شناسایی ترکیب های جدید علیه گیرنده هیستامین H3 با استفاده از روش های مدل بندی مولکولی، غربالگری مجازی و شبیه سازی دینامیک مولکولی و بررسی اثرات بیولوژیکی آنها
Identification of novel ligand(s) against histamine H3 receptors using molecular modelling, virtual screening and molecular dynamics simulation studies and investigation of their biological effects
مجریان: مریم حمزه میوه رود
خلاصه روش اجرا: ابتدا ساختارگیرنده H3 هیستامین تعیین شده سپس براساس فارماکوفور مربوطه ، غربالگری مجازی کتابخانه ترکیبات مختلف با استفاده از الگوریتم های مختلف مبتنی بر داکینگ انجام خواهد شد در ادامه ، داکینگ ترکیبات فیلتر شده توسط روش های مختلف، بروی مدل بدست آمده از گیرنده H3 انجام شده و براساس تمایل اتصال به گیرنده هیستامین و یا سیستم امتیاز دهی نرم افزار، از بین آنها بهترین و مناسب ترین ترکیب یا ترکیبات انتخاب می شوند. مرحله بعد شامل انجام تست های بیولوژیکی خواهد بود به این ترتیب که رده سلولی CHO-K1 توسط وکتور بیانی گیرنده H3 ترنسفکت می شود وسپس در مجاورت ترکیبات انتخاب شده ، براساس مکانیسم عمل گیرنده ، عملکرد اگونیستی یا آنتاگونیستی ترکیبات مورد ارزیابی قرار می گیرد.
اطلاعات کلی طرح 
| مرحله جاری طرح | خاتمه قرارداد و اجرا در دانشکده/مرکز |
| کد طرح | 57572 |
| عنوان فارسی طرح | شناسایی ترکیب های جدید علیه گیرنده هیستامین H3 با استفاده از روش های مدل بندی مولکولی، غربالگری مجازی و شبیه سازی دینامیک مولکولی و بررسی اثرات بیولوژیکی آنها |
| عنوان لاتین طرح | Identification of novel ligand(s) against histamine H3 receptors using molecular modelling, virtual screening and molecular dynamics simulation studies and investigation of their biological effects |
| نوع طرح | طرح - پایان نامه |
| اولویت طرح | طراحی، سنتز، آنالیز و کنترل داروها در بیماریهای قلبی و عروقی، التهابی، سرطانی، نورو دژنراتیو، متابولیک و عفونی |
| نوع مطالعه | مطالعات علوم پایه (Experimental) |
| تحقیق در نظام سلامت | خیر |
| آیا طرح پایاننامه دانشجویی است؟ | بله |
| مقطع پایان نامه | دکتری تخصصی PhD |
| مدت اجرا - ماه | 24 |
| نوآوری و ضرورت انجام تحقیق | معرفی روش غربالگری مجازی جهت شناسایی ترکیبات جدیدی که برهمکنش های موثر با گیرنده هیستامیH3 دارند و بعنوان آگونیست یا آنتاگونیست عمل میکنند . |
| اهداف اختصاصی | <p dir="RTL" style="margin-right:.75in"><strong>مدل بندی مولکولی ساختار گیرنده </strong><strong><span dir="LTR">H3</span></strong></p>-<p dir="RTL">غربالگری مجازی کتابخانه های ترکیبات علیه گیرنده <span dir="LTR">H3</span> ، داکینگ مولکولی ترکیبات شناسایی شده و شبیه سازی دینامیک مولکولی لیگاند – گیرنده</p>-<p>تهیه رده سلولی بیان کننده گیرنده H3 به صورت پایدار</p>-<p dir="RTL">ارزیابی بیولوژیکی ترکیبات شناسایی شده با استفاده از سنجش میزان <span dir="LTR">cAMP</span></p> |
| چکیده انگلیسی طرح | First, the structure of the histamine H3 receptor is determined, then, based on the relevant pharmacophore, a virtual screening of the library of different compounds will be performed using different docking-based algorithms. Next, the docking of the filtered compounds by different methods is performed on the model obtained from the H3 receptor, and based on the binding affinity to the histamine receptor or the software scoring system, the best and most suitable compound or compounds are selected from them. The next step will include performing biological tests in such a way that the CHO-K1 cell line is transfected with the H3 receptor expression vector, and then, in the vicinity of the selected compounds, based on the receptor mechanism of action, the agonistic or antagonistic function of the compounds is evaluated. ارسال بازخورد پانلهای کناری سابقه ذخیرهشدهها |
| کلمات کلیدی | Virtual screening: غربالگری مجازی: شناسایی ترکیبات اختصاصی علیه گیرنده اختصاصی با استفاده از روش های محاسباتی Molecular dynamics simulation: شبیه سازی دینامیک مولکولی: شبیه سازی رفتار مولکولی لیگاند با گیرنده مربوطه در طول زمان Docking: داکینگ (انطباق مولکولی): پیش بینی برهمکنش گیرنده با رسپتور توسط روش های محاسباتی Transfection: ترنسفکشن : انتقال نوکلئیک اسید به داخل سلول های یوکاریوتی |
| ذینفعان نتایج طرح |
اطلاعات مجری و همکاران
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح |
|---|---|
| سیاوش دستمالچی | مشاور |
| نکیسا قمری | دانشجوی مالک پایان نامه |
| مریم حمزه میوه رود | استاد راهنمای اول (آموزشی ) |
اطلاعات تفضیلی
| حوزه خبر | خبر |
|---|---|
| رسانه ها و مردم | عنوان خبر شناسایی ترکیبات جدید برای گیرنده های سوم هیستامین درگیر در بیماریهای عصبیمتن خبر گیرنده های سوم هیستامین در مغز به فراوانی یافت میشوند و بلوکه کردن آنها اثرات سودمندی در بیماریهای عصبی دارد. در این مطالعه ترکیبات جدید برای گیرنده های سوم هیستامین با استفاده از روش های کامپیوتری شناسایی گردید و آزمایشات تجربی بر روی ترکیبات شناسایی شده نشان داد که این ترکیبات دارای اثرات بلوکه کنندگی بر روی آنها میباشد. این ترکیبات میتوانند در بیماری های عصبی مطرح شوند و مورد آزمایشات بیشتر واقع گردند. |
| متخصصان و پژوهشگران | عنوان خبر شناسایی ترکیب های جدید علیه گیرنده هیستامین H3 با استفاده از روشهای محاسباتیمتن خبر ترکیبات جدید علیه گیرنده هیستامین H3 با استفاده از روش های مدل بندی مولکولی، غربالگری مجازی و شبیه سازی دینامیک مولکولی شناسایی گردید و اثرات بیولوژیکی آنها با استفاده از تست های مختلف ارزیابی گردید. نتایج نشان داد ترکیبات شناسایی شده دارای اثرات مهاری بر روی گیرنده هیستامین H3 میباشد. |
| سیاستگذاران درمانی | عنوان خبر متن خبر |
| سیاستگذاران پژوهشی | عنوان خبر متن خبر |
| لینک (URL) مقاله انگلیسی مرتبط منتشر شده 1 |
