها از تکنیک Real-time PCR استفاده خواهد شد. همین فرایند در گروه کنترل انجام خواهد شد. |
| کلمات کلیدی | بیماری بهجت: از جمله بیماری¬های روماتولوژیک می¬باشد که با آفتهای عود کننده دهانی، زخمهای چشم، زخم های تناسلی، و ضایعات پوستی مشخص می گردد. هنوز علت و پاتولوژی بیماری بهجت بطور کامل مشخص نشده است. اپی¬ژنتیک: به تغییرات قابل توراث در بیان ژن گفته می¬شود که بدون تغییر توالی DNA ژنومی اتفاق می¬افتد. این تغییرات یا در DNA کروموزومی و یا در پروتئین¬هایی که به طور مستقیم به DNA کروموزومی متصل هستند صورت می¬گیرد. یکی از بیومارکرهای اپی¬ژنتیکی، متیلاسیون DNA است. MeDIP : (methylated DNA immunoprecipitation) از انواع تکنیک¬های تشخیصی میزان متیلاسیون در کل یا جزئی از ژنوم می¬باشد. در این تکنیک به دنبال استخراج DNA، در ابتدا ژنوم توسط دستگاه سونیکاتور قطعه قطعه شده، سپس توسط بافرهای داخل کیت دناچوره شده، به دنبال آن رسوبگذاری ایمنی توسط آنتی¬بادی علیه 5-متیل سیتوزین انجام شده و در نهایت میزان متیلاسیون DNA توسط تکنیک¬های مختلف مانند qPCR برای قسمتی از ژن و micro-array برای کل ژنوم مورد سنجش قرار می¬گیرند. |
| ذینفعان نتایج طرح | از نتایج این طرح در درجه اول بیماران سود خواهند برد. با توجه به اینکه در درمان بیماری بهجت از داروهای ضد TNF-α و مشتقات ویتامین D استفاده می شود، صنعت نیز می¬تواند از نتایج آن سود ببرد. |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| محمد نوری | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
| ابراهیم سخی نیا | استاد راهنما دوم (آموزشی ) |
| علیرضا خبازی اسکویی | مشاور |
| زهره بابالو | مشاور |
| یوسف رسمی | همکار اصلی |
| سام صیدی شیروانی | دانشجوی مالک پایان نامه |
| جعفر فرهادی | همکار اصلی |
| شهریار علیپور | همکار اصلی |
| غلامرضا جدیداسلام | همکار اصلی |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر متن خبر |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر کاهش بیان ژن گیرنده ویتامین د در بیماری بهجت ناشی از تغییر متیلاسیون DNA ژن مربوطه نبود.متن خبر در یک مطالعه مقطعی 48 بیمار مبتلا به بهجت و 60 فرد سالم سطح بیان ژن گیرنده ویتامین د و میزان متیلاسیون پروموتور آن با MeDIP‐quantitative polymerase chain reaction و real‐time PCR ارزیابی شد. سطح بیان ژن رسپتور ویتامین د بصورت معنی دار کاهش یافته بود. ولی تفاوت معنی داری در میزان متیلاسون پروموتور زسپتور ویتامین د مشاهده نشد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر کاهش بیان ژن گیرنده ویتامین د در بیماری بهجت ناشی از تغییر متیلاسیون DNA ژن مربوطه نبود.متن خبر در یک مطالعه مقطعی 48 بیمار مبتلا به بهجت و 60 فرد سالم سطح بیان ژن گیرنده ویتامین د و میزان متیلاسیون پروموتور آن با MeDIP‐quantitative polymerase chain reaction و real‐time PCR ارزیابی شد. سطح بیان ژن رسپتور ویتامین د بصورت معنی دار کاهش یافته بود. ولی تفاوت معنی داری در میزان متیلاسون پروموتور زسپتور ویتامین د مشاهده نشد. |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
